怀宁境内流传的宗教主要有道教、佛教、伊斯兰教、基督教和天主教。信奉者最多，影响最深远的是佛、道二教，许多教规演变成了民间习俗；信奉者最少，影响最小的是基督教。建国前，宗教的发展得到统治者的大力扶持，许多寺观教堂都置有田产，收取田租，成为宗教地主。建国后，人民政府尊重宗教信仰自由，宗教徒享受公民一切权利。人民政府提倡和组织宗教界人士走自食其力、自治自养的道路，对年老体衰的宗教职业者由集体实行“五保(保吃、保穿、保住、保医、保葬)”，国家每年给予适当补助。由于受“左”的错误影响，建国后宗教曾一度被视为宣传封建迷信思想而受到批判，“文化大革命”中宗教活动完全停止。80年代，党的宗教政策重新得到落实，宗教活动逐渐恢复正常。1985年，境内宗教主要有佛教、伊斯兰教和天主教，神职人员40名。
一、道教
怀宁的道教有正一道(又称“火居道”)和全真道(又称“龙门道”)两派，隶属天师府(设江西省贵溪县龙虎山)，归张天师管辖。全真派道士出家修行，以道观中香火收入、檀越捐赠为主要生活来源，小道观收入少，生活清苦，“香火一断，炊烟也断”，后来多归并到正一派。正一派道士可以出家，亦可以不出家，有檀越继承权，家中人口多时，可以分出一部分做其他事。民国元年(1912年)，“安徽省道界教育总会”在安庆四方城成立，简称“道教会”，时安庆城内及郊区有职业道士18家，其中正一道士16家，各有自己的势力范围，据清道光年间立下的规矩，相互不得侵犯。道教会旧《简章》规定，安庆只此16家正一道士有檀越继承权，其他无檀越继承权，又想在市区活动的道士，只能到这16家当“客师”(雇工性质)。安庆道士中，章姓最有名。章姓世袭道士职业，11个房头中有7房以道士为业，阵容齐，经卷多，神像美，很少请客师，西门外是其世袭的活动领地，其中章凤翥还担任过道教会的理事长。
清代和民国，道教活动比较活跃。清代天师张妙龄和民初天师张元旭都到过安庆，为官府和富商大贾做道场。张元旭来时官方待若上宾，安庆16家坛主在将军府(今安庆大药房址)广场高筑坛台，摆了三天三夜道场。民国16年至抗日战争前夕，为吸引观众，扩大影响，道场形式有所改革，主要是从以前偏重打击法器改为吹奏音乐和打击法器并重，加上“放飞铙”和“耍流星”等杂技，将法事和娱乐相结合。放飞铙和耍流星后来成为道士的基本功之一，余为吹、念、写、打。
建国前，许多道士生活艰难，便半道半农，当客师者更难得温饱，每坛法事所得微薄，还要交“迷信捐”。俗语云：“道士手中两块铜，越敲越穷。”建国后，禁止道士替人“求神降福”、“超度亡灵”，大部分道士改业另谋生路。但不时仍有个别道士为利所惑，暗地替人求福超度。
据民国24年调查，全县约有职业道士600人，其中安庆城内及城郊80人。1953年调查，全县有道士145人，次年剩120人，1959年底，已无职业道士。
在全国道教界有影响的当属洪镇人陈撄宁。陈少时攻读古籍、医书，后学道。曾潜心研读明道藏，写出部分道藏目录、索引及道书多种，并主办《仙学月刊》、《半场月刊》等道学杂志，在近代道教和中医界有一定影响。建国后曾任中国道教协会副会长、会长等职。
县境内的道观据康熙六十年(1721年)《安庆府志》记载，共有9座，即佑圣观、真源观、真乙观、神霄观、三元观、紫霄观、灵源观、瑞云观、清虚观。民国24年省道教联合会调查，有道观8座，即东岳庙、碧霞宫、正乙观、清虚观、神霄观、古坛寺、宣团寺和三城寺。40年代末尚存5座，但多被改做他用。宣团寺(宋建)、佑圣观(元建)历史最久。佑圣观位于安庆任家坡，是旧时道教活动主要场地，清末其址改建“安徽省咨议局”，民初又作省议会会址，观址移建于黄甲山，规模极小。今境内已无道观。
