寿县宗教有：道教、佛教、伊斯兰教、天主教、基督教。
一、道教
道教源于古代神道的巫祝史，转而为方士，东汉末年形成道教。魏晋前后，宗派纷起，至辽金大体归为正一、全真两大宗对峙于南北。寿地道教属全真宗，崇尚真君；道士不食荤酒，不置家室，授徒传教，终身为道；始于何时旧志未载。从《水经注》“淝水又西径寿春故城北，右分北溪，溪水导北山泉源下注……径陆道士解南精庐”；“淮水北径下蔡故城，东南径八公山北山，山上有老子庙”等记述看，不应晚于北魏。淮南王刘安在此学道求仙，集门客数千，完成《淮南子·原道训》论道名著，把黄老学说推到一个新的阶段。此后，黄老思想朝着神仙方术和宗教迷信方向加速发展。寿地作为刘安父子封地长达64年之久，对后世寿地道教的发展有一定的影响。
道教信多神，既多又杂，它宣传长生不死，易被生活实践所否定，敌不过佛家“顿悟”、“轮回”宣传。寿地道教庙宇约在元朝中后期即多被佛僧主持。清光绪三十一年(公元1905年)寿州南乡庙产一览表记庙宇60余处无一处是道教。民国23年，寿地寺庙270处，589人中，“道观类”只16处11人。到民国35年10月，寿县双菱乡高家庙住持方真修、苏王积善堂(公所)传教师高家齐、正阳城隍庙住持徐法云、桥头乡桃园寺住持刘俊才、谢埠乡华祖庙住持杨圣祥、南岳庙住持江舜山等6名道士，均参加了寿县佛教分会的改选大会，被登记在佛教会员名册中。表明此时寿县道教已经衰落，只是民间习俗上的多种信仰仍然不衰。 道教庙宇原有：四顶山庙、真武庙、城隍庙、关帝庙、三义庙、龙王庙、马神庙、火神庙、大王庙等，今多不存。
二、佛教
佛教何时传入寿地，未见记载。南朝宋武帝刘裕于晋元熙元年(公元419年)镇寿阳，曾为僧导建寿春石涧寺。僧导在此讲说经论，“授业千余人”，表明其时寿地佛教已有较大发展。梁武帝萧衍(公元502年—549年)以人王兼法王身份宣布佛教为国教，在寿阳五株山南高滩上建西昌寺，可见寿地早在南朝之前期，就有了佛教活动。
唐代寿地佛教为惠能所创禅宗，如寿州释智通、三丰山寺道树、紫金山寺玄宗，均为禅宗。唐末五代时，延为临济义玄所开临济宗派。清曾道唯光绪《寿州志》记，乾隆间准提庵僧际清是临济宗第三十七世。宋代寿地佛教徒成两种形式，一是以佛教为业，有主持僧智、义琛、义广、义志、义真等，称为“火宅僧”；二是不离家的“出家”僧。《寿州寿春崇教禅院新建舍利砖塔地宫壁记》(以下简称《地宫壁记》)中施舍利金银棺的“都会首皇甫准并妻薛氏”、“来远镇刘守忠并妻戴氏”等，便是“出家”有家的佛徒。此后，这种“出家”不离家的佛徒，更为普遍。民国35年(公元1946年)8月，寿县佛教分会进行筹组改选。改选后分会会员由65人增至92人，其中党政绅商界31人，尼5人，道6人；会员中有国民党员27人。 1949年后，寿地佛教活动停止。所剩僧尼仅有能如(原姓罗名福林，霍邱县新店埠罗世成女，生于民国14年，抗战初，入霍邱华祖庙，从昌华徒龙智为师，后随龙智来寿火神庙。抗战胜利后迁圆通寺，又迁准提庵)、龙城(原南岳庵尼善文的徒孙)、元昌(原三圣庵尼心诚徒。元昌父名张进斗)3人。能如今在寿县城关副业加工厂工作。龙城、元昌在青蔬社。佛教的寺庵，今以报恩寺为最。尚存名目、址迹的有卧佛寺、圆通寺、准提庵等10余处。
1946年10月寿县佛教支会理监事名册表
三、伊斯兰教 伊斯兰教传入寿地，是以回族人来居为始，可靠时间不详，或说唐、宋时就有回民居此，这一说法的根据是寿县城内紫顺街西曾有“回回街”和小清真寺。又说明洪武二年(公元1369年)从山东老鹳巷移来边、朱、王、梅、张、赵6姓回民，持这一说法，与明天启间(公元1621—1627年)建清真大寺一起考虑，可信。(参阅本志人口章、民族目)
民国23年(公元1934年)，《寿县寺庙统计表》有清真寺33个，主持人288人，信仰回教人为25487人(当时寿县疆域含今之淮南市西部和长丰县大部分)。1983年寿县回族人口为25401人，清真寺15处。
伊斯兰教在阿拉伯文字中的意思是“顺从”。信仰安拉是唯一的神，信穆罕默德是安拉的使者，信《古兰经》是安拉的天启经文，相信死后复活的末日审判，信天仙。通称“五大信仰”，这是基本教义的理论部分。实践部分，即穆氏必须遵循“五功”(念、斋、礼、课、朝)、“五典”(子女之道要孝顺父母、夫妻之道要互敬互爱、长幼之道要尊老爱幼、兄弟之道要兄友弟恭；朋友之道要信义互助)。尊祀穆罕默德，圣诞圣忌毕祭；纪年十二月，不置闰；七日礼拜，入寺诵经；不食犬豕，丧不置棺。过开斋、古尔邦、圣节三大节日。
