1949年初，全区各县市已全部建立人民政权，为维护城市社会治安，即开始城市户口登记管理，除阜南县当时驻小集镇薛集未建立户籍外，其余阜阳、临泉、太和、涡阳、蒙城、亳县、颍上县和界首市，均在很短时间完成城市户口登记建册注籍任务。涡阳县抽调县、区、街道干部243人，按照6个镇分成6大组，27个街道分成27个小组，分组分街专人负责，用3天时间即完成登记、复查、核实任务。颍上县由公安局组成户口登记委员会，吸收各保保长和一部分积极分子参加，全城21个保组成21个登记小组，用五六天时间即完成任务。各县市城镇户口登记完毕后，同时建立出生、死亡、迁出、迁入和留客住宿的报告制度，便于公安机关随时检查和抽查。界首市通过户口检查，一次就逮捕土匪8人，其中有土匪头子夏金才。颍上县通过临时查户口的办法，在新河镇胡台子一举擒获从外地潜回的惯匪胡良才，缴获手枪1支、子弹10发。
1949年初登记城市户口数

1951年7月公安部颁布《城市户口管理暂行条例》，使城市户口管理制度基本上纳入统一轨道。1953年全国第一次人口普查，完善了城市户口管理程序，奠定了农村户口管理基础。1955年6月国务院作出《关于建立经常户口登记制度的指示》，按照指示精神和公安部的统一部署，全区统一了户口、簿册、证件，健全了户口管理制度。1958年毛泽东主席命令颁布《中华人民共和国户口登记条例》，全区的户籍管理工作，在各级党委和上级业务部门的领导下，完全废除国民党旧的户籍制度，并随着革命斗争形势的发展，从无到有逐步建立健全起来，在维护社会秩序，保护公民的合法权益中发挥重要作用。在“文化大革命”十年内乱期间，户籍管理受到严重干扰，极大地削弱和破坏了正常工作和业务建设，直到粉碎“四人帮”，各县才恢复管理组织，确定专人办理。
城市户口由城市派出所管理。1958年以后，按照《户口登记条例》，严格控制农业人口转为非农业人口、由农村迁入城镇。
农村户口，设有派出所的区镇，以公安派出所为登记机关，不设公安派出所的以人民公社管理委员会为户口登记机关。为便于管理和方便群众，全区实行人民公社和生产大队两级管理制度，按生产队建立户口簿，分别由公社和生产大队保管，公社、大队的户口员(多由公社秘书、大队会计兼任)随时掌握出生、死亡、迁出、迁入四项变动，基本上做到人人有登记，队队有簿册。1982年7月1日全国第三次人口普查前，对城市、农村户口普遍进行一次清理登记，彻底纠正重报、漏报、有户无人、迁出、死亡不注销、出生不登记等混乱现象，城镇人口，全部换发户口簿；农村人口，全部颁发户口簿，建立户口底册，薄册对照，张榜公布，让群众共同监督管理，有效的杜绝了弄虚作假行为，为人口普查奠定了扎实基础。1980年以后各区乡(镇)先后普遍设立派出所，农村户口和非农业户口全部交派出所管理。
船舶户口管理，1955年4月，公安处抽调8名干部组成水上户口登记工作组，经过5个月的时间，在界首、阜阳、颍上、临泉4个港口共登记1640户、1446员船，完成户口登记总数的87%。1963年全面换发水上户口簿册，进一步核实了人口，同时恢复出港、返港、中途停舶登记检查制度。1982年，凡在陆上有户口的船、渔民，分别发给船、渔民证。
集体户口管理，凡居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口，由各单位指定专人(一般由单位会计)，协助户口登记机关及时办理。