河流
南淝河南淝河古称施水，其源头有二：北源在肥西县长岗乡邓店村西侧，南源在肥西县将军岭乡将军岭，两源于鸡鸣山汇合，向东南流入郊区，进董铺水库，穿合肥城区，再转向东南流经合肥郊区和肥东县边界，于施口注入巢湖。
南淝河流经合肥城附近的河道，几经变迁。唐代，南淝河沿合肥古城金斗城北缘流过，此段称金斗河。南宋乾道五年(1169)，扩建城地，金斗河括入城内，在其进出城处分别设西、东两水关。明正德六年(1511)，封闭水关，南淝河顺北护城河东南流。金斗河淤塞成沟，解放后填沟筑路(即淮河路～中菜市～长江剧院北墙向东一带)，成为被掩埋的一条古河道。
南淝河全长70公里，流域面积1700平方公里，在合肥市区内长约60公里。
南淝河自河源至合肥市区亳州路桥为上游，长38公里，河床宽6～10米，水深1～2米；自市区亳州路桥至屯溪路为中游，长5.5公里，河床宽20～80米，水深2米；屯溪路桥至施口为下游，长26.5公里，河床宽50～100米，水深2米左右。
南淝河水位随季节变化很大。夏季，流域内降水丰富，河流水位较高；冬季，流域内降水少，河流水位较低。河流水位年际变化也较大。北门桥正常水位为8米左右，历年最高水位为16.19米(1954年)，历年最低水位为6.49米(1956年)。1978年11月10日，芜湖路桥以上河道干涸。
根据资料计算，南淝河合肥北门水文站水位为：5年一遇12.8米，10年一遇14.7米，20年一遇15.09米，50年一遇16.18米。5、10、20、50年一遇洪峰流量，分别为250、500、700、1000立方米／秒。该河段安全泄洪量为400～600立方米／秒(1988年断面)。
南淝河洪、枯水位变幅4～6米，起落时间48小时。汛期易受巢湖水位顶托，每遇暴雨常危及堤防和市区安全。
南淝河典型水位及其影响因素

解放后，国家对南淝河进行了治理。在上游，兴建董铺、众兴、三十头、张桥、蔡塘、大官塘、泗水、梅冲等大中小型水库。在中游，建成防洪闸9座，排涝泵站13座，防洪堤6.1公里，防洪墙4.7公里，并多次疏浚河道。现在，这些水利工程发挥了效益，大大削弱了洼区的水患，增强了岗区的抗旱能力，并为航运、养殖、供水提供了有利条件。但由于城市工业污水和生活污水排入，南淝河水质日趋恶化，下游尤甚，亟待治理。
南淝河全流域有8条支流：
一、四里河，又名三岔河，发源于长丰县土山乡青岭村，南流至大杨店乡赵山村进入合肥郊区，于郊区磷肥厂附近注入南淝河。全长24.7公里，流域面积221.3平方公里。上游建有泅水、大官塘、梅冲3座中、小型水库。
二、板桥河，古名皇陵庙南水。其源头有二：西支源于长丰县双墩乡邵岗村，东支源于长丰县吴店乡尚岗村。两支在长丰县三十头乡阁坡附近汇合，南流至张洼乡大店村进入郊区，再于双岗东侧注入南淝河。全长26.25公里，河道平均坡降0.77‰，流域面积177.3平方公里。上游建有三十头、张桥、蔡塘3座中小型水库，中游建有王岗滚水坝。
三、史家河，古名小史港，发源于长丰县南部，南流经郊区张洼乡，至东市区穿过矿机厂大院入南淝河。全长12公里，流域面积63平方公里，建有节制闸、涵洞等。
四、二里河，古名九曲水，发源于郊区常青乡五里洼附近，东北流至雨花桥入南淝河。全长5.2公里，流域面积12.7平方公里。二里河地面高程在15～42米有10平方公里，低于南淝河水位(15米以下)的有2.7平方公里，一遇暴雨，下游省体育场一带，常受洪涝灾害。80年代，开辟了新河口，出水较前流畅。
五、二十埠河，又名龙塘河，发源于长丰县三十头乡南部，大致沿合肥郊区与肥东县边界南流，在肥东县龙塘乡程马圩与三十埠河汇合后，再南流至和尚口注入南淝河。二十埠河全长27公里，流域面积161平方公里。下游水流平缓，常年通舟楫。
六、十五里河，发源于大蜀山南侧，东南流至马家渡入南淝河。1957年兴建兴集电灌站调整水系时，人工改道至义城镇南部董城府附近注入巢湖。改道后河长28.8公里，平均坡降0.72‰，流域面积111.25平方公里。十五里河河道弯曲，源短流急，洪、枯水位变化大，汛期常有巢湖水位顶托，下游易受洪涝灾害。1959年曾对河道清淤疏浚，后又在河道建有兴集、汪潦两座排灌站，泄洪和灌溉条件有所改善。
七、店埠河，是南淝河最大支流，发源于长丰县吴店乡，南流经肥东县众兴、永安、店埠、撮镇、临河集等地，至三汊河入南淝河，全长38公里。店埠镇以下河面宽70～90米，河底高程4.5米，可通航百吨位船只。
八、长乐河，源于肥东县桥头集乡，西流经复兴、长乐乡入南淝河，全长21公里。
