县境的渡口多为季节性渡口。汛期水势凶猛，水位很高，两岸之间的交通只有凭借渡船。到了桔水季节，水势猛降，水位变低，有些地方的河床依稀可见，这时，渡船的作用便大大减弱，部分河道涉水即可渡过。
境内有两处较大的渡口，即孙疃渡口和濉溪口渡口。
孙疃渡口位于孙疃集北浍河上。清代和民国时期，商旅、行人均靠渡船过河。建国初期，在此建了一座低水位木桥，汛期靠渡船维持交通，枯水季节，靠木桥过往行人。1974年5月，洪水暴发，一只渡船翻沉，造成了13人死亡的严重事故。1980年，在渡口旧址下游约500米处建造了一座大型现代化桥梁，渡口停用。
濉溪口渡口位于濉溪镇东关老濉河上。清代和民国时期，此处是重要的交通枢纽和物资集散地，渡口两岸各有数十级石阶，便于行人上下船。每逢集日，10多只木船渡人载货，十分繁忙。建国后，濉河改道，渡口废弃。
此外，清代和民国时期境内各河道设置的渡口还有10余处，计有濉河上的古饶渡、陈路口渡；南沱河上的艾桥渡、徐楼渡；王引河上的仲大庄渡、刘桥渡等。建国后随着桥闸增多，渡口日渐减少，目前，仅少数河道存有渡口。