庐江自然环境优越，宜于多种野生动植物的生长、栖息，野生动植物资源较丰富。其中被列为国家保护的珍稀动物有金钱豹、麂、狐狸、天鹅、鹤类、雉鸡、黑鹳、灰喜鹊、啄木鸟、杜鹃、黄鹂、家燕、伯劳、夜枭(猫头鹰)、野鸭、大山雀等。
〔野生动物〕
一、兽类有金钱豹、麂、狼、野猪、豺、野猫、水獭、黄鼬、狐、狸、野兔、猪獾、豪猪、鼠、穿山甲、刺猬、蝙蝠。其中金钱豹、麂、狼、狐狸、黄鼬多出没于山区丘陵区或圩畈区，今已少见。虎、猴、獐、鹿等，旧志有载，今已绝见。
二、鸟类有雉、鸦、鹰、燕、鸽、夜枭、鸬鹚、鹭鸶，秃鹫、野鸭、鸳鸯、百灵、鸿雁、黄眉、柳莺、大杜鹃、黄鹂、山雀、画眉、斑鸠、啄木鸟、喜鹊、灰喜鹊、黑卷尾、翡翠鸟、红尾伯劳、红嘴蓝鹊、麻雀、鹦鹉、乌鸦、竹鸡、鸲鹆、鹧鸪、八哥、秧鸡、黄雀、白头翁、白腰草鹬、四声杜鹃、董鸡、野鸡、火鸡、天鹅等。其中雁、天鹅是过境候鸟。乌鸦、鸳鸯、鹭鸶等今已少见。
三、鱼类有青鱼、草鱼、鲤鱼、鲫鱼、鳊、鲢、鳙、鲚、银鱼、鳗、麦穗鱼、鳡、团头鲂、马口鱼、赤眼鳟、三角鲂、油鲹条、泥鳅、黄颡鱼、河鲶、黄鳝、鳜、螺、蚌、虾、蟹、龟、鳖等。鱼类区系组成与巢湖大致相似。既有定居性鱼类，如鲤、鲫等，又有鳗鱼、银鱼等回游性、半回游性鱼类。有以浮游生物为主要食物的鲢、鳙，也有以水生高等植物为主要食物的草鱼、团头鲂等。有以底栖软体动物为主要食物的青鱼，也有以鱼为主要食物的鳡、鳜等。共计55种，分别隶属7个目15个科，其中鲤科鱼类34种，占61.8％，鲢、鳙、鲤、鲫占优势，虾、蟹、鳖，各类水域均有，乌龟数量极少，濒于绝迹。
四、蛇、蛙、虫类有乌梢蛇、赤链蛇、水蛇、腹蛇(土地蛇)、竹叶青蛇、蜥蜴、四脚蛇、壁虎、石子龙、青蛙、蟾蜍、石鸡、蝾螈、蜗牛、蚯蚓、水蛭等。蝾螈多见于冶父山。
有蚁、蜂、蜘蛛、蝴蝶、蜈蚣、蜻蜓、蟋蟀、萤火虫、尺蠖虫、毛虫、蚍蜉、土鳖虫、蝉、蛾、瓢虫、棉牙虫、棉铃虫、稻螟虫、蛆、蜒蚰、蝼蛄、地老虎等(其它害虫详见农业章)。另外，野生动物中浮游动物有16属，底栖动物有14种。
〔野生植物〕
野生植物中，浮游植物有藻类7门33属，水生植物26种，分属17科。
一、树木类主要有银杏、松、柏、山苍子、山榴、山胡椒、山槐、山楂、棠梨、刺槐、黄檀、葛藤、紫藤、枫香、山桃、皂荚、紫穗槐、河柳、垂柳、板栗、锥栗、毛栗、胡桃、白榆、刺榆，桑树、柘树、枸杞、乌桕、油茶、茶树、枣、柿、君迁子、花椒、香椿、臭椿、苦楝、梓树、黄连木、漆树、黄荆、三角枫、杜鹃、杨梅等。加上建国前后陆续引进和人工裁培的树木品种共有59种，其中用材林40种，经济林12种，风景林7种。
二、竹类主要有圆竹、水竹、石竹、苦竹、桂竹、金竹、笠竹、紫竹、箬竹等。紫竹、箬竹多在庭院为人工裁培。
