一、疟疾
建国前，淮南地区疟疾发病率极高。建国后，党和政府十分重视疟疾防治工作，一度将疟疾年均发病率、发病总数50年代为22‰、57128人，控制到60年代的9.3‰，49184人。“文化大革命”期间，卫生防疫工作遭到严重影响，1970年疟疾发病总数由1969年的3918人上升到10400人。1970～1979年，发病人数224784人、发病率28.98‰，发病人数在同期传染病发病人数构成比中占54.91％。1981～1983年疟疾发病率又有所上升，发病人数、发病率分别为27254人、2.67％，33479人、3.26％，34266人、3.34％。1985年，在继续坚持预防为主、防治结合、突出重点的基础上，把主要精力放在消灭传染源上。1986年，市卫生局印了《淮南市疟疾防治措施》，疟疾防治工作进一步加强，同年发病1428人，发病率1.32‰。至1989年底，全市发病人数下降到489人，发病率0.42‰。
二、丝虫病
建国前丝虫病流行相当严重。1951年在大通对矿工及家属进行调查，阳性率为19.2％，其中有体征者占49％。1958年普查矿工115797人，阳性率6.84％。1972～1973年组织300余名医务人员，普查413072人，微丝蚴阳性率5.2％，并对查出的21871名患者进行了治疗。1978～1981年，在全市范围内进行了4次调查，血检22374人，阳性率达7.65％，并对其中3751名患者进行了治疗。1985年征兵体检，血检670人，阳性率仅为0.26％。
三、钩虫病
1951年开展钩虫病普查工作，普查结果表明，钩虫病感染率为62.9％，井下工人高达75.03％。1973年采用钩虫抗原皮肤划痕试验，在全市范围内开展普查、普治工作，共普查269381人，阳性率为36.45％。1977年在矿区普查3787人，根据资料分析感染率仍以井下工人为最高，达71.7%。1982年在新庄孜矿对513名井下工人进行调查，阳性率为10.1％。1988年对全市9834名中、小学生进行肠道寄生虫病普查，发病2201人，带虫率为22.38％。随着卫生条件的提高，卫生习惯的改变，加强粪便管理及开展驱虫治疗，钩虫病的发病率现已明显下降。
四、头癣病
1979年，根据省头癣病防治工作规划要求，开展头癣病防治工作。1980年全市共查出头癣病人946名（含凤台县642人），并用硫磺膏进行了治疗。1982、1983年派出专业人员成立调查组深入基层调查，经两年努力，共调查全市22个公社、189个大队、1101个生产队，查出头癣患者307名，治愈300名。1984年组织二次考核验收后，报省验收达到国家规定的基本消灭要求。1985年后未发现新病人。