一、市第一制药厂
一药厂坐落在市国庆中路，拥有固定资产812.25万元，净值645.12万元，流动资金1006万元，有各类设备414台套，年处理药材1440吨，粉碎能力350吨，制微丸能力1.3亿支，压片10亿片、冲剂400吨，胶囊2亿粒、大蜜丸200吨。产品注册商标淮河牌。全厂职工476人，其中技术人员52人，高级职称1人，中级职称14人，初级职称37人。
一药厂是1958年4月在市药材公司中成药加工组的基础上建成的。当时厂址设在田家庵淮舜北路卫生局院内，仅有7间草房，生产小儿奇应丸、六神丸、紫雪丹、大蜜丸、水丸等。生产工具简陋、工艺落后，手工操作。职工39人，拥有流动资金15400元，当年完成工业总产值63600元，实现利润3300元。1959年兴建新厂，1960年迁入。
1963年开展新品种的研制工作，1966年试制出桑菊感冒片、银黄解毒片等中药片剂。有20多个产品很快在东北、西北、华北等地区打开了销路。1964年，该厂改铁锅和水泥池为蒸汽提炼、紫铜管浓缩，并用蒸汽排管炕房干燥代替了马路凉晒和土炕房干燥法。购置水丸糖衣锅，淘汰了手工搓丸生产工艺。大蜜丸剂型生产使用混合机、拌料机、搓条机、割丸机和灭菌干燥箱，工效提高了几十倍，产品质量得到了保证。
1969～1980年，中、西药两大类同时生产。西药类阿斯匹林年产120吨，安乃近年产30吨，还有部分片剂品种。几年中经上海、天津口岸共出口阿斯匹林191.67吨。后来生产普鲁卡因，填补了省内一项空白。1980年，先后新建了丸剂、提取、前处理及微丸综合制剂楼，改造了片剂、冲剂、水丸车间，共投资656万元，完成建筑面积8959平方米，改造面积1035平方米。
一药厂十分重视产品质量。小儿奇应丸1982、1988年两次荣获国家银质奖，1983年获全国儿童生活用品优秀奖。六神丸、板兰根冲剂分别获省、部优质产品奖。咽喉消炎丸获国家医药局优质产品奖及国家银质奖。小儿止泻冲剂获1985年全国儿童生活用品优秀新产品金鹿奖。1982年至80年代中期，优质产品年产值占全厂工业总产值75.6%，企业利税增至百万元以上。1990年产值2489万元，销售收入1757.84万元。
二、市第二制药厂
二药厂位于国庆西路，是以生物发酵为主的厂，主要生产抗生素原料药、西药制剂、葡萄糖、玉米淀粉、味精等，注册商标淮建牌。拥有固定资产原值2740.06万元，净值1900.06万元，1990年完成工业总产值5218万元。全厂共有职工1158人，其中工程技术人员93人。
二药厂的前身是市酱园厂，始建于1954年。1958年为扩大生产门路，生产液体味精获得成功。1960年生产粉状味精750公斤，1962年产量达1.12吨。1964年1月18日正式与酱园厂分立，成立市味精厂，厂址设在酱园厂部分场地，生产厂房有2364平方米，辅助车间250平方米。
1966年初，二药厂筹建年产味精300吨的新厂。在生产味精的同时，移植试制土霉素碱，1971年4月成立土霉素碱车间，同年10月投产。1972年试制卡那霉素成功，11月18日将市味精厂更名为淮南市第二制药厂。自1974～1978年，先后扩建了制剂车间、玉米淀粉车间及生产配套设施。1978年工业总产值达642.1万元，，创利润110.38万元。
1978年以来先后新建了土霉素发酵车间、味精发酵车间、科研大楼，新增了锅炉、空压机等，使主要产品产量大幅度上升。1987年投资2502万元新建了年产40吨林可霉素的生产车间，使二药厂跻身于国家大二型医药工业企业行列。1980年，经安徽省人民政府批准，在市第二制药厂内成立安徽省医药技工学校，隶属省医药局和市化工局领导，为省内医药行业培养专业技术工人。
三、市第三制药厂
三药厂位于田家庵区东部，拥有固定资产841.24万元（净值572.30万元），职工609人，其中技术干部81人，高级职称1人，中级职称12人。主要产品是合成原料药扑热息痛、二丙谷酰胺、甲硝唑、天冬素、阿斯匹林、盐酸普鲁卡因、血防药等，还有多种西药片剂、大输液、膏剂、囊剂、散剂和冲剂等近百种产品，注册商标淮舜牌。
第三制药厂的前身是安徽省建设兵团一师制药厂。1970年初，省建设兵团一师医院在田东东风钢厂原食堂筹建制药厂，试制成功大输液。是年9月，成立了安徽省生产建设兵团一师“五七”制药厂。1975年9月，移交市化工局管理，更名为淮南市第三制药厂。
