一、地方良种
1、大牲畜区内大牲畜良种有东流水牛，其特点是体型大、骨骼粗、躯干结实、肌肉发达、适应性强、性情温顺、易于调教，曾于1958年送北京农业展览会展览。东流县的畜牧工作曾被评为先进，1958年12月派员出席了全省和全国农业社会主义建设先进代表会议，获得国务院颁发奖状1张、奖章1枚。1975年东至县参加全国水牛改良育种协作组，东流水牛被列入全国13个地方良种水牛之一。此外，区内还有大别山的黄牛，生长在太湖、潜山、岳西等县。它的特点是双角较短，结构紧凑，行动灵活，繁殖力强。其中以太湖牛为最佳。
2、猪猪的主要良种有太湖县的六白猪，枞阳县的黑毛猪。六白猪的特点是头、额、尾和四肢末端为白毛覆盖，背腰宽平，四肢结实，繁殖力强。仔猪60日断奶，平均体重6～10公斤。肥猪在低营养的条件下，日增重量300克，望江、宿松、怀宁等地都有饲养。枞阳黑毛猪的特点是浑身黑色，耳大下垂如菜叶，繁殖率高，耐粗抗病，便于饲养，母猪产仔最多时达21头，桐城、贵池、怀宁一带都有饲养。
3、禽枞阳县陈瑶湖周围繁殖的肉鸡，是区内优良品种。它的特点是成熟期早，上市仅需90天，年产蛋100～150枚。
4、蜂区内的蜂种以皖南中蜂为主。它的特点是适应性强，飞翔迅速，嗅觉灵敏，抗病、抗敌能力强。
二、引进良种
1、引进良种牛1958年，地区畜牧兽医部门首次引进苏联莫斯科特罗姆牛1头，安放在东流种畜场饲养。同年岳西也引进了秦川公牛数头。1965年枞阳县引进南阳公牛2头，稍后宿松、望江、潜山等县也先后引进了南阳、秦川的公牛。1971年6月，东至县从广西引进摩拉公牛2头，并与东流水牛杂交，获得成功。1972年地区畜牧兽医站从吉林引进延边公牛10头，为改良品种提供了条件。
2、人工授精配种1979年，太湖畜牧兽医站首次引进国外海福特和短角牛的冻精颗粒，通过人工授精获得成功，当年配母牛8头，怀胎2头。1977年又用冻精配种母牛25头，怀胎14头。与此同时，还首次试用摩拉牛常温精液，给水牛人工授精获得成功。1982年全区人工授精的母牛共2174头，受胎率56．6％。据宿松县家畜配种站测定：摩拉牛和当地水牛杂交的一代，初生体重比当地牛提高21％，平均体高增加12．1厘米，体长增加49．1厘米。在役用性能方面，周岁开始调教，1．5岁便可供役用，比当地水牛提前1～2年，它的最大挽力可达240公斤，比当地水牛提高1倍。据太湖畜牧兽医站测定：海福特和本地黄牛杂交的一代，平均初生重量为19．9公斤，日增0．49公斤。短角和本地黄牛杂交的一代，平均初生重量为20．35公斤，日增0．52公斤。西门塔尔同本地黄牛杂交的新一代，平均初生重量为19．45公斤，日增0．28公斤。与本地黄牛初生重量13．65公斤相比，可提高42％以上。1981年，太湖县18头杂交肉牛，首批运往香港，深受外商欢迎。1978年该县又引进西门塔尔和夏洛米牛的冻精颗粒，宿松县也同时引进，均获得成功。1980年太湖县又引进辛地红和南阳牛的冻精颗粒，在改良品种上继续进行探索。这些优良畜种的引进，使其役用性和产肉量都有提高。
此外，少数广西水牛、贵州水牛、上海水牛，在桐城、东至等县也有饲养。
3、引进奶牛区内饲养奶牛历史较短。1961年10月东至县从安徽农学院引进黑白花奶牛，因管理不善，先后死亡。1981年，岳西、望江、东至、贵池、桐城、潜山、太湖、宿松等8县，先后引进黑白花奶牛，饲养成功。1987年，全区乳牛存栏数共63头。
4、引进良种猪猪的引进品种较多。1953年地区畜牧兽医所，从上海引进约克夏猪10头，1955年又从江苏淮海农场引进约克夏猪34头，投放到各县饲养。以后各县自行引进其它良种，如巴克夏、哈白、长白、苏白、上海白、内江、荣昌等良种公猪，并与当地本猪交配，初期效果较好。以后，因没有精心选育，交配混乱，生育能力逐渐下降。1980年后，经改善管理，又恢复了良种功能。区内杂交猪的饲养周期一般比本地猪缩短2～3个月，饲养8～10个月时，体重可达100～130公斤，比当地良种六白猪平均日增重量150克以上，瘦肉率提高14％。1981年全区生猪出栏率平均为58．6％，1985年提高到73．8％。
5、引进良种禽鸡、鸭、鹅良种引进，最早是民国36年（1947年）东流县大渡口乡引进的山麻鸡。1958年，东流县种畜场引进来航、洛岛红良种鸡470只，生长良好。以后，各县也相继引进，其主要品种有：来航、洛岛红、九斤黄、澳州黑、澳州蓝、狼山、芦花等鸡种。另外还引进了北京鸭、昆山鸭、金定鸭及雁鹅、狮头鹅等。1979年以后，各县饲养专业户又自发引进大批“5220”、“星杂288”、罗斯西塞斯、来航等蛋用鸡和北京、樱桃谷等肉用鸭，家禽饲养得到大规模的发展。