一、江堤管理
1、管理机构民国以前江堤无统一管理机构，堤防无专人管理，人畜随意践害。民国16年（1927年），皖、鄂、赣3省会同设立马华堤（今同马堤）工程局，不久被撤销。民国35年，区内江堤由长江水利委员会（后改为长江水利工程总局）分设工程处、段管理，安徽省第一工程段设在华阳，管辖宿松、望江、东流3县江堤；第二工程段设在安庆，管辖怀宁、桐城（含枞阳）、贵池3县江堤，各圩由乡绅组成圩董和堤工会。
建国后，地区集中力量进行防汛抗洪和堵口复堤工作。1950年夏，长江下游工程局即在安庆设立安庆专区长江修防工程处，属专区领导。1950至1952年，各圩先后成立堤委会（堤工会）负责圩堤管理。1962年专区设立长江修防分局（后改为长江修防所），各县设立长江修防段，各圩、堤段均设立堤管理委员会。
2、管理制度根据“安徽省长江干堤管理养护暂行办法”规定，区内各沿江干堤，均有各自的管理规章制度。如同马江堤即有《堤防管理制度》、《护堤林、芦制度》和《护堤工职责》等，具体内容如下：
《堤防管理制度》：不准在堤身和堤内脚五米内开荒种植；不准在堤身铲草皮；不准在堤外方塘内挑塘泥；不准在护堤林内种植；内河堤身及江河堤内脚30米内，一律不准开荒种植或建房、筑窑、打窖、做牛栏，原有的要拆除。
《护堤林、芦制度》：严禁乱砍、乱伐；砍伐茂林时先由砍伐单位造好计划，由堤管会审查，报请县人委批准后执行；修枝打杈，应经堤管会审查，报县批准，否则视其情节轻重，分别予以处理；外滩及江心洲芦场，严禁破青，不准开荒、放牧。
《护堤工职责》：看管猪牛羊，不得损坏堤身、树林和芦苇；管理铁木轮车不在堤顶上行驶，胎轮车雨天停止通行；保管好本堤段内的防汛器材；填补雨淋沟缺；教育附近社员护堤、爱堤；与当地基层领导联系有关堤防管理工作。
二、大、中型水库和灌区管理
1、花凉亭水库花凉亭水库于1962年放水灌溉，水库工程指挥部同时负责工程管理工作。1976年水库枢纽工程基本完成，1977年即成立安庆专区花凉亭水库工程管理局，职责是以管理为主兼顾施工遗留任务。其间，1975年在水电站开始筹备安装工程时，省电业局即另行设立花凉亭水电站筹备处，1976年正式成立安徽省花凉亭水电站，归省电业局领导。这一阶段，花凉亭水库、电站工作是两套人马，两个系统，交叉管理。1984年5月，省政府决定，安徽省花凉亭水电站与安庆专区花凉亭水库工程管理局合并，改名为安徽省安庆地区花凉亭水电站，隶属行署水电局。水电站内设6个科室、3个分厂及劳动服务公司和医院，共计433人。主要任务是：水库枢纽工程观测、养护、维修；发电生产及电站运行管理；灌溉、发电供水和库内水位控制；汛期洪水分析、调度及防汛抗洪；工程维护计划和电站企业管理工作。
2、花凉亭灌区1963年成立花凉亭灌区管理所，始属太湖县人民委员会领导。1965年成立安庆专区花凉亭灌区管理所，属专区水电局领导。1978年灌区扩大，管理所改为花凉亭灌区管理局，为县级单位，归行署领导，业务工作归行署水电局管理。1984年机构体制改革时，灌区管理局改为副县级单位，归行署水电局领导。灌区的群管组织，1967年放水流量20立方米／秒时，由行署、行署水电局和有关县的分管领导，成立临时管理委员会，议定灌区重要事项。1982年正式召开灌区群众代表大会，选举产生灌区管理委员会，并制定颁布了安庆地区花凉亭灌区管理工作条例。灌区内的4个县也分别召开了灌区群众代表会，成立分干渠、支渠以下的管理委员会，负责议定灌区管理的重要事项。
灌区范围内的干、分、支渠道，均归灌区管理局统一管理，具体工作由下设的各管理所负责实施。各管理所的管辖范围是：总干渠及太湖县境的各分干渠，由管理局直属的渠首、毕岭、集岭、汪元等4个管理所负责管理；望江、宿松、怀宁3县境内的灌区工程，分别由3县的管理所负责管理；太湖县管理所，除管理本县支渠外，还协助管理局做好总干渠及太湖县境内分干渠的管理工作。
