绩溪县是新安医学发源地之一，历代名医辈出，医著浩瀚。元迄明、清代，在州、县内外享有盛名者52人，撰辑医著32部。清同治间，胡澍著的《内经校义》，影响全国，今仍为中医必读之经典。汪惕予于光绪间留学日本，回国后在上海创办医、护学校，发行医学报刊，著有医书，成为现代中西医结合的先驱。
历代县内行医者不到总人口的千分之一。乡村缺医少药，多赖土医、土法和单方草药。愚昧者求神拜佛，巫医风行。劳动人民长期缺医少药。
民国15年(1926)曾受医科院校教育的西医章大木在县城开业，至建国前夕，先后有17名西医在城乡设立诊所。亦有医德高尚之医家和旅外商人、地方善户施药给贫苦病伤者。县政府虽曾建公立医院和推行防疫，但受经济和人才所限，城乡人民的缺医少药状况未能改善。传染病连年流行，地方病加剧。
新中国成立之初，县人民政府建立县医院和农村联合诊所，组织全县个体中、西医医生，为人民防治疾病。国家每年投入大量资金发展医疗卫生事业。50年代后期根除甲类传染病，控制地方病和其它传染病的流行。人民卫生、医疗、防疫、保健机构不断完善。中药材生产和利用取得成就。70至80年代，建成县、乡、村3级医疗网，中西医相结合的医疗、保健队伍壮大，器械、设施趋向现代化，人民健康水平大为提高。