一、私营和个体商业
（一）私营商业
建国前夕，区内有私营商号6022家。其中较有影响的有巢县的吴仁和杂货店，蔡鼎康杂货店，陈泰昌酱坊，朱德泰酱坊，潘恒昌酱坊，祥泰正布店，富春楼酒楼，聚贤楼酒楼；和县的葛裕盛粮行，葛恒新油坊，王万祥糟坊，王广兴油坊，吴启泰布店；无为县的日盛隆糕点店，马浜记杂货店，花日泰染坊，中和楼饭店，“一品仙”饭店；含山县的顾同松药店，恒森泰布店；庐江县的宛谷生南货店，陈恒大粮行，丁人和药店，“恒太”钱庄，“华质”当铺等。
建国初，人民政府保护私商的合法经营，私营商业逐渐恢复并有所发展。1951年1月，区内有私商11493户，私营商业在整个商业中占有明显优势。如巢县私营商业营业额达597.2万元，是国营商业的10余倍。
1952年，国营公司开始在百货、棉布、南货等行业中组织同业工会，实行联购分销、定价出售。1954年，国家对粮、油、棉实行统购统销，不允许私商经营，私营粮商及职工大多由政府安排在粮食部门工作，少数改行。1956年，随着对私营商业社会主义改造的基本结束，区内95％私营商业组成了合作商店、合作小组和公私合营商店。1958年，在人民公社化运动中，区内对私营商业继续进行改造。同年，含山县仅存个体商业者34人。1959年，无为县仅有私商160户，占“私改”前私商总数的3.95％。
1961年，国家允许个体商业在一定范围内存在，区内私营商业有所复苏。1962年，巢县、含山两县有个体商贩1027人。1964年，“四清运动”中私营商业再次受到限制。“文化大革命”期间，在“割资本主义尾巴”的左的思想指导下，私营商业遭受严重限制直至取缔。
（二）个体商业
1979年3月，全国工商行政局长会议通过《关于对个体工商户进行登记管理若干问题的意见》中规定：有限度地批准非农业劳动者从事法律范围内、不剥削他人的个体劳动。1980年，全区个体商业零售额达702万元。1981年，国务院发布《关于城镇非农业个体经济若干政策性规定》和《关于广开门路，搞活经济，解决城镇就业问题的若干规定》，区内个体工商业发展速度加快。该年，全区有个体工商户4741户，从业人员5509名，营业额423万元。1983年区内个体工商户增加至23535户，从业人员增加到26057人，营业额增加至4075万元。同年，为保护个体劳动者的合法权益，巢县、庐江、和县、无为、含山等县成立了个体劳动者协会。
1987年8月，国务院发布《城乡个体工商户管理暂行条例》，个体经济发展更加迅速。1988年底，全区共登记个体工商户75265户，从业人员122142人，个体商业零售额达41757万元。1989年，巢湖地区个体劳动者协会工作委员会成立，维护个体劳动者的合法权益，加强对个体劳动者的教育，保证个体经济健康发展。
1990年，全区有个体工商户41667户，从业人员6.8万余人，个体商业零售额33205万元，占社会商品零售总额的18.7％。
二、公私合营商业
1955年，区内各县对私营商业进行社会主义改造。1956年底，和县、含山、无为、庐江、巢县共组成公私合营商业54家，由对口的国营专业公司领导，由公方、私方、职工等人员组成的店务委员会进行清产核资、折价入股、实行定息制度，并给私方人员以必要的工作安排。
人民公社化期间，私方业主受冲击，公私合营商业受到影响。1971年，公私合营商业先后转为国营企业，归并到国营商业的有关公司。
三、集体商业
（一）供销合作商业
民国32年（1943年），皖中行署成立了合作事业指导室，制定、颁布了合作社的组织章程、会计制度等，在乡、保、镇成立合作社，在区成立合作总社，用根据地生产的农副产品，特别是粮食，从敌占区或国民党统治区换回食盐、布匹、食糖等日用品及新四军第七师所需的军事装备，打破了敌、伪、顽对根据地的封锁。
1950年4月，专署合作总社成立，统一领导供销合作社、消费合作社和手工业合作社。该年，专区合作社收购额37万元，销售额174万元。1952年1月，区内有各类合作社90个，经营网点397个，职工1384人。占全区农户总数54％的农户加入了合作社，共拥有353251股。该年购进总额为866万元，销售总额为1019万元。
1954年，供销社与国营商业分工，县供销社在区设基层社、乡设供销站，承担除粮、油、猪以外的农副产品收购和农村居民的生产、生活资料的供应，并负责对农村私营商业进行社会主义改造。同年，县消费合作社划归国营商业领导。1955年手工业合作社单独成立专业机构，供销合作社主要负责农村商业工作。
1956年，私营工商业社会主义改造基本完成后，供销社逐步成为农村商品购销的主渠道。该年底，区内有县以上管理机构6个，兼营业务的管理机构63个，其它业务机构及网点871个（其中农村783个），职工3859名。国内纯购进额1269万元，国内纯销售额3862万元。
1958年，供销社并入商业局。