道教神庙原有城隍庙、关帝庙、土地庙等，本世纪初佛、道一度融合，道教供奉的神位亦被佛教供奉。民国17年省佛教会调查佛教状况时，将道教的庙宇道观一并统计在内。
二、佛教
怀宁的佛教属禅宗。《古鉴堂记》记载，东晋成帝咸和年间(326～334年)，僧童师在安庆城西郊万松山建太平寺。南梁天监四年(505年)，僧宝志在渌水乡建石山寺。隋朝开皇年间(581～600年)，禅宗三祖僧璨到安庆，居朝天坊菩提庵(庵因此改名三祖寺)，后隐居并圆寂于今潜山县天柱山。北宋建隆元年(960年)，伏虎禅师在渌水乡募建三城寺，规模宏大，住僧很多，一度成为安庆佛教活动的中心。明、清时期，大建庙宇，其中以迎江寺和振风塔最为有名。清咸丰三年(1853年)，太平军与清兵争夺安庆城，城内及郊区大部分寺庙被毁，佛教遭受沉重打击，但以后多数寺庙又由官府或邑绅捐资重建。民国2年(1913年)，继“中国佛教总会”成立后，迎江寺僧月霞、竺安等在安庆组织“安徽省佛学会”，机构设迎江寺，历任会长多由迎江寺名僧担任。安庆沦陷期间，迎江寺主持本僧出面成立“日华佛教会安庆分会”，本僧任会长，抗战胜利，“日华佛教会”解散。民国28年，怀宁县佛教会在石牌成立，有林任会长，36年，会址移安庆，懒悟任会长。建国后，政府尊重佛教徒的宗教信仰，但佛事活动限制在寺庙内进行。1958年调查，宗教神职人员主要是佛教的僧尼，对他们一面组织自我改造，提高反帝爱国守法观念，一面组织参加生产劳动。1958年4月，龙池庵全体佛教徒订出自我改造“大跃进”规划，向全县佛教徒挑战。1959年全县共有僧尼64人，后部分迁往九华山及其他地方，部分还俗，1960年尚剩39人(僧13人，尼26人)，其中14人因年老体弱由所在公社实行“五保”，其余25人，自愿由统战部门安排，集居龙池庵。“文化大革命”期间禁止举行法事活动，佛像、法器大部分被毁，僧尼多还俗。80年代，党的宗教政策重新得到正确落实，佛事活动逐步恢复正常。县里将所剩的寺庙房产退还给僧尼，以持续香火。1985年全县共有僧尼19人，居士350人，莲花庵主持释云从被选为县政协常委、省佛教协会理事。
县内的寺庙据清道光五年(1825年)《怀宁县志》记载，有200余座。咸丰三年(1953年)兵燹，剩41座，其中县城安庆剩14座，即双莲寺、万寿寺、天宁寺、太平寺、迎江寺(此五寺明清时称为“省城五大寺”)、三祖寺、三城寺、神龛寺、宣团寺、宝善庵、清凉庵、水云庵、回翔庵、墨雨庵。民国4年《怀宁县志》记载，全县有寺、庵等273座(四乡213座，县城60座)，其中已废圮的10座，改作他用的5座。民国17年，省佛教协会调查，安庆有寺庙37座，一些古寺如双莲寺、万寿寺、天宁寺等已不存。建国后，1953年统计，全县尚存寺庙101座，以后大多改作学校、仓库。1984年将所剩的15座寺庙房产交还僧尼，其中8座寺庙住有僧尼。万桥乡莲花庵被定为省重点保护寺庙，集资3万元修葺，并修通其连接合安路的公路，以便利游人和香客。
附：重点寺庙简介
【迎江寺】系临济正宗，十万选贤丛林，是安庆佛事活动的主要场地，亦是安徽省开坛放戒大丛林。明万历四十七年(1619年)由邑绅阮自华募建。泰昌元年(1620年)，明光宗朱常洛御书匾额“护国永昌禅寺”，寺僧建宸翰楼贮之。寺于明末清初兵乱中两度被毁，清顺治七年(1650年)操江巡抚李日芃重建，更名“敕建迎江禅寺”。康熙二年(1663年)巡抚张朝珍修大殿与山门，迎江寺至此稍具规模，乾隆皇帝曾赐“善狮子吼”御匾。咸丰三年(1853年)兵火中再度被毁。同治九年(1870年)，巡抚吴坤修与翰林赵昀奉旨同修。光绪间僧无凡募修寺塔，加修佛像，慈禧太后赐“妙明圆镜”御匾。民国6年慈云阁住持广法弥留之际将慈云阁、大士阁赠迎江寺，次年三处合一，寺规模扩大1倍余。7年，秋浦人周学熙出资修寺、塔，改建大士阁。18年，藏经阁毁于火灾，僧心圣募建。30年僧本僧、月海募建毗卢殿，装修海岛。建国后，1953年安庆市人民政府对寺、塔彻底修葺，并勒碑记之。
迎江寺占地2．23万平方米，全部建筑有天王殿、大雄宝殿、毗卢殿、藏经楼、迎江楼、慈云阁等。山门阶前有两只大铁锚，重约两吨。寺内藏有描金《妙法莲华经观世音菩萨普门品》附《心经》，写于明宣德七年(1432年)，本藏于皇宫，由明光宗赐出。名僧无凡、竺安、心坚、月霞、本僧、月海等都曾任过迎江寺住持。
位于迎江寺大雄宝殿和毗卢殿之间的振风塔，为长江沿岸名塔，旧有“过了安庆不言塔”之说。“塔影横江”是建国前怀宁十二景之一，明朝隆庆四年(1570年)由知府王宗徐及邑绅于惟一、吴宗周建。旧志载建塔原因是“皖城诸山雄峙，西北东南滨江，地甚平衍，形家言，须镇以浮屠，青龙昂首，为人文蔚起之兆。”塔身砖石结构，八角七层，高82．74米，内嵌砖雕佛像600尊，故旧名“万佛塔”。建国前塔曾多次与寺同修，建国后于1953年又由安庆市人民政府进行彻底大修，并立有《重修振风塔记》碑。
【莲花庵】位于万桥乡同兴村。始建于南北朝时梁朝，据传庵址初在独秀山，后移建于孟家岭、鸦雀山等地，清嘉庆三年(1798年)移建于现址至今。有庵院两进13间，良田30亩。“文化大革命”中佛像被毁，1977年大殿倒塌，后修复正殿及庵房6间，供有如来、观音和大势至菩萨各一尊，有僧住持。现为省级重点寺庙。
【龙池庵】位于温桥乡金山村。始建于明成化年间(1465～1487年)，清雍正时(1723～1735年)改建，民国时期因蚁害重建，因所在山顶有泉水称龙池得名。建国后一直有僧尼住持。1960年全县有25名僧尼因所在庙宇年久失修，不堪居住而自愿集居于此。
【普陀寺】约清初建，位于洪镇乡雪山洞前。旧时香火旺盛，1982年县人民政府公布为县重点文物保护单位。
【芦峰禅寺】位于育儿乡栗岗村，宋朝僧人宝光所建。民国14年比丘尼悟心主持该寺，募化扩建，有大中小三殿及两厢房，规模较大，香火旺盛。后因年久失修，加之天灾，大殿于1963年倒塌，80年代该寺被县里批准开放，寺僧募化修复大殿及部分平房，门前立有佛塔。寺内供有9尊佛像。
三、伊斯兰教
元末明初，安庆始有回民定居，伊斯兰教随之传入、发展。回民开始多聚居在安庆大南门一带，民国时期部分迁移到江镇、山口等地，现主要分布在江镇、巨网、红星等乡和石牌镇，以马姓和宗姓人口最多。民国35年(1946年)安庆回民有2万余人。建国后1953年统计，全县有回民2704人，自江镇乡三益大队划归皖河农场和广圩区部分公社划归安庆市后，人数大为减少，1985年全县只有213户，1127人。
长期以来，怀宁回民笃信伊斯兰教。民国期间，安庆城内的教民成立有回教董事会、安庆回教公会、安庆回民协会和回教协会，先后创设清真、穆德、阿文等三座穆斯林学校。民国35年9月，成立中国回教协会怀宁支会，首届理事长马轶尘，第二届马以愚。建国后1953年在山口区成立“中国伊斯兰教协会怀宁县支会”，会长马兆宽，下设两个分会，一在保婴乡太上、大胜两村，一在保婴乡清节村。支会会址设清节村清真寺。由于回汉长期杂居，回民受汉族影响很深，建国后年轻一代回民中很多已不信伊斯兰教。
