清末，蚌埠淮河北岸有世传中医兼营中药铺。津浦线通车后，淮河南岸市面上逐步有专营药店开业，经营中药材。民国7年（1918年），始有西药经营。20～30年代，亳县的白芍、菊花，定远、凤阳的桔梗、柴胡，六安的茯苓，霍山的石斛等药材多经蚌埠运销外地；津沪的西药品也经蚌埠销往淮北、皖西广大地区。全埠经营的中西药品种约1000多种。沦陷后，药品属禁运物资，购销受到严格控制。当时曾有些跑单帮者，将一些成药和外伤用药暗地贩卖到怀远县河溜，再转运到敌后抗日根据地，但也有人被日伪抓获，以资敌罪名处置。抗日战争胜利后，该业复苏。
50年代起，该业陆续经营有中药材、中成药、西药、医疗器械、卫生材料、医用玻璃仪器和化学试剂等商品。1955年药材公司成立时，经营中药材390种，中成药22种。1957年医药站成立时，经营药品器械共1190种。1958年后，地方制药工业兴起，地产药品经销逐年增多，至1965年，医药站收购地产品占该站购进额的35％。此期，中西药品及医疗器械除供应本地外，还销往周围32个县市。1985年，市药材站经营中药材620种，中成药480种；医药站经营药品2003种，器械875种，试剂1003种，医用玻璃仪器310种，计5291种。全年中西药品纯购进2555万元，其中地产品收购占60％；加上存货，在供应区纯销售6731万元。同年，该类商品供应范围为蚌埠和周围11个县。
药品、医疗器械商户网点：
清宣统年间，有中医吴若昆等人在小蚌埠行医兼营中药铺。民国成立后，淮河南岸商业兴起，有瑞生堂、李万生中药店开业。民国7年(1918年)，上海五洲药房在蚌开设分店，为市第一家西药店。民国20年，在二马路开设有华美西药房，货源由上海华美药房提供，批零兼营；同年，庐江人王仲章在二马路开设王恒昌中药房。民国21年，有老大年、东万生、西万生、一得生、德和裕等诸家药店开业。民国23年，镇江人倪荣之在中山街口开办罗威西药房，后改为中法药房。民国33年，北京同仁堂药店伙计李瑞来蚌，在王恒昌药号东首开设同仁堂药铺。民国35年，亳县人高振玉在华盛街开设振祥中药号。解放前，中西药店最多时70余户，其中，中药店50余户，西药店20余户。西药店多分布在今凤阳路，东到国富街口，西到青年街口，主要有宝威、华美、中华、华生、仁济、新中华、大华、万国、太和、宝华、五洲、生生、健康、中法、济华堂等字号。中西药店，除德和裕、王恒昌、五洲、中法等药店稍具规模外，一般药店只有店员2～3人，资金数百银元。到解放前夕，全市仅剩中药店30户，西药店16户。
建国初1951年，市有中药店71户，西药店25户。1953年和1955年，相继设立市国营医药公司和药材公司，并各自设有经营门点。1956年，私营中西药店有的实行公私合营，有的走合作化道路。1957年，蚌埠分别成立医药、药材采购供应站。70年代后，随着人口的增加，经营网点增多。1984年，医药工业和医药商业实行统一领导，成立市医药总公司。1985年，医药商业有药品采购供应站2个，贸易公司1个，批发部7个，零售药店14个，职工总数482人，均归口由市医药总公司管理。其中，市药材站下设批发部、中药经营部、医药经营部、康民医药经营部及万春国药店、王恒昌药店、车站中药店、朝阳医药商店、东风医药商店等，市医药站下设医药批发部、药品批发科、器械批发科、淮河路医药商店、胜利路医药商店、前进路医药商店、知青商店、金凤商店及第三门市部、药品门市部、器械门市部等。
王恒昌中药店属老字号中药店，民国20年由庐江人王仲章创办。该店讲究饮片质量，药材经过挑、颠、洗、浸、刷等加工，对色、香、味及刀工都严格要求。配方抓药，一味药一包，便于大夫和病家核对，以取得信誉。该店经营药材和丸散膏丹多达1000多种，在别处配不到的中药，大多可在该店配到，由此名声远播。药店日夜经营，并代客煎药、送药到家。该店开业后，经营一直盈利。1956年公私合营后，成为国药商店第四门市部。1960年，改为市医药公司第四门市部。“文化大革命”期间，老店特色丧失。1984年，市药材采购供应站恢复王恒昌药号老字号，由王仲章之孙王纯治任该店副主任。复号后，门面装饰一新，传统服务项目逐步恢复，并聘请3位有40年经验的老药工切制饮片，加工丸药，恢复坐堂行医、代客煎药等服务项目。1985年，该店销售额39万元。
中法药房属老字号西药店，民国23年由镇江人倪荣之在中山街口开办。该店初名罗威药房，后因其对门中法药房歇业，更名为中法药房。沦陷初期曾一度歇业，后改在二马路恢复营业。其经营药品上百种，以零售为主，兼营批发。沦陷后期，该药房再度歇业，抗战胜利后再度复业。民国37年“八·一九”限价后，该店受到损失，经营惨淡。民国38年解放，生意好转，至1955年公私合营时转为他业。
振祥药号属老字号西药店。民国35年初，位于亳县的祥记药号为扩大经营，来蚌埠华盛街租房18间开业，名为振祥药号。该店由亳县人高振玉经营，只营批发。一般将药都亳县中药材运蚌后，南销上海，西销郑州，北销天津，同时将福建、广州、上海、郑州、天津及东北等地药材带回本地再批发。1955年，该店并入国营药材公司。
蚌埠医药采购供应站位于凤阳路437号，属二级站。该站成立于1957年7月，称中国医药公司安徽省蚌埠采购供应站，从业人员45人，经营西药、医疗器械、化学试剂等1190种。1960年，蚌埠中药材采购批发站与之合并，改名为蚌埠专区医药采购供应站，中西药合并经营。1961年6月，易名为安徽省卫生厅药政管理局蚌埠医药采购供应站，至1964年1月，交回省商业厅管理，更名为安徽省蚌埠医药批发站。1984年7月，改称省医药公司医药采购供应站，中药材经营划交已恢复的蚌埠药材采购供应站。该站担负地产药品收购、药品调拨、急救药品供应和药品、医药器械储存等业务。1982年前，调拨业务占总销售额的95％，1983年占91％，1985年降为44％。建站以来，累计销售额9.6亿元，年平均3300万元，其中中药占17％；累计实现利税1203万元，年均41万元。1985年，全站有职工231人，拥有3个批发部、8个零售商店，固定资产143万元，仓库5020平方米，经营西药2003种，医疗器材875种，化学试剂1003种，玻璃仪器310种，年纯销售额2418万元，利税26万元。
蚌埠药材采购供应站位于凤阳东路，属二级站。该站成立于1955年9月，称中国医药公司安徽省蚌埠中药材采购批发站。1960年，该站合并到蚌埠专区医药采购供应站，与西药经营合一。1984年7月，恢复成立省医药公司蚌埠药材采购供应站，至1985年，经营中药材620种，中成药480种，辖经营部、批发部、药店等网点9个。