1981年7月，第一制药厂西药车间并入第三制药厂。当年生产大输液121.89万瓶、阿斯匹林25.625吨、片剂7310.25万片，完成工业总产值289万元。1982年，成立了新产品开发试验室，工程技术人员在上海医学院的帮助下研制成功合成新药二丙谷酰胺。1983年，在国内首创新药安降片。1984年，新建了一座1954平方米的大输液生产楼，安装了半机械化联动作业线。经过3年的努力，实现年产值1071万元，销售收入1000万元，创利税100万元。
1985年新建了2406平方米的片剂生产楼，新增33冲压片机10台及相应设备，改造安乃近车间，安装扑热息痛生产线。1984～1989年，建成了大输液、片剂、合成及机修4个车间，开发出近80个新品种，其中有3个品种被评为省优质产品，一个产品获部优质产品称号，年工业总产值达到2181万元，5年翻了一番。1990年完成工业总产值4061万元，销售收入3192.99万元。
四、市第四制药厂
四药厂是在第一制药厂1972年2月成立的“五七”厂的基础上发展起来的。1977年，自筹资金8万元，新盖厂房400平方米，1978年投产，主要产品有大山楂丸、山楂冲剂、清凉油、解热止痛散等，经济上独立核算、自负盈亏。经过几年努力，1981年取得了省发给的药品生产许可证。1983年12月升为大集体企业，更名为淮南保健药厂，1985年又更名为淮南市第四制药厂。陆续购置了大蜜丸机、粉碎机、化验仪器，自制了沸腾干燥床等，固定资产达60万元，生产品种11个。
1987年在国庆西路建新厂，厂区占地面积16667平方米，建筑面积12000平方米，其中提取楼660平方米，制剂楼3000平方米，立体仓库3235平方米，检测中心1600平方米。1990年搬入新厂，生产中成药蜜丸、冲剂、口服液、糖浆、膏剂以及西药片剂、胶囊等多种剂型60余个品种，注册商标天宫牌。
1990年有职工461人，其中工程技术人员80人，拥有固定资产234.42万元（净值209.8万元）。完成工业总产值2136万元，实现利税113.24万元。
五、市第五制药厂
五药厂的前身是第三制药厂的“五七”厂，原址在淮南卫生学校院内，曾立名为第四制药厂，1983年更名为市医药用品包装厂，1986年10月改为市第五制药厂。
五药厂成立前，在三药厂扶持下，生产医药用包装品。从1984年开始，在原生产设备的基础上，经过改造生产解热止痛散，眼药水、糖浆、十滴水等11个品种药品，职工为110人。
1986年，迁入国庆路现址，同年底建成锅炉房200平方米。1986年后，边搞基本建设边扩大生产规模，先后6次征用土地计35373平方米，总投资3503万元，建成近20000平方米的生产车间和生活设施。
至1990年底，五药厂拥有固定资产原值629.39万元，净值为514.51万元。职工总人数为766人，其中技术人员36人。主要产品有合成原料药、中西片剂、胶囊、酊水剂、散剂等6大系列100多个品种，注册商标山河牌。扑热息痛原料药年产800吨，片剂年产24亿片，胶囊56亿粒。1990年完成工业总产值5161万元，销售收入3983.04万元，利税125.94万元。
六、市第六制药厂
六药厂源于市二药厂的“五七”厂，始建于1973年，当时仅有60人。1980年“五七”厂上升为大集体，生产兽药，定名为淮南市兽药厂。1983年试产出了第一批兽药水针，并一次检验合格。1984年底兽药水针正式投产，当年创产值150.5万元，利税19.8万元，固定资产增加到45.17万元。
1986年由二药厂内迁至新厂址（二药厂东百米），由单一生产兽药扩大为生产人用药。先后建成水针生产线、片剂胶囊2个车间，生产3个剂型20多个品种。1986年全厂实现产值446万元，利税52.44万元，固定资产增加到85.17万元。1986年11月3日成立市第六制药厂。1988年粉针产品，次年完成产量535.5万瓶，创产值268万元，实现利税13.4万元。1990年完成工业总产值3332万元，实现利税206.44万元。建有水针、粉针、片剂等6条生产线，生产5大剂型78种产品，注册商标淮新牌。