全椒的伊斯兰教，明代由陕西传入。清康熙(公元1662—1722年)初，开始建寺于管家坝，此后相继在襄河镇、周家岗、白酒岗的西庄和寺下等地修建清真寺。
管家坝清真寺建于清康熙初年，咸丰年间(公元1851年—1861年)毁于兵火，后由教徒王朝选、王朝佑募资重修。光绪十六年(公元1890年)，马长富任阿訇，民国六年(公元1917年)马病故，王家恩(定远人)继任。后，梅占群(寿县人)、杨人志、李载恩、丁春生(南京人)、王策万(和县人)、王朝礼(全椒人)等人先后接任阿訇。现由全椒县政协委员兼少数民族工作组副组长王敬一任阿訇。
襄河镇清真寺座落南城路42号，建年失考。清真寺有朝真殿，殿上悬“华域一体”匾额一面，下署“嘉庆十七年(注：公元1812年)十月十八日谷旦重修”；另有“清真古教”匾额一方，下署“大清光绪二十一年(注：公元1895年)二月十二日谷旦重修”。民国以后，军阀混战，寺内经常驻兵，残破不堪。民国二十五年(公元1936年)，回民张远侯从白酒岗到县城，捐款重修，又立“仁爱慈悲”匾额一方。清嘉庆年间(公元1796年—1820年)，刘清云(亳州人)任阿訇五年，王兆理(和州人)由陕西学习回全(椒)接任15年。后由王孝先接任20年，马长华接任五年，马长富接任15年。继由李明经(原名米国银)接任，李明经去后由李正银(河南人)接任15年，马殿臣(山东人)接任五年，黄××(定远人)和其子黄品成接任至民国九年(公元1920年)。此后，马志文接任至民国二十六年县城沦陷。汪伪控制县城期间，禹成恕任阿訇。日本投降后，马志文又返回任阿訇，1976年因触犯刑律被捕，病亡于狱中，由其子马玉洲接任。
伊斯兰教的教规很严，宗教行事也很多，最突出的一点是禁食猪肉，同时教徒所食牛羊肉等，都须经阿訇宰杀。其婚丧嫁娶也都必须执行宗教仪式。
目前，全县有穆斯林信徒100余人，经常到所在地清真寺参加宗教活动。