九龙岗站位于大通区九龙岗北侧，民国23年（1934年）建成。次年2月投入运营，办理客、货运输业务。因是煤矿局所在地，特设三等站。1951年2月济南铁路管理局调整为二等区段站，成为淮南市铁路运输的枢纽。除担负九龙岗煤矿的煤炭和南山石料场的石料外运任务外，还担负九龙岗至蚌埠、裕溪口、八公山3个方向的车流组织，列车编组、解体，车辆检修，机车更换等技术作业。1987年初，淮南西编组站投入使用，列车技术作业转移到淮南西站，九龙岗站改为三等中间站。
建国前九龙岗站有站线6股，东西走向，站房在线群北侧。由北向南1、Ⅱ、3、4道为列车到发线，5、6道为调车线，供机车转向的三角线设在车站西端，衔接在正线上，跨入区间属车站管理。段管线有工务材料线1股、车辆检修线2股、机务段和机厂线11股。新中国成立后，经过1950年、1958年、1963年、1976年、1989年5次较大的扩建、改造，Ⅰ、3、Ⅱ、4、6股道为列车到发线，有效长由建国前的500米左右延长到850米以上，建成隔离的机车转头三角线和有效长228米的调车牵出线、102米的安全线、413米的货物线。旅客候车室、货物仓库和其它站舍也有了改进。段管线由于九龙岗机务折返段撤销、九龙岗车辆段西迁，工程段线现仅存1976年建成的144米，原九龙岗车辆段车库线改为合肥大修段存车线。
与九龙岗煤矿衔接的煤矿专用线为民国35年（1946年）11月建成，距九龙岗站908米。因出岔于九龙岗站至大通站区间，设辅助所，归九龙岗站管辖。1951年九龙岗煤矿开凿九号井，新修专用线，原线于1952年拆除，辅助所撤销。与南山石料场衔接的专用线建成于民国22年初，在原淮南线12公里+280米处出岔，距九龙岗站2.05公里，因在九龙岗站至水家湖站区间，设辅助所，归九龙岗站管辖。1958年九龙岗站站场改造，将南山石料场专用线延伸至九龙岗站内，辅助所撤销。
九龙岗站除担负列车编解技术作业外，还是一个客、货运站。建国前，九龙岗矿、南山石料场生产的煤炭、石料主要通过九龙岗站运出。建国后九龙岗站继续承担九龙岗煤矿、南山石料场的产品外运任务。第一个五年计划期间，九龙岗站年发送旅客40万人次，装车1.989万辆、卸车2624辆；第二个五年计划期间，年发送旅客53万人次，装车2.341万辆、卸车3590辆；第三个五年计划期间，年发送旅客17万人次，装车1.539万辆、卸车1960辆；第四个五年计划期间，年发送旅客18万人次，装车1.347万辆、卸车1773辆；第五个五年计划期间，年发运旅客23万人次，装车1.171万辆、卸车2018辆；第六个五年计划期间，年发送旅客19万人次，因九龙岗煤矿资源逐渐衰竭，装车仅3603辆、卸车1464辆。1990年发送旅客9万人次，装车4296辆、卸车473辆。