一、水系
颍沙河水系颍沙河，古称汝水。发源于河南省鲁阳县尧山，流经郾城与汝水合流，再东南流经淮阳、周口与颍水汇流，经界首自税镇乡陈渡口入境，经税镇、旧县镇、郑渡口至界牌集入阜阳。境内全长40公里，流域面积330平方公里。流入诸水：右岸有白洋沟、太临河。左岸有仓沟、万福沟、柳青沟等。
茨河水系茨河，古称细水。发源于河南省太康县与淮阳县交界处，在河南省称黑河。到张胖店入县境，始称茨河。流经清浅、双庙、张册店、斤沟、名利、原墙、关集等地，至高沟出县境入阜阳达茨河铺入茨淮新河。县境内全长71．5公里，流域面积1009平方公里。流入诸水：右岸有谷河、北八丈河、凤皇沟、大王沟、南洛河、芦草沟、皇姑河、港沟、改沟、解放沟、魏沟。左岸有宋塘河、柳沟、响沟、青阳沟、古旧沟、鱼鳞沟、巩马沟、红莲沟、黄沟等。
西淝河水系西淝河，古称夏淝水，系本县与毫州、涡阳、利辛分界河。今上游起自太、毫交界处淝河口，向东南流经龙德寺，沿太和边境出刘大湾村，入利辛至凤台峡山口入淮河。县境内长22．5公里，流域面积518平方公里。流入诸水：右边有苗原河、北白玉沟、南白玉沟、大武沟、北皂沟、南皂沟、大白玉沟、芦草沟、天泉沟。左岸属邻县。
二、地下水
县内40米深度以内的含水层可分为全新统中段和全新统下段两个含水段。全新统中段主要分布在李兴、倪邱、三堂一带；全新统下段主要分布在宋桥、许寨、金庄、原墙、三堂、关集等地。地下水的盐度小于5毫克当量／升，碱度不超过4毫克当量／升，矿化度0．5克／升，属低矿化淡水。
埋深10米以内的潜水温度受气温影响明显，一般年初岁末为14℃左右，7月8月为17℃至18℃，年变幅3℃至4℃。水位变化由于受降水和蒸发影响，全年变化过程呈双峰曲线：3月上旬以前雨量少，出现一次波谷，水位埋深2．9米左右。3月下旬至4月初，降水量增加，水位上升，形成一次波峰，水位埋深2．2米。5月至6月中旬雨量少，水位下降，又形成一次波谷，水位埋深3．2米左右。6月下旬至7月降水量聚增，出现最大波峰，水位埋深1．2米左右。8月份以后降水量减少，水位逐渐下降，埋深3．3米左右。最大变幅1．9米左右。
全县总蓄水库容5481万立方米，其中沟、河闸坝蓄水4177万立方米，水塘蓄水1304万立方米。经多年测量，平均年径流深度200毫米，年径流量3．79亿立方米。客水径流量：颖沙河从1951年至1970年测得平均年径流量为48．82亿立方米。茨河1955年至1958年测得平均年径流量为282亿立方米。主要河道径流量丰水年与枯水年相比变化大，少数枯水年部分河道断流，水利资源利用率较差。
40米深度以内的地下水静储量40亿立方米，调节储量1．2亿立方米。作为灌溉用水，丰水年余2．34亿立方米，平水年亏0．81亿立方米，枯水年亏3．56亿立方米。枯水年份，调节储量不能满足农业灌溉的需要，在地表水用尽时，可动用小部份静储量，但必须待地下水恢复到历年变幅最小水位后才能继续开采，以免发生“地下漏斗”，影响地下水平衡。
流经县境的颍河、茨河上共建有3个水位站，即颍河太和水位站，茨河关集水位站、茨河倪邱水位站。据太和水位站1955年4月至1956年12月观测：颍沙河平均水位26．05米；1956年8月8日最高水位33．56米；同年8月24日最低水位24．00米。1975年8月，河南省驻马店地区发生特大洪水，太和水位站自8月6日至8月24日连续18天测得颍河最高水位34．77米，为历年最高水位。关集水位站自1943年至1985年观测38年份，测得茨河历年最高水位为1957年7月22日的32．83米；最低水位为1953年10月14日的24．01米，并测得茨河1956年全年径流量8．758亿立方米。
县境内诸小溪流，源短流急，集流时间短，暴雨时易成涝灾，枯水季节易成旱灾。