建国初，县内水利事业先后由县人民政府建设科、农建科管理。1954年6月，设立水利科，1955年5月撤销，水利事业仍由建设科管理，1958年11月，设立水利电力局。“文化大革命”期间一度改水利管理站。1970年11月，复建水利电力局。现全系统共有职工174人，其中干部36人，全民所有制工人98人，具有专业技术职称的技干21人(中级2人，初级19人)。
1952年冬，成立潜山县水利委员会，负责组织与领导水利建设，具体工作由县政府常设水利办事机构承办。从50年代起，县设立有防洪抗旱指挥部，受灾之年，负责组织与领导抗灾斗争。下设办公室，承办具体事务。
土地改革时，将地主占有的圩坝分给贫下中农所有。合作化后，为集体所有，先后组建17个圩堤工程委员会。1985年增至22个，其中由乡人民政府管理的13个，属村民委员会管理的9个。共配专职堤干80人，雇请护堤员82人。
县内乌石堰、粮川闸、余井闸、便民闸等29个1乡1圩的引水灌区，由当地堤委会负责管理；幸福河灌区跨野寨、梅城、油坝3乡，由梅城区负责管理；五丰河灌区跨黄铺、梅城、王河3区，由县负责管理。
县内各中小型水库，均组建了水库管理所，负责水库的检修、养护和发展多经生产。长春、红旗两座中型水库，1981年改集体所有制为全民所有制，改区直属单位为县直属单位。
县内机电排灌站根据不同情况，采取分级管理的办法。同合圩电力排灌站受益区跨潜怀两县，由安庆地区水电局委托潜山水电局组织专门机构负责管理；洋荡圩、西联圩、三保圩、太子圩、龙湖圩、梅湖、朱湖等7座电力排涝站，为跨村设施，分别由所在乡负责管理；其余由村民委员会负责管理。
建国后，县委、县政府十分重视水利建设，根据县内地形和水旱灾害的特点，制定了“主攻洪涝，兼治干旱，狠抓水保，发展水电”的治理方针，开展全面规划，进行综合治理。山区易洪易旱，水土流失严重，则以蓄水为主，兼顾防洪和水土保持；丘陵地区干旱威胁大，则就地兴塘建库，拦蓄山水，开沟建站，引提河水，以防干旱；圩畈地区常闹洪涝灾害，则采取“塞支强干，束水归宗”的办法，治河整堤，建站建闸，御洪排涝。由于因地制宜地进行综合治理，有效地改善了全县的水利条件。全县农田有效灌溉面积：1950年为3.6万亩，占当时农田总面积的9.92％；1979增至26.55万亩，占当时农田总面积的80.6%；1987年又增至27.03万亩，占当时农田总面积的82.9%。从1949—1987年的39年中，县内发生水灾有23年，其中大灾、中灾各5年，小灾13年，累计受灾面积143.33万亩，年均6.23万亩，其中成灾面积85.22万亩，年均3.7万亩。由于及时组织防洪排涝，堵口复堤，充分发挥水利设施的作用，在遭遇水灾的23年中，粮食总产量比上年增产的有9年，为灾年总数的39.1%。在同一历史时期的39年中，县内发生旱灾有26年，其中大灾、中灾各7年，小灾12年，累计受灾面积285.62万亩，年均10.98万亩，其中成为面积106.05万亩，年均4.07万亩。由于及时组织抗旱斗争，充分发挥水利设施的效益，在遭遇旱灾的26年中，粮食保产和增产的有11年，占灾年总数的42.3%。1966年、1978年1979年等大旱之年，粮食总产量仍超历史纪录。