【地表水】全县水域面积总计572155亩左右，占全县总面积的15％(其中河流面积72652亩有余；沟塘面积263376亩，湖泊面积211681亩；库坝面积24445亩)。正常年份总蓄水量为2.35亿立方米(其中丘陵山区库坝蓄水量为1.19立方米，平原圩区沟塘蓄水量为1.16亿立方米)。蓄水总量占年平均产水总量(14.95亿立方米)的15.72％。
▲水系分布本县河流属长江水系，境内主要有两江、两湖、九条河。
水阳江——源于皖、浙交界天目山麓，由宁国入本县水东镇，自南而北贯穿全境。于当涂县太平口注入长江。在本县境内流长90公里，年平均径流量为24.65亿立方米，年平均输沙量为70.12万吨。汛期同雨季一致，5—9月为汛期，11月至次年2月为枯水期。常年水位值平均为海拔10.16米。解放后最高水位为海拔18.33米(出现在1984年9月2日)，最低水位为海拔5.8米，流量为零(断流。出现在1978年7月5日—17日、8月8日—9月11日)。汛期洪峰最大流量为7640立方米／秒(出现在1961年)，正常泄洪能力为3500立方米／秒。境内有其主要支流7条：
1、华阳河。源于本县南部华阳山区，流经溪口、新田、黄渡、向阳四个乡、全长42公里，于向阳乡大洪村注入水阳江。
2、朝阳河。源于本县东南部双峰山南麓，流经宗村、前进、汪村、交通等行政村，全长7.5公里，于水东镇附近注入水阳江。
3、双桥河。位于本县东部，由双桥镇东南杨家嘴(水阳江流段)进口，经沈村乡武村湾注入南漪湖，全长21.2公里。
4、宛溪河(又称夏渡河)。源于本县南部周王乡宝冲，流经周王、夏渡等乡并环绕城东，全长14公里，于城北三岔河注入水阳江。
5、牛耳港。位于本县东北部，系水阳江自然分洪进固城湖的河道之一。自卫东乡小河口起，经狸桥镇于太保圩入固城湖，全长11公里。
6、北山河。位于本县北部，自新河庄(水阳江流段)进口，于马山埠出口入南湖，全长7公里。
7、裘公河。位于本县北部，由管家渡(水阳江流段)进口，流经金宝圩西北拐，于当涂县乌溪村对岸出口，复入水阳江主流，全长22公里。
青弋江——源于黄山北麓，全长275公里，流经本县西部文昌乡一隅，流长15公里。境内有其支流2条：
1、周寒河。源于本县南部金牌坑，流经梅龙、洋口、周王、杨柳、寒亭。于富家湖入青弋江。全长31公里，全河道建有3座混凝土溢流坝(即杨柳官坝、寒亭天门坝和碑潭坝)。
2、高桥河。源于本县西南部龙潭坑，流经榨门、柿木铺，于文昌乡入青弋江，全长23公里。
南漪湖(简称南湖)——位于本县东北部。中心座标为东经118°56′，北纬31°05′，系天然淡水湖。东岸为郎溪县境，余岸均为宣城县境。全湖水域面积205平方公里，属本县辖境为135平方公里。东北受郎川河(源自广德县境)、以及境内水阳江支流诸水。由西南隅马山埠出口，于新河庄汇入水阳江直达长江。常年水深2—4米，湖底高程5—6米，最高水位12.5米，最低水位9米，自古以来为本县的一大利薮。
固城湖(又称小南湖)——位于本县北部，距县城45平方公里。全湖水域面积81平方公里，其西南隅属本县辖境，面积15平方公里。余为江苏省高淳县辖。常年水位为7米左右。为本县水阳江调蓄泄洪的湖泊之一。
▲水文特征本县水文特征主要表现：1、迳流与降雨量有密切关系。即降雨量大，迳流深也大，反之亦然。2、不同地貌类型，迳流深存有一定差异。一般为山区迳流深大于平原圩区。据水文、气象部门记录资料表明，本县降雨量由北部圩区至南部山区逐渐递增，年平均降雨量分别为：平原圩区1266毫米，丘陵地区1368毫米，山区1683.6毫米。迳流深分别为：平原圩区485毫米，丘陵地区621毫米，山区735.9毫米。迳流量分别为：平原圩区3.93亿立方米，丘陵地区9.17亿立方米，山区1.85亿立方米。
【地下水】境内已初步探知的42个地下水点，分布于8条含水区带之内。
▲狸桥—新河庄地下水分布带受北东向的破碎带、砂岩层、石灰岩层、岩体等控制，为石灰岩岩溶水，石灰岩构造裂隙水，岩层与岩体接触带地下水等。
▲九连山地下水分布带主要赋存在隐伏石灰岩层及北东向为主体的构造破碎带中，为岩溶水、裂隙水。因处九连山南侧低平地带，地下水常具承压性。该带已完成的煤矿、铀矿地质勘探钻孔，多为地下水涌孔或承压性水井，地下水位接近地表。
▲敬亭山地下水分布带(分南北两带)北带地下水赋存于红层、火山岩层之下的隐伏石灰岩及其构造破碎带中，以及火山岩、红层、砂岩之间的接触带部位。为岩溶水、裂隙水和接触带水；南带地下水赋存于敬亭山南坡转换为平坦红层的转换带。此处为一区域性北东向深大断裂带，沿带多处有泉水出露。
▲麻姑山地下水分布区受北东向、东西向断裂、石灰岩含水层、泥岩隔水层及岩体等控制，尤其是在该山南侧构造发育，又有隔水砂岩层，预计含有更丰富的多类地下水。
▲周王近东西向含水带该带受东西向石灰岩层、构造破碎带及隔水的砂泥层控制，为构造、岩溶地下水。
▲水东—虾子岭地下水分布区处于虾子岭背斜隆起带与姚村花岗岩体外侧，石灰岩分布广泛，北东向与北西向断裂构造发育，地下水丰富。碧山龙泉洞即为古地下水侵蚀而成。该区石灰岩富水层及构造破碎带延伸到宁国县港口一带，地下水点较多。
▲溪口—华阳近南北向地下水分布带处于近南北向构造破碎带及石灰岩发育区。地下岩溶水和构造裂隙水极为发育。白云洞即古地下水侵蚀而成。现已开发的溪口乡古西溪矿泉水亦是赋存于石灰岩的优质地下水。
▲水阳江河漫滩地下水分布带水阳江沿岸的古河漫滩及近代河漫滩发育，蕴藏着丰富的浅层地下水资源。县城北门工业区已采用这类地下水用于生产与生活。
上述区、带的地下水，除少数水点水质较差外，其余均为优质地下水，尤九连山古泉、碧山龙泉以及溪口古西溪矿泉，均具有开发价值的饮料资源。在地下水调查中还发现：以敬亭山为起点，由西向东存在一条地下温泉带，在建国乡的九女村出露地表。自80年代初开始，水产部门一直利用这股温泉，使引进的“罗非鱼”苗安全越冬。