一、寿州卫
元至正二十五年(公元1365年)，朱元璋据江淮称吴王，以寿州地处要冲，为临濠之屏障，置安丰卫，军驻寿州。洪武三年(公元1370年)改安奉卫为安丰守备千户所；十三年(公元1380年)改为寿州卫，隶于中军都督府。卫署设在州城西，中振武堂，左经历司，右镇抚司，各有吏舍；署前南为仪门，其东西分列则5卫所署；署设军器局在城西南，军储仓在城东北，教场在城南5里处，中有层台，建演武厅。嘉靖十八年(公元1539年)，御史杨瞻在振武堂西建旗纛庙。寿州卫置指挥16员，经历1员，镇抚1员。卫辖5所，置千户31员，百户58员，军士约五六千人。卫军平时驻防、屯田、运漕，战时应诏出征。明神宗时(公元1573—1619年)卫政败坏，兵不堪用，随田赋实行“一条鞭法”，而实行募兵制。
清初，撤卫所，以两淮漕运事繁，保留寿州卫，置守备官统之，只理漕供差，不管兵。康熙时，五所俱撤；仍保留部分漕运纲军，至光绪时尽撤。
二、寿春营
清初，择要冲设营驻兵。顺治二年(公元1645年)，寿春营设副将1员，驻寿州，为提、镇分守险汛，辖守备3员，千总3员，把总6员，统马战兵240名，步战兵155名，守兵569名；有官坐马、战马280匹。雍正七年(公元1729年)兼辖亳州营、泗州营，增配外委千总3员，外委把总6员，计统马战兵113名，步战兵252名，守兵933名，有官坐马、战马164匹。
三、寿春镇总兵署
清乾隆二年(公元1737年)，改寿春营副将署为寿春镇总兵署(即镇台衙门，今为三中校址)，置总兵官1员，统辖中、左、右、六安、庐州、毫州、泗州7营，隶于江南提督。其内中、左、右3营的主要防地为寿州。
嘉庆八年(公元1803年)，寿春镇总兵改隶于安徽巡抚；十七年(公元1812年)，裁左营，增设颍州营，仍为7营。防地包括凤阳、庐州、颍州3府暨泗州、六安2直隶州所属州县。其驻寿州者，为中营游击1员，守备1员；右营都司1员，千总1员，把总1员(驻正阳关)；外委弁2员(一驻瓦埠，一驻殷家岗)，马、步战守兵521名。另有水兵哨船5艘，驻寿州境内者3，寿州1，正阳八里垛1，东淝河上游石头埠1。
光绪十六年(公元1890年)时，寿春镇总兵官驻寿州，统辖中、右、六安、颍州、龙山、庐州、亳州7营。有将弁164员，其中：
参将1员(统六安营)；
游击3员(中营游击驻寿州，余2员分统龙山营、颍州营)；
都司3员(右营都司驻寿州，余2员分统庐州、亳州营)；守备7员(中营、右营各1员驻寿州，余六安营1员，颍州、龙山营各2员)；
千总9员(中营2员，1驻寿州，1驻霍邱；右营2员，1驻寿州，1驻怀远；另有龙山营2员，颍、庐、亳州各1员)； 把总21员(中营6，分驻寿州、正阳关、凤台、定远、颍上、霍邱；右营3，分驻凤阳、五河、临淮；其余12员分属六安、颍州、龙山、庐州、亳州5营)；
外委弁40员(中营8，分驻寿州、瓦埠镇、下塘集、丁家集、阚疃集、岱山铺、三河尖、河口集；右营6，分驻寿州、长淮、龙亢、上窑、王庄、红心；其余5营共26员)；
额外外委弁67员(中营13员，其中驻寿州4，驻石头埠、朱家巷、八里垛、隐贤集、三觉寺，顾家桥、刘隆集、三流集、江口集各1员；右营12员，驻寿州3员，驻凤阳府，凤阳县、刘府、徐家桥、蚌埠、殷家涧、袁家集、溪河、小溪各1员；其余5营共42员)； 哨官(弁)13员(中营1员驻三河集，右营4员分驻安乐集、凤桥集、燃灯寺、梅家市；其余5营共8员)。