建国前，由于统治者的歧视，回民在政治上受欺凌，生活上极度贫困，从事的职业大都是小贩、码头搬运、屠宰、长工等，且绝大多数人是文盲，故旧称“穷回回”。回汉关系紧张，汉族称伊斯兰教为“小教”；伊斯兰教内部也有新旧派之分，相互仇视攻击。统治阶级为了巩固自己的统治，经常有意制造民族矛盾，挑起回汉殴斗，流血事件屡有发生，最突出的是民国35年安庆东、南门回汉码头工人为争夺码头而发生的大械斗。械斗的幕后操纵者有县参议长、警察局侦缉队长、劣绅等，结果多人受伤，东门3名工人惨死。中国共产党尊重伊斯兰教民的宗教信仰，得到教民拥护。1949年渡江战役中，三益回民组织回民支前队，支援解放军渡江。战斗中，副队长马吉荣、队员丁宪良光荣牺牲，中国人民解放军第二野战军五兵团司令部、政治部赠“伊斯兰英雄”锦旗一面。建国后，回民在政治、经济、文化上得到彻底翻身，享受中华人民共和国公民的一切权利。
民国时期，安庆城内的清真寺有关南、关西、女清真寺(后二寺均建于辛亥革命后)，城外有茅岭、马场畈、三益清真寺，其中关南清真寺初建于明成化五年(1469年)，是长江中下游有名的清真寺。三益清真寺于民国27年被日军飞机炸毁。1953年6月县委统战部调查，全县有清真寺6座(山口区5座，江镇区1座)，阿訇10人(山口区9人，江镇区1人)。1960年清真寺剩3座，其中2座被改作他用；阿訇7人，其中3人已不在位。“文化大革命”期间宗教活动被禁止，清真寺被废无存。80年代重新落实党的宗教政策，1985年在红星乡清节村和保婴民族联合村各重建清真寺1座，培养阿訇2人。
四、天主教
清康熙三十九年(1700年)，比利时方济各会教士卫方济自南京到安庆设堂传教。同治三年(1864年)，法籍主教鄂尔壁派中国籍神父熊臣尧到安庆创立新会所，开辟教区。熊扮成商人，在安庆买下一房，明为布店，暗作教堂。次年五月，江南教区代牧主教郎怀仁到安庆，要求官府承认熊的教堂合法，遭拒绝。熊不顾官府反对，将房屋交给神父雷书骏，作为法国教堂，激起安庆人民的愤怒，将雷书骏赶出安庆。同治六年十一月，曾国藩任两江总督。为谄媚雷书骏，主动命令让出一房作为法国教堂，从此法国天主教江南教区在安徽长江北岸获得重要传教基地。同治七年，雷书骏死亡，金碱三、韩石贞继续在安庆传教，并以低价购得东右坊民房12间做教堂。同治八年发生安庆教案，清政府按“保教抑民”的媚外方针进行处理，官府除赔偿银钱外，还将黄家狮子山转“赠”教会作为赔礼。同治九年，教会在黄家狮子建神甫住院，次年建天主教堂，名耶稣圣心堂。
光绪四年(1878年)，安庆成为安徽3个传教中心之一(余为宁国、五河)。十五年安庆和池州合并成立总铎区，二十六年成立安庆总铎区，怀宁属总铎区的东部。宣统二年(1910年)，全县入教者1067人，望教者2043人。民国10年(1921年)，安庆成立教区，脱离江南教区归安徽教区管辖，教务由芜湖教区主教兼理。由于教务繁忙，19年由西班牙人梅耿光任主教，不再由芜湖主教兼理。20年，西班牙耶稣孝女会来安庆设立圣母院，24年成立初学院培训修女。安庆沦陷期间，教会与日军相互勾结，主教梅耿光为日军死亡将士做弥撒，日军向传教士发放特别通行证，并在教堂门前张贴“保护西班牙国教堂，皇军严禁入内”的告示。在日军保护下，天主教发展迅速，29～30年分别在西门和北门建两座天主堂，29年安庆城内的教友比19年增加了近1000人。37年安庆教区升为总教区，列为全国20个总教区之一，梅耿光升为总主教，总主教座堂设黄家狮耶稣圣心堂。
