无脊椎类
种类众多，仅昆虫类就有几万种。
昆虫少数是益虫，其中主要有家蚕、蜜蜂、蜻蜓、螳螂等。危害水稻生长的主要有稻蓟蚂、稻纵卷叶螟、二化螟、三化螟、大螟、稻飞虱、稻叶蝉、稻苞虫等；危害蔬菜生长的主要有芽虫、菜青虫、小菜蛾、黄条跳甲、菜螟虫、斜纹夜蛾、小地老虎、红蜘蛛、豆荚螟、猿叶虫、葱蓟蚂等；危害树木生长的主要有松毛虫、松梢虫、黑翅土栖白蚁、松褐天牛、光肩星天牛、云斑天牛、大袋蛾、杨扇舟蛾、柳毒蛾、榆掌舟蛾、豆天蛾、扁刺蛾、黄刺蛾、竹笋夜蛾、柳兰叶甲、榆绿叶甲、刺槐小皱蝽、刺槐种子小蜂等。
无脊椎动物常见的还有蚯蚓、蜗牛、蚌、螺、虾、蟹、蜘蛛、蜈蚣、蟋蟀、蚂蚁等。
鱼类
合肥市水面广阔，鱼种繁多，已知有72种，隶属于10目21科。这些鱼类绝大部分属于湖泊定居性鱼类，部分属于河湖洄游性鱼类。
巢湖和南淝河等水域有白鲟、长颌鲚、银鱼、太湖短吻银鱼、胭脂鱼、鲫鱼、鲤鱼、马口鱼、青鱼、草鱼、鳤鱼、鳡鱼、赤眼鳟、逆鱼、银鲴、黄尾密鲴、白鲢、鳙鱼、花、中华鳑鲏、采石鲋、兴凯鳑鲏、斑条刺鳑鲏、寡鳞刺鳑鲏、泥鳅、鲶鱼、乌苏里鮠、大鳍鳠、长鮠、鳗鲡、鱵鱼、鳉鱼、乌鳢、黄鳝、鳜鱼、大眼鳜、圆尾斗鱼、沙鳢、吻虾虎、三线鳎、刺鳅、星弓斑圆鲀等60多种。
在郊区水库、沟渠和池塘里放养的鱼类除青、草、鲢、鳙、鲤、鲫、长春鳊、三角鲂、银鲴外，还引进有细鳞斜颌鲴、团头鲂、杂交鲤、荷元鲤、镜鲤、大阪鲫、东北鲫、莫桑比克罗非鱼、尼罗罗非鱼、异育银鲫等新品种。
两栖类和爬行类
种类较少，多在田野、河湖边生活。
两栖类动物已知有18种，隶属于无尾目的4科。其中，蟾蜍科有中华蟾蜍(癞蛤蟆)，雨蛙科有无斑雨蛙，蛙科有泽蛙(土蛤蟆)、黑斑蛙(青蛙)、金钱蛙、虎纹蛙(土墩子)，姬蛙科有饰纹姬蛙、北方狭口蛙(气蛤蟆)。
爬行类动物已知有13种，隶属3目7科。其中，龟科有乌龟，鳖科有鳖(甲鱼)，壁虎科有多疣壁虎，石龙子科有石龙子(四脚蛇)，蜥蜴科有北草蜥，游蛇科有钝尾两头蛇、赤链蛇、王锦蛇(菜花蛇)、红点锦蛇(水蛇)、黑眉锦蛇(称星蛇)、赤链华游蛇(水赤链)、小头蛇(秤杆蛇)，蝰科有腹蛇(土呆子)。
逍遥津公园中饲养的国家一级爬行类动物有扬子鳄、蟒。
鸟类
合肥市区森林面积很小，鸟类不多，已知有154种，它们隶属于15目37科。其中大部分为留鸟，如黄臀鹎、丝光惊鸟、乌鸫、八哥、画眉、麻雀、大嘴乌鸦、红头长尾山雀等。部分为候鸟或旅鸟，如白腹姬鹟、白腰草鹬、黑卷尾、池鹭、北灰鹟、普通燕鸻等。
著名益鸟和珍稀鸟类中，属于国家一级保护鸟类有白肩雕；国家二级保护鸟类有鸳鸯、鸢(老鹰)、赤腹鹰、雀鹰、普通、红嘴鹗、雕鸮、长耳鸮、短耳鸮、燕隼、红隼、灰鹤、小鸦鹃等13种。省一级保护鸟类有鹰鹃、棕腹杜鹃、四声杜鹃、大杜鹃(布谷)、中杜鹃、普通夜鹰、蚁鴷、黑枕绿啄木鸟、斑啄木鸟、棕腹啄木鸟、家燕、金腰燕、灰喜鹊、寿带等14种；省二级保护鸟类有大白鹭等26种。
逍遥津公园饲养的国家一级保护鸟类有白鹳、黑鹳、白尾海雕、丹顶鹤、白鹤、白头鹤等；国家二级保护鸟类有白琵鹭、大天鹅、小天鹅、白雕、白冠长尾雉、白枕鹤、白额雁、秃鹫、红腹角雉、蓝马鸡、白鹇、红腹锦鸡、白腹锦鸡、蓑羽鹤、绯胸鹦鹉、斑嘴鹈鹕等；省级保护鸟类有红嘴相思鸟、绿头鸭、针尾鸭、罗纹鸭、赤麻鸭、绿翅鸭、白眉鸭、潜鸭等。其中丹顶鹤已繁殖成活多只，为我国动物园首例。
农产和饲养场饲养的家禽主要有鸡、鸭、鹅、鸽、鹌鹑等。
兽类
合肥市区绝大部分地区为平原和缓低岗，野生兽类已知有19种，隶属于5目9科，其中啮齿目、食肉目和翼手目占优势。小家鼠、黑线姬鼠、黄胸鼠(屋上鼠)、褐家鼠(粪鼠)、黄鼬(黄鼠狼)、草兔(野兔)、小伏翼(檐老鼠)等数量较多。黑线仓鼠、棕蝎、北方刺猬、小麝嗣等较为常见。大仓鼠、狼、红狐、狗獾、水獭、豹猫(野猫)也有少量分布。
逍遥津公园中饲养的国家一级保护兽类有白眉长臂猿、豚尾猴、獭猴、虎、金钱豹、云豹、蒙古野驴、西藏野驴、黑麂、白唇鹿、梅花鹿、北山羊等；国家二级保护兽类有猕猴、金猫、大灵猫、豺、黑熊、棕熊、黄麂、马鹿、黑鹿、岩羊等；省级保护兽类有貉、花面狸、猪獾等。其中黑麂繁殖成活多只，为世界罕见。
农户和养殖场饲养的家畜主要有黄牛、水牛、奶牛、马、驴、骡、猪、山羊、绵羊、兔、貂以及猫、犬等。