据史料记载，古代县境有通航河道3条，即隋运河、濉水和浍河。
隋炀帝时开凿的大运河（又称通济渠），横穿县境中部，我国东南地区的物资，主要是经这条运河送往洛阳，它对促进中原和江淮地区间的经济、文化交流起了重大作用。唐宪宗元和八年（公元813年），宰相李吉甫编纂的《元和郡县图志·卷五》这样写道：“公家运漕，私行商旅，舳舻相继，隋氏作之虽劳，后代实受其利焉。”唐杜佑撰《通典》中也载，运河之上“运槽商旅，往来不绝。”唐、宋时期县境内的商业大镇柳孜镇和蕲泽镇，均在运河沿岸。柳孜镇有一座停靠船只的大码头，群众至今仍称为“柳江口”。南宋以后，运河逐渐淤塞，失去通航条件。濉水古为大川，河床宽，河槽深，水量充足，县境内通航里程41公里。春秋战国时期，北经萧县境内白渎水与古汴水相通；隋唐时期南通隋运河，为淮北一带水上交通要道、浍河古称涣水，发源于河南省商丘县西北谢集，古代航运比较发达。三国曹魏时期，曹操曾在浍河岸边的铚城（现临涣集）建造粮仓，为方便粮食内调外运，在浍河北岸开挖一条大沟通至城内。至今大沟痕迹依稀可见，人们称为“运粮沟”。
民国时期，濉水（濉河）和浍河仍可通航。30年代初期，乡绅周歧山利用濉河外运煤炭。浍河沿岸有码头数处，其中以临涣、孙疃两个码头较大。临涣集拥有10余只木船，专营浍河运输业务。
建国后，濉河经过4次治理，桥涵增多，运输能力大为减弱。浍河仍有船民从事航运。1958年以后，浍河逐渐淤浅，加之桥涵增多，失去通航条件。1970年，新汴河竣工，县境内的南沱河为其上游，南沱河四铺闸以下可进行航运。1984年，我县曾组织船队从四铺闸起航，经新汴河进入淮河，再入长江直达上海。