全县多年平均降水量为1188.1毫米。地表径流总量50％，保证率为10.4亿立方米，人均拥有1000立方米，低于全国(人均2700立方米)全省(人均1400立方米)水平；75％保证率约6.3亿立方米，90％保证率约4.6亿立方米，95％保证率约3.8亿立方米。径流量约占降水量的38.3％，径流资源分布不均，丰枯年际、年内变化较大，可利用的地表水只有38％左右。地表水在天然状态下，水质良好，适宜于工农业生产用水及生活饮用，但须对水质污染源、环境保护、植物保护实行综合治理。
〔河流〕
本县主要河流有杭埠河、县河、白石天河、塘串河、兆河、西河、马槽河、金牛河、罗埠河、瓦洋河、黄泥河、罗昌河、柯坦河、界河等14条。其中境北杭埠河、境东兆河、境南界河为跨县界河。山涧小河随地形分布如枝，分别注入巢湖、白湖、黄陂湖及枞阳县境的白荡湖、菜子湖等水系而入江。
一、北部入巢湖诸水
1、杭埠河位于县境北界，跨庐江、舒城、肥西三县界。发源于大别山区岳西县主簿园。由舒城县杭埠镇西南入本县。从西向东经广寒桥北、肥西三河镇南、庐江同大圩之北的新河入巢湖。全长139公里，沿庐江县境23公里。其支流马槽河，源出大小马槽山，原河道北流经汤池入郭子河，再经周墩至小河口转向东入牛首河，尔后入白石天河；1977年规划“引马入杭”，1984年施工，将郭子河从周墩经王家小岗至罗庄，以锐角交“杭”，开辟一条新河(现统称马槽河)，长2.8公里，北流入杭埠河。
2、白石天河位于县北、杭埠河之南，由西向东流。河分三段，有三名：由小河口至下马渡名牛首河，下马渡至白山镇名白石天河，白山镇以下名白山大河，由白山大河口门流入巢湖。此河集金牛河、罗埠河、会市河之水，流域面积718平方公里，是庐江县河流之最。此河上游支流金牛河源出平顶山、鸭池山；此河之上段又有龙潭河(双河)，向北流经梁山尾，在回龙桥汇入金牛河，金牛河北流，在湖稍圩流入牛首河、白石天河；金牛河自梁山尾下的回龙桥至湖稍圩长8.5公里，流域面积125.4平方公里。罗埠河主流源出鸭池山东麓的杨家山，其上段支流有蒋家河，下段支流有新桥河、板桥河(戴桥河)，均源出冶父山、高头山，北流入罗埠河；罗埠河北流经天河坝、南板桥，过罗埠镇西，至向入白石天河，全长27公里，流域面积211.6平方公里。会市河源出梁山、郭河丘陵区，北流汇入牛首河。白石天河的支流小南河，全长14.5公里，原与杭埠河相通，1976年12月治理杭埠河时将上游王四六渡和南河出口处封堵，成为内河和水产养殖场。白石天河的白山至金牛一线无名河流颇多，流域较广。
3、塘串兆河位于县东北，流向由南向北，是沟通黄陂湖、白湖、巢湖的枢纽水道。河分三段：由缺口大桥下至白湖一段叫塘串河(原名大缺口、麻线河、荒草沟、塘缺河)约5公里；塘串河至姥山颈一段叫新河(系白湖垦殖后新开河)，纵穿白湖农场，长15公里；自姥山颈至马尾河口一段叫兆河(原名皂河，系人工河)，长12公里，是庐江与巢县的分界线。支流长河(又名盛桥河)，源出二蛟子山，由西向东经盛桥镇入兆河，长21.5公里，集流面积85平方公里。顺港河源出东顾山东麓，过蜃山经董湾入新河，长11公里。白湖的东环圩河环绕东大圩，南北两端分别与新河相汇，长21.3公里；西环圩河环绕西大圩，南北两端分别与新河相汇，长23公里。东西环圩河，既是泄洪道、航运线，又是白湖农场与周围县的界河。
4、谷胜河横穿许桥乡境，源出牌楼附近的无名山，系一独立小河，由西南向东北流入巢湖，全长8公里。
二、中部入黄陂湖水系
1、县河源出境西郎家山、鸭池山，经西门刘桥、柏家井、通过南门大桥，集青龙、福泉(一部分)、凤台和冶父山、东顾山之水东流至八字口入黄陂湖，长10.1公里，流域面积163平方公里。其上游北侧文昌河源出冶父山，经庐城东侧南流入县河。窑埠河源出郎家山，东流至刘桥上入县河(1970年改道已不经绣溪河)。
2、黄泥河位于境南，发源于张院水库，汇黄家大山北麓诸涧之水北流，经泥河镇，在张圩附近入黄陂湖，全长27公里，流域面积194.6平方公里。黄泥河最大的支流——沙溪河源出石牛山、平顶山，经沙溪乡抵濠峰山下至三叉河汇黄泥河入黄陂湖。
3、瓦洋河位于境东南，上源分三支：东支源出石桥水库的为石桥河，中支源出董冲水库的为糍店河，西支源出关庙水库的为巴滩河，三支流相汇于砖桥镇南，再西流经天桥、双凤、洋河乡，转北流至天井乡的齐心圩北拐入黄陂湖，干流长23.1公里，流域面积163平方公里。河流中上部有一些无名溪流。
4、失槽河源出矾山、钟鼎山，北流经矾山、缺口镇，在缺口镇的夏家嘴附近入黄陂湖，长9公里，流域面积23平方公里。
