初建分署时，法纪检察与经济检察统称自侦工作。1979年设法纪检察科，开展专项工作。50年代主要检察对象是区乡干部利用职权违法乱纪，非法拘捕、关押、管制、吊打、逼供、干涉婚姻自由并造成家庭破产、人身伤亡等严重侵犯人权等事件。仅1953年，分署和怀宁、贵池两县就办理过18件案子。1956年6月，分院开始对国家工作人员违法犯罪案进行侦查。1962年11月，分院作出《关于办理严重违法乱纪案件的具体做法（初稿）》，加强了这一工作。1980年开始，按《刑事诉讼法》正式办理法纪案件，本年受理法纪案件就有35件43人，其中起诉4人免诉4人。1982年，受理此类案76件，立案36件，起诉24件；法院判有罪18件，免诉5件。1984至1985年，受理128件，立案35件，起诉17件，免诉8件。
1986年，法纪检察下降，全年只有19件。1987至1988年，共立案57件，逮捕23人。
一、检察侵权案
建国初期，由于法制不健全，侵权案屡有发生。1954年，怀宁圣埠区区干部为催粮食征购任务，以学习为名变相扣押群众1～2天；并随意改变贫农江某为地主成份，致使江妻悬梁自尽（未遂）。贵池、怀宁个别区、乡还发生擅自逮捕群众关押劳改现象。1956年《宪法》颁行，分院于3月9日召开专门会议，提出把检察少数基层干部侵犯公民人身自由案件列为自侦工作的主要任务之一，全年自侦出妨害人身自由案有23件。1958年，自侦内容“除贪污、渎职两项外，全部移交公安部门”受理。1958至1959年，检察机关还主动侦查非法拘禁案19件，乱搜乱罚案23件。1963年专、县结合“五反”运动，年内共侦查逮捕这类罪犯15名。
1980年6月，分院召开全区法纪工作座谈会，把加强法纪宣传工作和办理非法拘禁案列为法纪检察的重点任务。1981至1982年，全区受理非法拘禁案14件，非法搜查案9件；1984至1985年，立案侦查非法拘禁案9件。
1986至1988年，共立案侦查非法拘禁、搜查、侵入他人住宅、诬告陷害、刑讯逼供、徇私枉法、重婚案44件，其中办理起诉22件，免诉20件，撤销2件；1987年非法拘禁立案达9件，起诉3件，免诉5件，撤销1件。
二、重大责任事故与渎职案件
1、重大责任事故1953年受理过5件责任事故案，均未侦查起诉。1954年，国家颁行《国营企业内部规则纲要》。1956年，分院开始把重大事故列为受案范围。1958年“大跃进”，生产蛮干现象突出，不少重大责任事故未能及时处理。1959年，全区抽调37名检察干部先后4次参加安全大检查，发现并逮捕14名造成严重事故的罪犯。
1962年根据《关于管理普通刑事案件职责范围的试行规定》，重大责任事故不再列入检察机关受案范围。1980年分院法纪、经济检查会议提出，经济检察还需重点查处重大责任事故案、破坏森林案等案件。本年全区立案侦查重大事故3件，其中一件是岳西县土产公司仓库于10月28日下午发生大火灾，烧毁库房300平方米及所藏物资，共损失3．4万元的大案。经县院检查起诉，对事故主要负责人判处了6个月的拘役刑罚。
1984至1985年，全区受理大案上升为20件，立案侦查12件，起诉判刑4人，免诉2人。
1986至1988年，受理重大责任事故立案13件，均作结案处理。其中决定起诉9件，免诉2件，撤销2件。1987年8月，望江县人民检察院受理高士乡采石场重大责任事故案。该采石场场长王某为追求利润，让工人长期违章、冒险作业，在8月16日下午8时许，有5名工人在陡坡施工，掏爆岩石时石块断层崩塌，造成砸死2人，重伤1人的重大伤亡事故。经起诉，县法院判处王某徒刑1年，缓刑2年。
2、渎职案件渎职类案主要表现是玩忽职守和妨害邮电通讯案，追究刑事责任较多。
1952年，湖东县长河区铁板乡一位乡长在午季征粮期间急于完成任务，强迫命令渡船超载运送公粮，造成翻船淹死8人的大事故。分署派员侦查，虽未起诉立案，但该乡乡长受到行政上撤职开除的处分。1954年，分院专门召开各县检察长会议，研究和布置如何办理国家工作人员玩忽职守案件。当年专、县检察了公务人员在防汛中心任务中违法渎职案18起，公诉法办4起，行政处分2人。1956年和1958年，分别立案侦查玩忽职守案14件。1961年逮捕法办了妨害邮电通讯的犯罪分子3人。重建检察院后，进一步重视了这类案件的办理。1978至1982年，立案侦查玩忽职守案4件，妨害邮电通讯案2件。1984年立案侦查妨害邮电通讯案2件，1985年立案侦查玩忽职守案6件。1986至1988年，立案侦查玩忽职守案达14件，其中决定起诉6件，免诉8件。