建国前，天长无专门卫生防疫机构，对流行疫病无力控制。据民国23年(1934)统计，当年全县有鼠疫、霍乱、天花、流行性脑脊髓膜炎、白喉、伤寒、斑疹、猩红热等患者2235人，死亡87人。
1956年正式建立县卫生防疫站，近年已形成县、区、乡、村预防网：县卫生防疫站与血吸虫病防治站在各区防治站内设有预防组，乡防保组内有专人负责全乡预防工作，并规定了村级卫生人员所承担的预防任务。1985年全县防疫系统有卫生技术人员87人，其中师级以上职称21人，士级27人。
一、疫苗接种
30年代天长即开始接种疫苗，接种人数极少。建国后积极开展预防接种工作，50年代普遍接种牛痘，提高易感人群的免疫力。1980年起，逐步对全县0—7岁儿童开展计划免疫工作。1980年，全县各种生物制品预防接种率为89.2％。至1985年，全县计划免疫建卡率达97.3％，各种生物制品接种率为89.57％。
1952年起，县卫生院定期派专人往各区乡调查疫情，按旬按月向上级报告。1980年，全县正式建立疫情汇报制度，近年来疫情汇报率一直在97％以上。

1980—985年各种生物制品预防接种率
二、食品卫生
县卫生防疫站建立后，每年均对饭店、食品等部门进行抽样检查。但因人员、设备等条件所限，食品卫生工作未能取得应有效果。1976年起每年定期对全县食品行业人员进行体格检查，1982年县人民政府发布《天长县食品卫生管理暂行办法》，1983年起执行中华人民共和国《食品卫生法》。
1985年对87个单位的从业人员1810人进行体检，体检率达98.9％，对发现异常者作了妥善处理。当年全县共有82个食品生产单位，已领食品卫生验收合格证77个单位，发证率为93.9％。全年还对全县食品生产、经营单位巡回检查331次，共检查1251个单位，其中警告27个单位、14个个体户，销毁不符合卫生标准的各种食品9450公斤，罚款39个单位，停业整顿16个集体单位、3个个体户，共监测样品10个种类308份。
三、劳动卫生
1978年购置了大气、粉尘采样器，对各厂进行尘、毒测试，对接触铅、苯工作人员进行体格检查，当年对932名劳动作业者进行体检。1985年尘肺检查246人，经诊断无尘肺发病，有3例肺结核，已作妥善处理。
1985年选择县化工厂、化肥厂与水泥厂作为毒、尘作业动态观察点，并对天长镇的环境噪声进行测定。
四、传染病防治
建国以来，随着防疫工作的开展，医疗卫生条件的不断改善，天长地区的传染病发病率逐年下降，治愈率不断提高。
疟疾天长县是疟疾病高发地区，1952年发病率为8.99‰，1976年为历史最高年，达37.24‰。1974年苏皖两省8县成立恶性疟疾联防网，至1983年，发病率下降至7.83‰，1984年后略有回升。1985年采用乙伯四日疗法，进行了夏季休止期根治，全县应服药者为9.05万人，服药7.77万人，达85.9％。
麻疯、头癣建国后全县累计发现麻疯病124人，其中男91人，女33人，临床治愈88人，外迁3人，死亡18人，现症病人15人。防治工作坚持送药上门，复查采访。1959年县曾建一麻疯病村，先后动员10名麻疯病人入村治疗。
全县头癣病已基本消失。截止1985年，全县累计查出头癣病人1469人，治愈1468人，治愈率99.9％，1人尚在治疗中。1985年对釜山、安乐、大通等头癣病多发乡村进行了普查，共查18.35万人，拔发195份，镜检确诊黄癣2人、黑癣1人，已及时治疗。
狂犬病1980年底，一条狂犬从邻县窜入本县境内，致使1981年狂犬病在县内流行。1983年狂犬伤人893人。1981年县人民政府要求各地动员和组织群众捕杀养犬，至1985年，全县狂犬病发病率为十万分之零点三八。


历年主要传染病发病率统计
五、血吸虫病防治
本县地处高邮湖畔，湖滩钉螺较多，是血吸虫病的发疫源地。1980年，县血吸虫病防治站成立后，积极灭螺查病治病。1984年查螺480万平方米，灭螺360万平方米，普检2588人，查出血吸虫病患者3人，已全部治愈。1985年查螺392万平方米，普查1428人，查出血吸虫病患者39人，经治疗，全部恢复健康。