三、花草类有山茶、杜鹃、紫荆、紫薇、菊花、梅、月季、合欢、金银花、栀子花、蔷薇、洗澡花、兰草、芍药、含羞草、石蒲、鸡眼草、野枯草、茅草、菱菜、珊瑚苔、蒌蒿、马兰、野苋、荠菜、蕨、鹅肠草、胡椒菜、马齿苋、药芹、蒲公英、紫花地丁、龙须菜、白蒿、青蒿、蛇莓、菇、雀麦、稗、蓑衣草、狗尾草、扒根草、小蓟等。兰草、山茶花分布于牛王寨山区，多被移植于庭院。荷花、菊花、金银花在山区、圩区广泛分布。另有近百种人工培植的花卉主要分布在庭院和园林场。
四、药材类庐江野生药材品种多，山地药材资源丰富。清顺治《庐江县志》记载药类70种，嘉庆《庐江县志》记载植物药材26种，民国《冶父山志》记载冶父山产药200余种。1958年地产药材摸底有107种，其中植物90种，动物16种，矿物1种。1984年药材普查，全县地产中药材品种312种，沿湖圩畈区域是水生或近水生小药材的集中产地，低山丘陵区，尤以200米以上的山区是多种药材的重要产区，但砖桥山区药材品种单调，矿物类药材储量丰富。庐江桔梗是名贵药材，有“桐庐桔梗无紫苏”之称。
1、根及根茎类
桔梗半夏明党参苦参紫丹参沙参白前白薇
白头翁白芨土牛膝天门冬青木香前胡香附龙胆草
玉竹防己天花粉苍术黄精何首乌乌药葛根
天南星板蓝根射干姜土茯苓石菖蒲茜草百部
百合威灵仙白蚤休芦根白茄根苎麻根糯稻根猫爪草
地榆藕节地枯蒌漏芦贯众薤白光慈菇狼毒
黄药子藜芦徐长卿地骨皮虎杖菝葜白茅根土大黄
白玄胡皖贝牡丹皮萱草根麦冬商陆山药石蒜桑白皮大蓟山豆根白藓皮乌桕根皮
菊三七景天三七合欢皮寻骨风茅莓骨碎子椿根皮苦楝皮
2、茎、叶、全草类
天仙藤荷梗苏梗透骨草桑枝天丁竹茹喜树
松节忍冬藤鬼见羽夜交藤侧柏叶荷蒂苏叶淡竹叶
牡荆叶艾叶枸骨叶桑叶枇杷叶大青叶山藁本翻白草
苍耳草车前草马细辛薄荷小蓟茵陈蒲公英荆芥
瞿麦佩兰益母草败酱草红旱莲旱莲草老鹳草金沸草
扁蓄鹅不食草马鞭草鹿衔草凤尾草伸筋草泽漆
浮萍鱼腥草豨莶草石韦石见穿地丁青蒿马齿苋
半枝莲半边莲谷精草柴胡六月雪佛耳草蜀羊泉平地木
百蕊草垂盆草仙鹤草白毛夏枯草鸭跖草虎耳草蛇莓
叶下珠酢浆草龙葵猪殃殃乌蕨珍珠菜地锦草铁苋菜
灯芯草三白草杠板归牡蒿毛茛柳寄生瓦松博落茴
一枝黄花荠菜空心莲子草鹅脚板仙桃草田基黄
金钱草茅膏菜疳积草穿心莲白花蛇舌草连钱草泽兰
盐肤木蔓陀罗络石藤
3、花、果实、种子类
辛夷花葛花荷花莲须凤仙花槐米红花蒲黄
玫瑰花枫茄花鸡冠花夜合米芫花闹羊花木槿花月季花
玉米须松花粉野菊花菊花金银花栀子枸杞五味子
紫苏子牵牛子苍耳子楮实子芫荽子柏子仁马兜铃瓜蒌皮
瓜蒌子莲子莱菔子牛蒡子王不留行青箱子草决明
白芥子急性子天竺子梧桐子复盆子刀豆子刀豆壳积椇子
金樱子蛇床子地肤子八月扎莲子芯莲房丝瓜络冬瓜子
冬瓜皮小茴香野花椒杏仁桃仁香橼皮陈皮山楂
薏苡桔核桔络鹤虱桑椹子槐角白扁豆石榴皮
路路通皂角柿蒂白平子碧桃干绿豆衣鲁豆衣陈瓢
无花果海金砂车前子女贞子川楝子沙苑子韭菜子赤小豆
蓖麻子山茱萸山核桃挂金灯茺蔚子夏枯草白果
4、动物类
蜈蚣狗肾龟版龟壳鳖甲水蛭紫河车鸡内金
鸭内金蟾酥蝉蜕金蝉花乌蛇龙衣全蝎土鳖虫
蝼蛄蜣螂虫地龙蟋蟀牛虻夜明砂刺猬皮蜂房
蚕砂望月砂蜂蜜黄蜡壁虎桑螵蛸牛鞭
5、真菌、矿物类
银耳马勃赤石脂明矾石膏