九华山四季多云，尤其是春季，春雨潇潇，云雾迷漫。云层一般为90米至400米，如果云层厚度在1000米左右，在天台就可以看到云海。此外，在百岁宫、神光岭、小天台等处有时也能看到云海。

九华山不仅多云，而且多雾。有时雾粒、低云和毛毛细雨，相互交融，能见度极低。有时在风力作用下，云雾时涨时消，山峦时隐时现，犹如蓬莱仙境。九华山常年有雾，1至6月和9至10月尤其多。全年雾天多达168天。