建国后，梅耿光等人敌视中国共产党和新中国，宣传“有神无神势不两立”、“爱国爱教有矛盾”，不准教徒拥护共产党，不准看共产党的报纸、杂志和其他刊物，不准参加共产党的任何组织和活动，违者开除教籍。1951年，梅耿光等7人被驱逐出境。政府帮助天主教徒割断与帝国主义的联系，走三自(自传、自养、自治)的道路，原神职人员参加了革命工作。据1956年不完全调查，全县有天主教徒38人(包括基督教徒)，以后多退教。80年代又有人开始信教，1985年，全县有天主教修士2人，修女2人。
清光绪二十二年五月统计，全县有法国天主教堂6所，分设在安庆城东门内黄家狮、渌水乡老坟头、受泉乡广村保、大丰乡梅湖保、大丰乡丁家保、钦化乡宝福保。老坟头等5个教堂为黄家狮子教堂的分堂。民国4年《怀宁县志》记载：总堂仍设黄家狮子街，分堂有二：一在受泉乡广村；一在尧年乡中洲。其余传教处有：钦化乡余家保老坟头北首、大丰乡梅湖保、钦化乡高河铺、钦化乡丁家破楼嘴。民国29～30年，安庆西门外太平寺和荣升街各建一座教堂。建国后1955年9月调查，洪镇区团结乡尚存天主堂房舍(名玫瑰堂)，另有5个临时公所，分布在月山区黑寺岭和戴家店、高河镇、新安区夏家栏坝、枫林乡丁家破楼嘴等处，直属玫瑰堂管辖。玫瑰堂西斑牙籍神甫江波，于1951年离境，1954年教堂房舍交县血防站使用，1955年房舍圣具被处理给月山乡东村农业社，1957年在此创办广村中学。5个临时公所先后自动消失，房舍或废圯或改作他用。
五、基督教
建国前，怀宁的基督教归皖赣教区管辖，体系上分圣公会和内地会两派。
清同治六年，英国传教士成立“中华内地会”。同治八年三月，内地会传教士密道生和卫养生以司铎的身份到安庆，租赁北正街西左坊民房15间作为教堂，当时安庆内地会是全省唯一的基督教组织。光绪二十二年，县内有英国教堂2座，分设在安庆西门县下坡和北门正街，各有英籍驻堂教士1人。约于民国初，在石牌永兴街又设福音堂1座。民国17年，安庆内地会与西方差会脱离经济关系，成为自养教会，改名“中华基督教安庆福音堂”，由华人自理。日军侵占期间，教会遭到沉重打击，被迫关门。日军投降后，由加拿大籍牧师重建，市内教徒达80余人，多为贫民、手工业者、职员和学生。安庆解放前夕，外籍传教士回国，教会由执事会管理。
清道光二十五年，美国圣公会传入中国。光绪二十年，圣公会华人传教士黄郎斋到安庆传教并筹建教堂。光绪二十六年，美籍传教土林学汝到安庆传教，次年在大二郎巷建教堂，名安庆救主座堂，为当时全国十大教堂之一，并开辟皖、赣、湘、鄂教区。宣统二年(1910年)，安庆教区从湘鄂皖赣教区划出，成立皖赣教区，主管皖、赣两省教务，二郎巷教堂成为主教座堂，也是皖赣大教区的中心大礼拜堂。同年在铁佛庵设天恩堂、后营百花亭建成仁堂，在下石牌建立分会。安庆沦陷期间，圣公会损失惨重，主座堂钟楼、天恩堂遭日军拆毁，成仁堂被占，主教逃沪，但仍有救士留守到抗战胜利，并于民国34年恢复被占的成仁堂，改名为圣诞堂，做为救区正式礼拜堂。抗战胜利后，安庆教区再度兴盛，民国37年安庆城内有受洗信徒50余人。
圣公会在传教的同时还开办了医院和学校，著名的有同仁医院、官话(华信)学校、圣保罗中学、培嫒女中等。
建国后，县境内无基督教组织及活动。但1984年发现和县乌江镇“自由传道人”在凉亭乡戴店村私设教堂，发展信徒20余人，望江县新坝乡河湾教堂在皖河乡彭西村和江镇乡发展信徒百余人，另外还有一些“自由传道人”在雷埠、腊树等地串联传教。对以上现象，均及时加以教育制止。