一、储藏
（一）储粮仓械
1949年后，征收的粮油不断增加，政府将一些当铺、祠堂、庙宇，改作粮仓，并租借一些民房作为仓库。1952年4月，全县库存粮食1986.71万斤，分33处，大部分存放在民房、祠堂里。
1950年巢城东山新建木板合理仓，容量744万斤；1951年和1952年，在柘皋、烔炀兴建简易仓，容量450万斤；1953年在坝镇建造了基建仓，容量185万斤；并因陋就简就地取材修建仓库，容量245.90万斤，扩建仓库容量500万斤。到1953年底，计有各类型仓库容量5260万斤；并租借民房容量1154万斤。1954年大水，粮仓受淹，其中部分倒塌。灾后大修瓦仓容量2222万斤，小修瓦仓容量590万斤、草仓容量390万斤，在柘皋、东山新建苏式仓容量1400万斤，年末实有仓库容量8414万斤。
1956年春季，巢县内7个区39个分站72个存粮点，有仓库1450间，容量9195万斤；内有基建仓86间、简易仓102间、单仓384间、席棚仓155间、公房庙宇692间，租借民房67间。
1959年又新建苏式永久性仓库容量3151万斤。60年代建仓21幢容量3357万斤。
1960年3月，全县仅有民仓容量383万斤，后经改建扩建，归还给农村社队。1969年起，民仓全部淘汰，所有粮食都存放在国家的仓库里。
70年代建仓60幢，仓容7672万斤，1973年建仓8幢，1978年建仓10幢。
1980～1984年共建粮仓24幢，容量5859万斤。
按照1979年12月份测量统计，全县站点占地面积23.9799万平方米，其中生产性建筑占地7.805万平方米，生活管理建筑占地2.6568万平方米，晒场占地5.1391万平方米，其余土地8.3788万平方米，仓库使用面积6.5533万平方米，容量2.39亿斤。
建国初期，储粮机具一无所有，检斤用木杆秤，搬运靠人工扛，整晒靠太阳。1958年革新仿制小板车、狗头车、歪歪车、输送机、地下磅、自动磅、售米机、售油器、翻仓机等40种机具。1960年购进输送机一部、扒谷机一部、地中衡5台。1972～1978年投资29.26万元，建造烘干房7处。1982～1985年共购进震动除杂筛62台。1980年利用烔炀粮站中转组200万斤仓库进行地槽通风试点，效果良好。又在临湖、司集、青山、烔炀建有地槽仓库容量1100万斤。到1985年，全市站站有机械，运粮靠机动，售粮售油靠电控，实现粮食装卸、运输、检斤、整理、测温、收购、销售、保管、加工等渠道的机械化、自动化和半自动化。
（二）虫霉鼠雀防治
虫害发现的储粮害虫有玉米象、豌豆象、蚕豆象、咖啡豆象、四纹豆象、赤拟谷盗、杂拟谷盗、锯谷盗、大谷盗、土耳其扁谷盗、锈赤扁谷盗、谷蠹、谷斑皮蠹、黑皮蠹、黑粉虫、黄粉虫、麦蛾、螨类等20余种。
防治方法在粮食保管中，贯彻“以防为主，防治并举”的方针，严防、早防。建国初期是凭感觉鉴定、人力防治。80年代，能根据虫害活动规律，按照安全、经济、有效的原则，分别采取以下五种方法防治：
清洁卫生防治。这是一项经常性的工作，也是各项防治工作的基础。各区分站点都有严格的卫生制度，任务到站，责任到人，划片包干，分工负责，对仓门、梁柱、墙壁进行经常性的“掏、扫、刷、洗”，仓库区域范围内不准饲养家禽、家畜，做到仓内面面光，仓外三无（无垃圾、无污水、无杂草）。包装器材清洁消毒，垫仓芦席敲打曝晒，垫脚大糠用石灰水闷杀，杜绝一切虫害感染。
物理机械防治。采取通风、过风、摊凉、翻晒等方法，达到散发粮温、降低水份、除虫除杂、抑制霉菌。因水份大而引起的发热发霉，采取出晒以降水灭菌。东山、夏阁、柘皋、黄山、烔炀、黄麓、槐林7个站采取了烘干处理。因气候急剧升降，引起结露，使用剥皮办法；粮堆内部发热，采用打井开沟、深翻粮面；包装粮食发热，采用冲包过风。
化学药剂防治。用于空仓消毒的有敌敌畏、敌百虫、马拉硫磷、高丙体666烟剂，实仓杀虫的有磷化铝、磷化钙、磷化锌、氯化苦，溴甲烷等。
低温防治。低温杀虫法分仓内薄摊冷冻和仓内通气冷冻两种。仓内薄摊冷冻，是在寒冷季节将虫粮薄摊在晒场上冷冻，趁冷密闭储藏。仓内通风冷冻杀虫是利用干燥的冷空气来冷冻害虫。这两种方法操作简便，既经济，又能达到防治虫害的效果，是近年来发展起来的新技术。
鼠雀害防治。了解鼠雀的习性，根据它们的生活规律，采取人工捕捉、毒饵诱杀的办法。1958年采用黄沙垫仓7～8寸厚，码上一层砖头，防治鼠害。同年7月省粮食厅在巢县召开全省储运工作现场会，推广了本地的沙子垫仓经验。
仓储检查积极开展“四无”粮仓活动（即粮食无虫、无霉、无鼠雀、无事故和油脂无酸败、无混杂、无渗漏、无事故）。各个粮点仓库都建立了制度、制订出规划，采取“治早、治了”的原则。平时要求七天一大查，三天一小查，危险粮仓要天天查，风雨天及时查。每年冬春季组织区站自查，做到有仓必查、有粮必查、查必到底、有粮保粮、无粮保仓、发现问题、及时处理，处理一仓，巩固一仓。1982年黄山区粮站实现全区粮仓“四无”。
二、调运
调运能力全市9个区粮站，有5个在铁路和公路主干线上，4个在公路支干线上。库存粮油通过公路、铁路、水路，主要通过铁路调往合肥、蚌埠、山东、天津、北京等地。1950年尚未建立专业运输组织，调运粮食只能发动农民肩挑、大盆划、独轮车推。1951年后，委托运输部门运输，运输工具以板车为主。1972年购进了第一辆江淮牌3吨汽车。1984年粮运队发展到自有汽车20辆140个吨位，由原来委托运输转为大部分自运。
1952～1984年粮食调入调出统计表

平衡调拨建国以来，共组织4次粮食大调进。1950年从四川、江西等地调进粮食1253万斤，平息了粮价上涨风。1954年从外省调进粮食7015万斤，其中粮种2991万斤。1959年从淮北涡阳调进山芋干1500万斤、小麦种子300万斤；从定远县调进大麦种子80万斤。1971年良种不足，从上海、江苏、浙江等省市调进早稻良种700万斤。33年中，共调出粮食20.7亿斤，年平均6269.32万斤；共调入粮食11.24亿斤，年平均3405.20万斤。净调出粮食9.46亿斤，每年平均净调出2867.15万斤。