清咸丰四年(1854年)正月，太平军攻占潜山。咸丰六年(1856年)十一月，清军收复潜山，十二月太平军再克潜山。咸丰七年(1857年)四月，太平军一部自霍山来潜山天堂与潜山县团练拼战，团练战败。是年十一月，潜山团练又与太平军战于黄沙岭，团练又败，死500余人。战后，潜山知县叶兆兰奏准建“忠义祠”于斑竹畈。咸丰八年(1858年)正月，太平军部将陈宗胜部自湖北蕲州、黄州来潜山水吼岭，团练抵挡不住，太平军胜。同年七月，清军再攻潜山。八月四日，太平军陈玉成部自黄安来潜山，十月太平军与守城清军拼杀，经过激烈战斗，太平军再取潜山。同年十一月，太平军于天堂作战，打死团练300余人，并与楚军参将余际昌部展开战斗。咸丰九年(1859年)二月，太平军陈玉成部与潜山县知县叶兆兰所率的潜山团练再大战于水吼岭，战后，太平军战略性转移到衙前。三月九日，驻衙前太平军复克水吼岭。知县叶兆兰败走梅城，进攻天堂，大破万家岭，杀死太平军检点张逆遂。四月廿五日，太平军行至撞钟河，时遇山洪，团练乘水势攻击太平军，太平军死数十人。同年八月，太平军叶芸来部据潜山。九月，清军多隆阿部与太平军战于黄泥港，太平军失利。十月，潜山知县叶兆兰督同团练与太平军战于逆水畈、槎水畈、黄柏河、龙井关。十一月，清军制定四路进攻安庆的计划。第一路由湘军首领曾国藩自任指挥，从宿松、石牌进攻安庆；第二路由多隆阿、鲍超任指挥，从太湖、潜山进攻安庆外围主要屏障桐城；第三路由胡林翼任指挥，从英山、霍山进攻舒城；第四路由李续宜任指挥，从商城、固始进攻庐州。十二月，太平军陈玉成联合捻军张乐行部队，号称10万大军在潜山县境王家牌楼、广福寨、地灵港等处建营垒100多个，准备与清军决战。这时，清军鲍超部驻小池驿，道员蒋凝学部驻龙家凉亭，多隆阿部扎营于新仓。太平军决定先向小池驿发动进攻，切断小池驿与新仓的交通，双方激战两昼夜，鲍超部被歼1000余人，副都统衔协领西林布哈尔库、参将吴明亮等被现场击毙。曾国藩为了援救小池的鲍军，急调该部总兵朱品隆从宿松以20个营力驰救，多隆阿也调兵救急，官文又密令知府金国琛、参将余际昌率清军从潜山天堂、高横岭往援。太平军、捻军寡不敌众，始自小池驿突围撤走。同治二年(1863年)六月，捻军将领张宗禹，太平军遗部马融和转战又来潜山，不久，且战且去。