寿春镇总兵所辖7营，马步战守兵共4375名(含当时省抚调练兵1898名)。中、右营的防地为寿州、霍邱、颍上、凤台、定远、怀远，凤阳、五河各县。两营共有马步战守兵1837名(含当时省抚练兵800名)；中、右营之主要将领均驻寿州，游击、都司、守备、千总等署俱在城内，环列于总兵署周围。州城4门与游坊巷、小隅头、梁家拐、州署后营房共8处。城南教场，占地60亩(合市亩约80亩)，场北筑台，台上演武厅5间，厅后有楼3间。州城以外的正阳关、四十店、三十里铺、沙涧铺、众兴集、三觉寺、小甸集、马家集、瓦埠镇、姚皋店、下塘集各处均置有营房。
四、淮上革命军
清宣统三年(公元1911年)九月十五日(阳历11月5日)，寿州光复。次日，宣告淮上革命军正式建立，设司令部于城内东南隅寿州考棚(今县委、县人民政府所在地)。王庆云任总司令，张汇滔、袁家声、张纶为副总司令，张汇滔兼任参谋长。王庆云、张汇滔、袁家声、张纶、廖海粟、段云、权道涵、毕镜波、岳相如、李紫玖、杨穗九、李诱然、王占一13人任军统。司令部兼摄寿州政务，设民政、财政、审判、军械各处，孙仲羽、孙建侯等任处长。定编后的淮上军，有步兵18营，马兵1营，炮兵2营，共2万余人，其中四乡农民、城镇平民参加者万余人，接收改编原寿州总兵镇清军4营数千人。是月中旬，淮上军为支持孙中山先生推翻帝制，以寿州为基地，开始出击各路清军，先后光复皖北23州县。民国元年1月(公元1912年)，淮上军被改编为国民革命军北伐第二路第一军第四师第七、第八两旅，袁家声、张汇滔分任旅长，驻防寿县、凤台、怀远。7月，被袁世凯以扣饷手段缩编裁并。
五、长淮水上警察厅
民国元年(公元1912年)，设长淮水上警察厅于正阳关，由岳相如任厅长，兵力一个支队(团)，以维护淮河航运，保卫正阳关，兼管治安。
六、皖北镇守使
民国2年(公元1913年)，袁世凯在安徽得势，倪嗣冲执安徽军政大权；7月，设皖北镇守使，驻寿县，以原寿春镇总兵署为镇守使署。始由倪嗣冲兼任镇守使，旋委其胞弟倪毓棻接任，以武卫军左翼(相当于一个旅)驻寿。所谓武卫军，原系清军武卫右军，为袁世凯之部属，倪嗣冲为统领，该军分为五路(翼)。民国3年，袁世凯授衔予安徽都督倪嗣冲为安武军上将，倪即将所部武卫右军改称安武军，由5路扩充至8路，分驻于皖境各军事要隘。民国7年安武军由八路改编为五个混成旅。
民国8年殷恭先接任皖北镇守使，率新编安武军数营驻寿。10年6月，驻寿新安武军九营、十二营因闹饷哗变，在寿城大肆抢劫、焚烧，商家损失尤为惨重，引起全城惊慌。在绅商士民强烈要求下，殷恭先下令处决排长1名，士兵数名，参与暴乱的士兵，均被开除。未几，倪嗣冲拥段(祺瑞)失败。11年，安武军名称不存，部队被改编；而新编安武军则被裁撤，士兵全部遣散。
13年春，李传业任皖北镇守使，率所部安徽第二混成旅(李兼任旅长)驻寿；6月，“大刀会”会众因抗税、抗租，起义攻占六安县城，李奉命率部前往镇压，由史俊玉接任镇守使。
14年，高士读任镇守使，率所部驻寿。
15年春，陈调元任安徽省总司令，任其部属刘凤图为镇守使。夏，刘奉命率部移驻皖、鄂边界防御国民军北伐。陈另派部属团长周鼎率军驻寿。自刘离寿后，不再设置皖北镇守使。
七、北路宣慰使署学兵团
民国17年(公元1928年)2月，柏文蔚因反蒋被迫辞去国民革命军第三十三军军长之职，任北路宣慰使，设署于寿县城内西大寺巷(今一中处)，创办学兵团，命孙一中(中共党员)为团长，孙天放为副团长，廖运泽为教育长，廖运周、许光达为教育副官，王积绚为总队长，薛骞为副总队长。团以下设4个中队，吴勤吾、叶守成、张守余、李坦、陶之光等人为中队长、中队副；每中队辖4个区队，每区队约50人。学兵团成立后，建立了中共寿县学兵团特别支部，孙一中任特支书记，廖运周、许光达与4个中队长为特支委员，廖负责宣传，许负责组织。未几，有人向南京国民党当局告密，称“学兵团有赤色分子”，“学兵团被共产党掌握”。蒋介石迫使柏文蔚撤去孙一中团长职务。5月，柏宣布解散学兵团。