四、天主教
天主教传入寿县时间不详。据“安徽天主教发展路线图”示：清光绪二年(公元1876年)自淮安府经五河、凤台至阜阳，经寿境至凤阳，顺淮水上下，均经寿州地。光绪九年(公元1883年)建法天主教堂。初，安徽天主教属南京宗座代牧区。民国19年蚌埠宗座代牧就职，兼理正阳教务。说明此时正阳已有天主教在活动。民国23年统计，寿县信仰天主教的有173人。据群众回忆，曾有滁州人魏某为神父主办正阳教务。魏回滁州，蚌埠宗座又派济南人孟昭文为神父来正阳，租北门外民房作教堂。抗战时，正阳有“便民医院”。医生李云臣在南门内办难童教养院，传布天主教。1951年，孟回山东，正阳天主教活动停止。
五、基督教
据《皖政辑要》记，清代凤阳府属基督教堂，寿州有2所：“英福音堂在西乡正阳镇，华氏瓦草房四重。光绪十三年(公元1887年)价典周姓之屋，教士贝德礼，德人，间有施医”。光绪二十二年(公元1896年)县城驻教士有英人东履仁，女传教士班鸾凤。“分堂一，设在东门内北紫金坊，华氏瓦屋四重。光绪三十二年(公元1906年)，价典权姓之屋，教士系正阳教堂教士兼理，间有施医”。其时，正阳基督教会属内地会系统。初期到城关作流动传教，曾在西街大卫巷租房设点，后在东门内北紫金坊设分堂。
20世纪初，基督教长老会传教士赖尔慈，明慕礼(美籍人)和中国人牧师刘觉非，长老王廷臣、李仰山等，相继从怀远来寿县城关，作流动布道，并在民国元年接收了原属正阳内地会在城关的聚会点。民国4年，怀远长老会派美籍传教士仲璧如为驻会代表，全权负责寿风地区的教会工作。民国7年，她从怀远迁住寿县城关。民国12年，成立“寿凤堂会”，聘孙乐天首任国人牧师，吕轶三、钮文轩为传教士，办起震华男校(完小)、道华女校(完小)及兴华贫民半日学、蕴华妇女半日学，设春华医院。在寿县东南乡成立分堂13处。此间隶属怀远长老会的淮南区会。民国32年至1985年，牧师是唐润生、徐涤心；长老先后有：王云夫、李茂轩、桑孟杰、陈新吾、岳子文、门荣青、徐洁尘；传教士有：陈复初、林竹君、年淑梅、金丽生、田新玉、王映梅、张爱三。
寿县人民对异教极度反感，其时信者甚少。民国15年，钮文轩、李中明、梁文海到南乡作布道宣讲，“3次在外70天，经过集镇13处，9200余人听道，注意者37人”。钮在是年11月27日年会上报告说：“南方敬神心较北方切，家家门上都有土地神或财神，更有拜龟者，且拜一切坟墓、石像；弃婴之风较盛，赌博亦盛”。冯益轩报告震华学校情况说：“近年以来，非基督教之风潮，颇形激烈，而教会学校，尤为非教者集矢之的。吾寿非教同盟其反对吾校，也不遗余力。或捏造谣言，以蛊惑学生之家长；或讥诮学生诱彼等中途转学；或嘲笑教员使吾辈灰心思退；甚至结队游行，临门而跳骂，大声疾呼曰：‘打倒震华学校’!可见寿地人，对基督教之冷淡”。此间，寿县也有部分资产阶级民主派人士如张树侯等，见军阀混战之世，想从宗教中寻找救国之方。他在总结对比儒、道、佛、伊等教之后，认耶稣“以上帝为体，以耶稣为用”，可以“纳万有于皇天”，“百结并解”，发愿归依耶教。然而，只是纸上谈兵，随者甚少。
二次世界大战前后，日本帝国主义与英、美“在华利益”上，发生矛盾，在此特定背景下，英、美慈善机构和教会，对中国民众显示了一些“亲和性”。教会的影响，也达到它们历史上最佳状态。民国29—30年，日本侵略军占领寿县城，基督教堂、教会医院及其学校，以不得被占领的第三国处所，收容难民，施医传教，尤其是妇女，为免遭日本侵略军残害，多到教堂或医院避难而听道入教。民国30年9月22日，堂会统计，教友309人，比上年同期158人增加近一倍，其中女性205人，占66％以上。
1950年起，寿地基督教与美国长老会断绝关系，成为“三自”(自治、自养、自传)的以信仰自由为特征的基督组织，参加各项爱国运动。1952年成立寿县基督教“三自”爱国运动委员会，主席有唐润身、王济琛、邱振三等，并先后被选为寿县人民代表或县政协委员。1985年元月，举行基督教代表会议，新选主席唐润身，副主席孙以华、徐涤新，秘书王济琛(兼)。活动较正常，信徒有增加。
基督教福音堂位于东街照壁巷口。始建于民国8年，次年落成。建堂之初，由耿林父经办，买照壁巷口黄姓市房，后由美籍传教士赵伯林负责筹建。砖木结构，正殿35间，天花用红、绿、黄三色，绘制成外方内圆图案，白色天鹅于其中，讲台上挂金十字架；南北侧门上有“真光福地”、“同登圣域”横匾；正门向东，青石台阶，门旁两方花台，两侧树以冬青。外有配房数十间，今不全存。惟大殿维修完好，礼拜活动正常。