5、西河位于县东，黄陂湖水经缺口后分支东流(另一支塘串河北流入白湖新河)，至榆树拐流向无为由凤凰颈入江，跨庐江、无为二县，全长46.3公里。上段北岸缺口至榆树拐为庐江段(旧称青帘河，又名浣川)，长10公里；南岸迎水庵上为庐江、下属无为。其支流黄屯河，源出境东南天光山东麓、寨基山北，有十里长冲、汪家冲、黄演冲等溪流入黄屯河，自南向北经三溪桥、黄屯镇至迎水庵汇入西河，黄屯河干流长15.2公里，流域面积51.2平方公里。
三、西南部入江诸水系
1、罗昌河位于县南，源出龙王顶东麓，东流至章家院转向南，原穿罗河镇，1984年治理，将河道改走罗河镇北东侧，经鲍家滩汇入枞阳的白荡湖入江，县境河长16.5公里，流域面积108平方公里。在龙王顶丘阜区和砖桥丘陵区之间，尚有无名小支流汇入罗昌河。
2、柯坦河(古名曹王河)位于县西南，源于牛王寨东麓的虎洞水库，南流经柯坦镇、坝墩、邢嘴、梅庄，经磙坝至藻青山与界河合流。1970年始，柯坦河下段经治理改道，在乐桥、金桥交界处的小河口与界河合流(距藻青山北2.5公里)进入界河，至藻青山经孔城镇入菜子湖，通长江。柯坦河长21.3公里，流域面积126平方公里。在牛王寨丘陵和龙王顶丘阜区之间，河道曲折南流，诸多小支流(属季节性溪流)注入柯坦河。
3、界河(又名高子河)位于县西南柯坦河西侧，因庐江县与桐城县以河为界而得名。源出大佛尖、起风尖南麓，南流与柯坦河合流于乐桥乡的小河口，经桐城县境入枞阳县的菜子湖。该河长21公里，其上游有一无名支流，流域面积66.8平方公里。
〔水文站点〕
建国后，省、地水文部门于忠庙、兆河及本县缺口、界牌设有水文流量站；在砖桥、黄屯、泥河、乐桥、金牛、白山、栖凤岭设有雨量站。县水利局在舒庐干渠各段，重点水库和大圩建有汛期测报点，为河、湖、干渠、水库的蓄洪、泄洪、防汛、抗旱及有关生产、经营活动，提供较准确的水文资料。
忠庙水文站建于1959年5月，庐北汛期警戒水位10.50米，庐北大圩口保证水位12米(以下同)。水位最高是1954年8月2日为13.09米；其次是1983年7月26日12.15米；水位最低是1978年10月27日为6.63米。
兆河水文站建于1954年6月，兆河闸上游集水面积1390平方公里，自60年代起至1981年年平均流量最少的是1967年为2.05立方米／秒，次年为2.17立方米／秒，1978年为3.26立方米／秒；年平均流量多的一般在15立方米／秒左右，最多的1969年为21.8立方米／秒，最大流量是1979年6月26日259立方米／秒。由巢湖倒灌流量最多是1975年7月27日为48.3立方米／秒。水位最高的是1954年8月25日为14.39米，其次是1983年7月29日为12.18米。水位最低是1956年9月～12月，河道干涸。
缺口水文站建于1972年3月，但在建站前定时测流始于1968年至1981年，年平均水位最高是1975年9.05米。1969年7月14日缺口水位接近12米，1983年7月4日水位12.12米为最高，最低水位是1978年9月10日部分河段干涸。
舒庐干渠进水闸流量站(即界牌)建于1969年7月，闸下游年平均流量最大的是1975年16.4立方米／秒，日最大流量是1977年5月9日，达73.4立方米／秒。1974年7月29日水位最高为50.28米，一般是冬春渠道干涸。进入本县水量最多的是1972年，年进水总量为17000万立方米。
凤凰颈外(长江)水位最高的是1954年8月1日15.34米，其次为1983年7月13日14.55米，1973年7月2日13.92米。
〔地下水〕
本县地下水蕴藏量不明。由于受深断裂、燕山晚期岩浆活动和强烈上升的新构造运动的控制，境内温泉出露较多，如汤池、冶山、邓湖、顺港、砖桥、石山、石桥、城池等地温泉均有一定涌量，汤池、冶山矿泉涌量较大。县内发育的含水岩类有：浅变质岩和喷出岩类裂隙水，主要分布于西部和东南部地区；碎屑岩类裂隙水，仅分布于东南部山区北麓；松散岩类孔隙水，局限于山间谷地；赋存于浅变质岩、岩浆岩和部分碎屑岩中的地下水主要为风化裂隙水，局部为构造裂隙承压出水。因岩石富水性差，地形强烈切割，地下水交替活跃，运移途短促，很快就在短距离内以泉的形式排出或补给予地表水系，而不利于贮存。含水岩类及其它无良好发育的含水层，一般单孔涌水量皆小于1吨／时，沿河湖地带地层多属全新统水库相砂、砾石层发育，富水性较好，富水程度为30～50吨／时至5～10吨／时。汛期地下水位升高，有些地段地表水与地下水相连。枯水时，地下水多降至70厘米以下，岗畈多在1米以下，南部高岗地在几米以下。