八、国民革命军驻寿部队
民国17年，国民革命军第十三师驻寿，师长夏斗寅；是年国民革命军总司令蒋介石视察淮河，由蚌埠来寿县，检阅了该部。次年，蒋桂战争爆发，激战于宿松，夏师调走。安徽省主席方振武派所部一个团来寿驻防，团长宋象鼎，寿县人。9月，宋团调离寿县。10月，石友三接任安徽省主席后，派一个团驻防寿县东南乡。12月，石友三宣布反蒋，就任“护党救国军”第五路总司令，将该团调走。时岳相如等响应李宗仁、白崇禧通电，组织“护党救国军”反蒋，驻寿县城关。春节前夕，蒋介石派一个独立旅(旅长陈耀汉)来攻，岳军以寡不敌众，撤退。接着，国民革命军北路军(总司令陈调元)所属新编第五军(军长叶开鑫)所属一个师来寿，驻正阳关。
九、中共红二十五军
民国21年(公元1932年)4月，中共红四方面军二十五军政治委员刘士奇率军北上，暂驻正阳关。国民党豫鄂皖“剿匪”右路第一纵队指挥官徐庭瑶率陆军第十军第四师来寿，驻于县城，截击中共红二十五军。3日后，红二十五军南返大别山，徐始分兵进驻正阳关，至秋离寿。其后，国民党第三师(师长王均)来驻寿县，不久亦引去。
十、皖北人民抗日自卫军
民国27年(公元1938年)夏，日本侵略军侵占蚌埠、淮南矿区后，攻占寿县县城。石寅生在寿县南乡组成皖北人民抗日自卫军第一路军，石任指挥官，设指挥部于保义集。第一路军下辖7个支队，3个独立大队，共约万余人，有枪五六千支，分驻寿县各地。其中第二支队(支队长郑抱真)驻淮河铁路沿线；第七支队(支队长王绍九)驻淮南南岸，对日军构成很大威胁。冬，安徽省皖北行署自立煌移驻寿县(堰口集王圩孜)，行署主任颜毅仁，令自卫军归其收编直接统率。石寅生当即召开大队长以上干部会议，宣布第一路自卫军立即解散。于是郑抱真、曹云露、赵筹等率所部加入新四军，其余各部大都解甲归田，一小部分被皖北行署拉去改编后，次年2月，随皖北行署移驻定远，不久即被缴械遣散。
十一、桂系等军驻寿部队
民国27年(公元1938年)，抗日烽烟蔓及皖境，至38年年初(公元1949年)寿县旧政权垮台，11年间，桂系人物李宗仁、廖磊、李品仙、夏威、张义纯先后主持安徽军政。国民党第二十一集团军(桂系总司令李品仙)所属一三八师四一二旅(旅长龙炎武)、一七二师第一营(营长萧凤岗)、皖北行署特务营、省保安第九团(团长赵达源)与桂系改编的第八游击纵队、第十二游击纵队以及国民党孙良诚部独立第四团、新编三○师(师长秦汉卿)等部队，曾先后驻扎寿县境内各地。
十二、中国人民解放军九○师
1950年春，中国人民解放军九○师来驻寿县，师部设城内状元街南首吴家公馆(今县人武部址)。其任务是保卫新生革命政权，清剿股匪、参加反霸斗争与土地改革运动。任务完成后，1953年，该师调离寿境。
十三、中国人民解放军6075部队
1961年，济南军区6075部队，来驻寿县石家集；次年移驻保义集8公里处罗陂塘开荒造田，办军垦农场。1969年11月，该部队调离寿县。农场由省农垦厅接管，称国营保义农场。
十四、中国人民解放军高炮团
1962年春，中国人民解放军某高炮团移驻寿县，进行空防战备训练。初，台湾国民党飞机不时骚扰，自高炮团来后，台机不敢复临寿县上空。越年，高炮团调离。