在县交通局下面设有县航管站、交管站、公路站等。
一、当涂县航运管理站
成立于1951年10月，当时名称为当涂县船舶管理所。1962年7月改为今名，隶属安徽省航运管理局芜湖分局领导。1953年10月起，先后在城关、采石、护河、黄池、乌溪、塘沟等地设立6个航管组，1956年3月又增设马鞍山航管组，1958年6月成立钟山航管站。1960年6月，航管站下放当涂县领导，更名当涂县航运管理所，同县水运公司合署办公。1962年9月划归皖江航管局领导并恢复原名。1968年后隶属芜湖地区航管处和宣城地区航管处，1985年7月改归马鞍山市航管处领导。1989年县航管站内设人秘、航政、运输3股和1个水上安全检查站，下设塘沟、黄池、护河、查湾、江心等8个乡级航管站。县航管站自成立后，除接受系统领导外，同时受县交通局领导。
二、交通管理站
系县交通局下设的交通管理机构。1960年7月，县交通局为分片加强对农村运输市场的管理和二线道路建设，在全县10个公社均设立交管站，但大部未能正常开展工作。1964年12月，县工交局又在城关、丹阳、大公圩和江心洲等4个地区设立交通管理站，直接管理辖区内短途运输工作。到1987年共有管理人员34人。
三、当涂县公路管理站
1960年4月成立，当时名称为当涂县公路管理所，1963年1月更为今名。1989年内设工养、路政、计财3股，下辖新桥、五里牌、薛津、丹阳、博望、新市、双沟、石桥、塘南、青山、年陡、大陇等12个道班和1个采石场，有正式养路工136人。