东淝河古称淝(肥)水，其源有三：东源，名王桥小河，源于肥西长岗店北，南流至将军岭西，又北流至高店乡唐新圩(旧志称“铁索润”附近)汇入天河，成为东淝河主源。古代多以王桥小河之水作为淝水源头，认为其与施水(南淝河)同源于将军岭，而归异(一入淮，一入江)，故有“出同归异曰肥”之说。王桥小河全长21.5公里。中源，名天河、天沟河，出肥西大潜山东西两侧，分别流至江夏汇成天河，再东北流至唐新圩(“铁索涧”)汇王桥小河水，成为东淝河正源，至寿县董铺汇金河后，形成东淝河主河道。天河全长50公里。西源，名金河，出六安龙穴山，北流至刘小圩入肥西境，称金河，西北流经金桥，至六安太平集，东北流至寿县董铺，汇天河水，成为东淝河主河道。金河全长56公里。清光绪《寿州志》等以龙穴山水为东淝河正源，不确。
东淝河主河道自寿县董铺以下北流寿县城东，再北流入淮河。中下游因淤积形成狭长湖泊，名瓦埠湖。
东淝河东岸最大支流庄墓河，源于长丰县下塘集南，集夏店、吴店、吴山庙镇诸水于车王集会合，向西北流经庄墓桥、至徐庙乡汇入东淝河。其下游形成瓦埠湖的向东岔湖。
塘西河又名韦桥河，发源于肥西县境内，东南流至义城镇塘西村注入巢湖。全长7.5公里，流域面积12平方公里。
丰乐河源于六安横塘岗豪猪岭，经张家店至双河入肥西县境。东流经桃溪镇(舒城县)、新仓(肥西县)、丰乐镇(肥西县)至三河镇(肥西县)汇入杭埠河(合称新河)，经新河口入巢湖。丰乐河长105公里，流域面积2080平方公里，为巢湖水系第一大河。丰乐河支流众多，在肥西县境内有长堰河、杨弯河、陈家堰河、程老堰河、龙潭河、二里半河、赵小河、肖小河、方桥河等。丰乐河经多次整修，桃溪以下可常年通航，三河至巢湖可通航百吨位船只。
派河派河发源于肥西县中部的周公山，东北流经焦婆、大柏店、小庙等乡镇，向南流至城西桥至长安乡三官庙，先后汇合李陵山、南三十岗、大蜀山南坡诸水，始称派河。又南流至上派镇，为上游；又东南流至中派河镇，为中游；再东南流至刘河乡下派河口入巢湖，为下游。派河全长60公里，流域面积584.6平方公里。派河经多次整修，上派镇以下可常年通航百吨位以上船只。
蒋口河发源于肥西县程店乡北，东流经严店、苏小、清平乡，至罗靳村入巢湖。长28公里。
滁河发源于肥东县同心乡，东流经梁园、三官地区出境，进入滁县地区，至江苏省六合县注入长江。在肥东境内长45公里。
池河发源于长丰县杜集，东流经肥东县响导、赵亮、肖圩乡出境，经定远、嘉山入洪泽湖，再经淮河下游入长江。在本市境内共长20公里，不能通航。本市境内支流有：肖凤河、草冲河、花张河、红石河、马王河、赵集河、肖圩河等。
窑河又称洛河，古称“洛涧水”，发源于长丰县中部江淮分水岭北侧，向北流入淮河。有东、中、西三个源头：东源，名沛河，源于定远县东架山，西流至长丰县沛河乡，再北流至水家湖镇东汇合朱巷水(中源)，形成主河道，北流入淮。西源，名沙河，源于长丰县北端舜耕山南麓，东流经孔店乡入窑河主流。窑河中下游因淤积形成狭长的湖泊(高塘湖)，再向北注入淮河。
湖泊
巢湖亦称焦湖，位于安徽省中部，在合肥市与巢湖市、肥东县、肥西县、庐江县之间。巢湖水通过裕溪河下泄长江。
巢湖是安徽境内最大的湖泊，也是我国五大淡水湖之一。巢湖东西长55公里，南北宽22公里，周长167公里，属合肥郊区所辖沿湖堤长10.4公里。湖深一般为2～3米，最深处5米。湖水位在10米时湖水面积为783平方公里，属合肥郊区所辖的湖水面积为33平方公里。
巢湖水系是安徽境内长江流域的最大水系，入湖河流主要有派河、南淝河、柘皋河、兆河、杭埠河、丰乐河等，这些河流呈向心状分布。巢湖水系流域面积1.3万平方公里，接纳四周二市七县近40亿立方米的来水。为了控制巢湖水位，在裕溪河两端，建有巢湖闸和裕溪闸。
据实测，巢湖多年平均水位为8.03米。巢湖年平均最大值水位为9.62米(1954年)；年平均最小水位：巢湖闸建成前为7.11米(1948年)，建闸后为7.28米(1966年)。巢湖最高水位为12.93米(1954年)；最低水位：建闸前为6.03米(1958年)，建闸后为6.33米(1978年)。
巢湖与长江相通，对长江水量起着天然的调节作用。巢湖还有蓄水、供水、灌溉、航运、水产、旅游之利。巢湖最大蓄水量可达50亿立方米，为周围二市三县发展灌溉事业提供有利条件，也是合肥市工业、生活用水的重要来源之一。巢湖水系有河流34条，港口14个，并且湖江相连，航运四通八达。巢湖水产资源丰富，银鱼、虾米驰名中外。巢湖景色秀丽，是旅游胜地。
瓦埠湖位于长丰县、寿县、淮南市交界处，原为东淝河中游河段，因下游淤积形成狭长湖泊。湖面积约200平方公里，长丰县有水面约45平方公里。湖水容积约4亿立方米，正常控制水位17.5米，最高水位23.1米(皆海拔高程)。瓦埠湖可常年通航几十吨位船只，湖水盛产银鱼、虾等。
高塘湖位于长丰县与定远县和淮南市之间，原为窑河下游河段，因河道下游淤浅积水形成狭长湖泊。湖面积约40平方公里，长丰县约占10平方公里，湖水容积约2～2.87亿立方米。正常控制水位17米，最高水位20.2米。