合肥市地处安徽省中部，长江、淮河之间，横跨江淮分水岭。中部丘陵地带大小水库众多，并有瓦东、滁河两大灌渠，塘堰星罗棋布，南有巢湖，北有高塘湖、瓦埠湖。江淮分水岭北侧属淮河水系，长丰县境内的庄墓河、沛河分别流入瓦埠湖、高塘湖，再流入淮河；南侧属长江水系，丰乐河、派河、南淝河均汇入巢湖，流入长江；肥东境内的滁河流入长江。
据1983年统计，合肥市总水面1149465亩，占全省水面积的7.27%；占全市土地面积的10.5%。
合肥的渔业水域可分为池塘、水库、湖泊、河沟4种类型。据1984年《合肥渔业区划》记载：总水面1149365亩，其中池塘405298亩，水库281367亩，湖泊412500亩，河沟50200亩；可养水面543478亩，其中池塘341611亩，水库197193亩，河沟4674亩。