灌区水量分配，按原设计进水70立方米／秒和各县受益田亩进行分配：太宿分干渠22．6立方米／秒，望江南分干渠12．2立方米／秒、北分干渠11立方米／秒，太怀分干渠8．83立方米／秒，其余水量为总干渠损耗和太湖各支渠使用。目前，渠首进水只能达到设计流量的88％，灌区的计划效益田亩也还没有全部达到，因而分水只按实际进水流量，依比例调节分配。
灌区用水计划由管理局统一调配，各县范围内由县管理所调配。放水原则是：统筹兼顾，全面安排，先急后缓，先用塘水，后用渠水，上下游互相照顾。渠道上的涵闸，均由管理单位分配专人负责，其它任何单位或个人均不得擅自启闭闸门。各用水单位按分配的水量、时间、引水地点进行灌溉，不得争水抢水，不得过量用水。灌溉期间，如遇特殊情况或事故，由管理单位负责处理，按照实际情况，有计划地减水、退水或停水。
3、钓鱼台水库灌区钓鱼台水库修建期间，由工程指挥机构管理。1971年成立钓鱼台水库管理所，1977年水库电站竣工后，成立钓鱼台水库电站管理所。根据各级领导机关的规定，管理所对水库、电站的一切设施及辅助保护设施进行管理，使其处于完好状态；编制水库修复计划和监督施工；准确及时测报水位、雨量；汛期观测水库大坝位移、渗流情况；协助领导指挥防洪，根据县防汛抗旱指挥部安排，及时启闭闸门以控制灌溉和调节库水位，在充分利用水力资源和服从灌溉需要的前提下，发电送电；搞好多种经营，搞好库区绿化。
该水库灌区与黄大口水库（小一型）联灌，成立了钓黄灌区管理所，计有职工37人、农管人员23人，负责管理干渠47公里，指导乡、村管理的有支渠28条114公里，斗农渠88条77．5公里，及闸、涵、桥等建筑物203座。灌区控制面积400平方公里，共有耕地21．9万亩，现实灌耕地15万亩。灌区管理主要职责是：管理维护渠道和建筑物工程完好，保证水流畅通、灌溉计划实现；制定用水计划，按时、按量分配灌溉用水；搞好渠道防洪安全；搞好渠道绿化；按基本灌溉田亩和当年用水量，分渠计收水费，并将水费收支情况和使用计划报县水电局审批。
三、涵闸与排灌站管理
1、涵闸区内沿江计有大、中型涵闸9座，均设有专门管理机构——闸管所。其中跨地区工程1座（梳妆台闸），由省长江修防局管理；跨县工程5座（枞阳闸、杨湾闸、华阳闸、皖河闸、黄湓闸），由行署水电局领导；县内工程3座（东流闸、白荡闸、下清溪闸），由所在县水电局领导。
各闸管所共有管理人员53人。管理所的主要职责是：管理养护水闸的各项工程（含设备）和内外引河工程（内到湖口，外到江边）；定期观测闸身的沉陷、位移；定时观测闸口内外水位；整编观测资料；按照水闸的控制运用计划，适时进行启闭闸门；管理过闸船只；经营管理范围内的水产、绿化和其它生产；接受上级防汛抗旱指挥部下达的有关防汛抗旱任务；需要修整时，提前向主管部门申报维修计划，并配合设计、施工单位搞好设计、施工工作。沿江各大中型涵闸，均按各自设计要求、结构、水文地质情况，分别制订出管理运用原则。
2、重点排灌站1954年地区水利工程处开始设立机械排灌股，1958年后沿江各县均先后设立排灌机械管理中心站，地区排灌股改为排灌机械管理所。1963年对排灌站进行清理整顿，经营体制定为：国家投资建设的有国有国营和国有社营两种；民办公助或集体投资兴建的，为社有社营。国营站、国有社营站和社有社营的大站（500马力以上），由地、县排灌管理所、中心站进行管理。国营站为事业单位企业管理，经费主要来源于收缴水费，不足之数，由水利事业费补助，并逐年削减差额，达到自给有余。
管理所（站）的主要职责是：制订管理制度；检查泵站的设备管理运用情况；指导排、灌区的工程管理；研究制定水费收缴办法；组织各站开展综合经营；组织全区（县）性的技术培训；汛前组织进行设备检修并供应材料、配件；管理用油计划；定期进行重点泵站的效率测试；每年进行重点站的八项经济技术指标考核；组织评比工作。
机泵站的装置效率，是衡量技术经济指标的主要标准，国家规定装置效率应达到54．2％。区内于1984年抽测了6县22个站的44台机组，其装置效率高于40％低于54．2％的占总数25％，达到40％～20％的占总数61％，低于20％的占总数14％，故多数泵站仍处于效率低、能耗大的状况，亟待从机电设备和水工布置上求得改进。