一、长江航道
长江经江西彭泽流入东至县境，航道长85公里，跨越8乡（香口、临江、长岭铺、瓦垄、胜利、杨桥、新庭、庆丰）、2镇（东流、大渡口）、3港（香口、东流、大渡口港），流向安庆、池州港。县内港务航道3处，长约20公里，段辖内除长江主副航道以及几条支流小河外，还有境内香口河、尧渡河、黄湓河。这些河流堰坝多，水土流失严重，河床淤积，只能在洪水期通竹筏。段辖区主航道最小维护水深：枯水期为6米，一般水深可达15至30米，安庆至汉口常年不小于4米；航道宽度最小200米，一般均有400至500米。曲半径：最小为1100米，大多数超过比值。航标设置等级为一等。
二、内河航道
航道有4条，总长264.5公里，通航里程118公里。
尧渡河又叫前河，自长江东流河口进入，西南通香隅，东经仙人湖通长石湖抵尧渡，沿尧渡直上可抵青水源。全长79公里，宽100米。长江口（东流）至尧渡一段，过去滩险石多，航行困难。1956年经过疏凿、改河后，每年春、夏涨水季节，可正常通航，通航里程为22公里，属2级航道，通航能力为100吨级。香隅属七里湖平水4级航线，尧渡抵青水源航道为竹筏航线。
黄湓河又叫后河，长江黄湓河口进入，西通九都湖，南通鹅潭湖至张溪李干潭。常年有钢、木质船行驶营运和捕鱼，通航里程为61公里，属3级航道，通航能力为20吨级。潮汛期可抵洋湖。在40年代，木船可抵达杨树岭（今洪方乡），全长89公里，河湖宽50至5000米。黄湓至张溪属升金湖上下4级航线，张溪至杨树岭为特级航道。
香口河自长江香口河进入，北通双河口、断港河、邱子湖、仙人湖接尧渡河抵东流，涨水季节可抵香隅（1975年因改河不复存在），南通陶村、和潭、让溪抵新桥，全长30公里，宽70至5000米，属太白湖上下4级航道。香口河从太白湖下口闸至香口段航道通航里程为2公里，属3级航道。通航能力为100吨级，6至10月份可通航。
龙泉河位于县东南部，是通鄱阳湖的竹筏航线。1957年以来，森工部门疏竣河道多处，炸礁石2688米，渠蓄水坝闸176处，投资10.84万元，干河长66.5公里，有3级支流35条，通航里程33公里，流经县境大部分产材区。80年代以前，全县有80％以上木材由此河运往江西潼港，经鄱阳湖入江。