一、管理机构
建国以前，县内无国家设立的管理机构，所有较大的塘坝和圩堤，均由民间自发管理。据调查，一般较大的塘坝，有一名坝长负责管理蓄水、放水和组织人力维修，圩堤有圩董、圩长，负责组织防汛和堤埂维修。圩董一般由当地有名声的地主土绅兼任，圩长、坝长一般由当地地主土绅提名推选。圩董、圩长、坝长的报酬，有的出自公田租，有的为群众摊派。
建国后，自1953年成立肥全坝管理委员会(后改为管理所)派驻国家干部负责该坝管理工作起，历年以国家投资为主兴建的水库、闸坝、机电排灌站，均由国家设立管理机构，派出管理人员进行管理。以“社、队自办为主，国家补助为辅”的小型水利工程则由社、队派人管理。到1984年底，全县属国营性质的水利工程管理单位共42个，其中较大的有黄栗树、马厂、三湾、襄河闸四个管理处；其次是肥全坝、芦子坝、康河坝、土桥水库、赵店水库、上石坝水库、人民坝、中心坝、董洼水库、瓦山水库、上侯、周湖、下封，三塔、武岗、大张、彭林、路洼、三湾水库东干渠19个管理所和袁港、上九连、下九连、汤陈、东方红、五里墩、永丰、大黄、岗李、军民、大孙、新河、宋畈、卜集、汪畈、小坝湖、城北、东王河、晋集19个机电管理站，总共有管理人员759人。其中国家正式职工553人，临时，合同工和亦工亦农人员206人。
二、管理办法
(一)主体工程管理
水库、闸坝，要在确保安全的前提下，达到防洪、灌溉、发电、养鱼等综合利用的目的。每年汛前，根据水库、闸坝的实际状况确定汛期控制水位线，研究溢洪闸门的开启办法，制定各种水位情况下的保坝措施。平时，定期对坝身进行观测、检查，掌握情况，做好维修养护，保证建筑物完好。黄栗树、马厂两水库还通过埋设的测压管和固定标志，每天定时观测坝身浸润线，坝基扬压力和渗水量，以及沉陷、位移等潜在因素变化情况，以便发现问题，及早处理。
(二)渠道管理
1965年以前，每年在冬春兴修季节，各水利工程管理单位均须召开受益区社队代表会议，研究落实渠道工程维修和清淤等项工作，分配任务定期完成。1965年实行养渠包段，按受益田亩多少一次划段，长包不变。各包养社队，要确保渠道及渠道建筑物完好，放水畅通。
(三)用水管理
1965年以前，灌溉用水一般采用按所受益的田亩数征收费用，用水多少不限，结果上游、下游用水不均，经常出现纠纷，浪费严重。1965年，水库、闸坝实行计划用水，流量包段，按亩分水，按水方收费。除每亩收基本水费人民币一角外，自流灌溉每立方收水费六厘，提水每立方收水费三厘。机电排灌站依据开机时间收费，各站根据提水级数、扬程高低、油电消耗、机械磨损、人员工资等项计算收费标准，因之，标准不一。一般是55瓩电动机(或相当于55瓩动力的柴油机)，每台每小时收费六至七元；相当于75瓩的动力机，每台每小时收费七至八元，115瓩动力机，每台每小时收费十元左右；155瓩动力机，每台每小时收费12元左右。
三、维护措施
(一)土坝灌浆
自1978年起，开始对散浸、渗漏较为严重的水库坝埂逐个采取灌浆法进行加固。方法是：先选定灌浆点，在罐浆点处用钻机人工造孔，同时用制浆机制浆(将干土兑水打成泥浆)，用输浆泵将泥浆输入钻孔，压向坝体内，填塞坝体内的空隙和裂缝，达到防渗、防漏，确保坝埂安全的目的。到1984年底，已有赵店、马厂、土桥、上石坝、三湾、黄栗树、兴云等七座水库完成灌浆工程，计钻孔990个，进尺11485米，灌入干土8798吨。
(二)白蚁防治
1978年，首次在黄栗树水库发现白蚁。随后对上石坝、马厂两水库进行检查，也均发现白蚁。再经检查，又发现三湾、赵店、土桥、清石塘、永丰、锥子集、倒兴集、丰产等水库，以及康河坝、陈浅圩堤多处受到白蚁危害。凡检查发现白蚁，立即采取挖巢、药杀，以及利用黑光灯、木桩诱捕，取得了一定的防治效果。全县六座国营水库白蚁防治情况如下表:

四、水文测报
1951年，先后于滁河岸边建立了古河水位站和陈浅水文站，开始进行滁河有关水文资料的测报工作。1952年建立了黄栗树水文站，测报襄河上游有关水文数据，为黄栗树水库的设计工作提供数据。1953年以后，又陆续建立了马厂、县城、赤镇等水文站(或水位站)，以及部分雨量站，为全县历年抗旱、防汛、兴修水利提供了宝贵的数据。各站工作内容如下表: