合肥市境内河流，以江淮分水岭为界，分为长江、淮河两大水系。长江水系主要河流有南淝河、派河、丰乐河、杭埠河和滁河；淮河水系主要河流有东淝河、阎涧河、沛河和池河。
由于古地质构造形成的江淮分水岭地貌格局，这些河流均发源于江淮分水岭脊线两侧高岗地带，为山丘雨源型河流，倾斜度大，河流坡降陡，流经地为岗丘、平缓坡地、低洼平畈3种地貌。降大雨时上游汇水迅速，奔腾而下，下游平缓低洼地带渲泄不及，洼地即潴水成灾。建国后，为了改变这种状况，变水患为水利，市、县(区)、乡各级人民政府领导人民，对这些主要河流进行了不同程度的治理。经过治理的河流，洪涝为害程度大有降低，开发利用水资源兴利建设，卓有成效。
对于这些河流的治理，总体来说，都还属于初步治理。防洪标准还较低，稍遇较大降雨就会遭受灾害。此外全市境内尚有40多条河流未曾治理。这些河流，有的经常泛滥成灾；有的水来漫出河床，水去河干滴水不存；有的上游水土流失严重，河道几乎淤为平地。