1961年，“国合”分家，供销社及其网点复设，人员得到充实。1965年，专署复设时成立专署供销合作办事处。供销社农村网点恢复到1956年的状况，国内纯购进额3820万元，国内纯销售额6886万元。1971年，供销社第二次并入商业局，1976年析出。
中共十一届三中全会后，供销社走上了健康发展的道路。1986年，全区供销社系统有管理机构54个，兼营业务的管理机构38个，其它业务机构和网点1328个（其中农村1155个），归口管理的“双代店”568个，有职工14071名。社会商品零售额22963万元。
1990年底，全区供销社系统有管理机构60个，业务机构和网点1352个（其中农村1182个），职工15822人，自有流动资金3773万元，固定资产净值8099万元，商品零售额36061万元。
（二）合作店、组
1954年春，庐江县城关镇率先成立文体、百货业合作小组及棉布业合作商店。随后，区内其它各县也成立了合作店、组。随着对私营商业社会主义改造高潮的到来，合作店、组不断增多。1955年庐江县已组成11个合作商店，巢县组成97个合作小组。1956年底，庐江、含山、和县、无为四县共组成合作店、组895个。1957年，巢县城镇成立合作商店144个，合作小组105个，和县私商大都组成了合作店、组。
1958年，各县供销社并入商业局，合作店、组亦进行了合并，属人民公社商业科领导。1959年，无为县有合作商店207个，合作小组213个。和县县城设杂货、棉百、饮食、服务四个合作总店。庐江县组成城关镇综合商店。1962年，对合作店、组进行调整，恢复了一些网点，销售额有所回升。
“文化大革命”爆发后，区内合作店、组减少。如巢县城镇，1957年有合作商店144个，到“文革”期间，仅存43个。
中共十一届三中全会以后，多种所有制商业并存，商品流通渠道增多。区内合作店、组增多，效益好转。
1984年后，为加强对合作店、组的领导与管理，庐江、无为、含山、巢湖四县（市）先后成立了集体性质的公司。1990年，全区农村集镇有合作店、组418个，人员6844名；城镇仍存少数合作店、组。
（三）知青商店
中共十一届三中全会后，区内一些国营、集体企业拨出少量资金，支持本单位待业青年开设知青商店，亦有少数待业青年自筹资金开店。1979年，庐江县商业系统组建26个单独核算的知青商店（组），安置待业青年606人；供销社系统安置570人就业，其中376人开设知青商店，200人组建合作商店36个。1980年，巢县有知青商店4个，37人，1984年发展到9个，93人。这期间其它各县也组建不少知青商店。1984年，根据巢湖行署（84）65号通知精神，区内知青商店转为集体企业，各知青商店职工同期转为集体企业职工。
四、国营商业
1949年7月，巢湖专署贸易公司成立，并在巢县、庐江县设贸易支公司。同年，巢湖专署专卖事业处成立。续后，无为、庐江、巢县、含山四县亦设立专卖机构，和县由工商税务局兼管专卖工作。
1950年上半年，撤销专署贸易公司，分设百货公司、土产公司和中国粮油食品公司。同年，还成立了中国盐业公司合肥分公司巢县分销处，不久更名为“中盐”巢县分公司，并在柘皋、运漕设分销处。1953年，各县先后成立了食品公司，主营生猪购销，兼营家禽、菜牛、菜羊、蛋、香肠等。50年代中期，专卖事业处更名为专卖公司；文体用品和纺织品一度从百货公司划出，分别成立专业公司，不久，又并入百货公司；各县还成立燃料、医药经营机构或公司。1958年，商业局和供销社合并，农村供销社下放给区、人民公社领导；国营、供销商业在城镇的网点实行合并，成立中心商店，属县商业局领导。
60年代初，国合商业分开。国营商业主要负责各县城关居民的商品供应，并在少数大镇设点批发或零售。供销社负责农村居民的商品供应，国营商业已在百货、烟酒、食品、食盐、医药、粮食、燃料、饮食、服务等行业建立了管理、销售机构。1962年，专卖公司更名为糖业烟酒公司。1965年，商业工作由专署财贸办公室分管。次年，专署物资办事处成立。1968年4月，商业系统各专业公司的业务，分别划归新成立的百货医药供应站、物资供应站、粮油棉麻供应站和农副土产采购供应站管理。
70年代初，“四大站”撤销。地区恢复了商业局、粮棉局、物资局，百货公司、食品公司、医药公司、五交化石油煤炭公司。1976年，地区五交化石油煤炭公司一分为三，分别成立了地区五交化公司、地区石油公司、地区煤炭公司。1977年，成立地区盐业蔬菜公司。1979年，成立地区糖烟酒公司。1981年，地区盐业蔬菜公司改称地区盐业公司。1982年，成立地区烟草专卖公司；成立行署蔬菜产销领导组，下设办公室。1983年后，商业系统经营管理机构变化不大。1990年，地直全民所有制商业有企业管理机构19个（其中14个兼营业务），企业经营机构61个。全区有零售网点23819个，商品零售总额53711万元，比1980年增长62.1％，比1985年增长52％。