民国二十二年（1933年）一月，设凤怀检察署。址设蚌埠旧道尹公署，办理怀远，凤阳两县案件，抗日战争时期解体。民国三十三年（1944年），日伪成立凤阳检察处。翌年解体。民国三十六年（1947年），民国县政府设司法科，司理一般刑、民事案件；重大（政治）案件由县党部和中统调查室办理。
建国后，1951年3月，成立人民检察署，编制7人。1954年改署为院。“文革”初，被砸烂，实行军事管制，1978年9月恢复。翌年增设刑事、法纪检察科及办公室。1982年增设经济检察科。1985年增设监所检察科和控告申诉检察科，编制37人。