琅琊山中的佛教传播距今已有一千二百多年的历史。伴随着社会的盛衰而兴废不一。兴盛时僧众云集，钟鼓之声迂回山谷，建筑富丽有制，衰败的阶段，僧散寺毁，蒿莱遍寺，院野五分。
琅琊山寺院的寺额经历三次更名：“宝应寺”、“开化禅寺”、“开化律寺’。在教派方面，早期属禅宗，清矗庆期间属律宗，沿传至今。
唐代大历六年(771年)寺院兴建，劈山垒石，构制禅房，历经法琛，道标，道揖请法师管理住持。
宋代乾德年间(963—968年)，重新扩修了寺院，规模较前期有更大的发展。寺院宏丽，佛门弟子朝山拜佛络绎不绝，云游、挂单、常住僧日达五百多人。宋代皇祐五年(1053年)寺院内还增建了“御书阁”等建筑，上山的古石道路隅增设舍利石塔四十九座，布设其间，壮寺院盛况。佛事与龙蟠，龙兴、光孝诸寺相往。
明代洪武十六年(1383年)在滁州设立了佛教管理的机构——僧正司。德孝禅师为僧正，住龙兴寺任住持，管理琅琊寺院及周围诸寺的佛事。此间，有西土之僧来山住寺面壁六年之久。
清嘉床年间，皓清律师来山住持琅琊山寺院，重建开化堂，开坛传南山律宗，中兴本山寺院。江淮诸寺众僧云集，日达八百余僧，钟鼎集食。嗣法门人分别住持六安观音寺、六合长庐寺、白下静海寺、金陵卧佛寺。本山寺佛教的影响涉及全国数州，可谓“鼎盛之时”，当时较大规模的佛事活动为授戒等。
清光绪三十年(1904年)，达修律师来滁任本寺住持，重建寺院，重振佛事，并葺修了龙蟠、龙华、虎踞诸寺及清流关、蚌埠等地的佛教寺庵，持理诸寺内较大的佛法事宜。达修以后，根如律师、超然律师相继任住持，维持寺院内佛事活动。建国后其寺院曾隶属地方服务部门代为管理，地方政府三次拨款葺修寺院环境。1983年果圆律师住持寺院，经政府宗教管理部门推荐了三位年青僧人去北京、南京佛教学院学习佛法理论。1985年后，寺院划归僧人自行管理，这期间寺院内举行了较大规模的佛七法会的佛事活动，放焰口三天，参观人数达数千人次。
佛七法会在大雄宝殿内进行。殿内设置庄严肃穆，佛蜡和长明灯光亮通照，供桌上铺着大红布饰，三位肩披大红祖衣、头戴毗卢五佛冠的高僧正前方盘腿坐定，周围众僧身着袈裟，手中各持一法器，由一高僧领音，左右二高僧各和一句，众僧附后念唱，法器奏鸣，声音此起彼落，回响山谷。这样一场活动需要持续六小时方能结束。做的是往生佛事和延生佛事(哀悼亡故之人和祝愿生安太平之事)。在佛七法会上吟诵的经典主要有《弥陀经》、《楞严咒》、《大悲十小咒》、《心经》、《金刚忏》、《药师忏》等。
随着宗教政策的落实，琅琊山寺的佛教在逐步发展，现巳定编常住僧十五人，隶属于滁州市政府宗教事务科管理，其佛事活动由僧人自行管理。