民国27年（1938）5月，萧县沦陷。为了抗日保家，人民纷纷组织看家队、联庄会。中国共产党在统一战线旗帜下，利用政权力量把这些队伍改造成为抗日民兵自卫队。其组织形式是，村设小组，乡设中队，区设大队，山县总队统一指挥。到民国28年底，本县共有游击小组101个，基干队员3385人。民国30年春东撤后，根据地缩小，人数大减。
民国33年秋，新四军西进，恢复萧宿永根据地，民兵队伍不断壮大。次年，全县民兵16050人，其中基干民兵9630人，长短枪2140支。
建国初期，仍采用区、乡、村三级民兵组织形式。到1956年，全县民兵44583人，其中基干民兵20377人。1958年，在毛泽东“大办民兵师”的号召下，建立了庞大的民兵组织，最多时，全县有3个民兵师，20余万民兵。1962年以后，对民兵组织进行整顿，纠正了名不副实的状况。“文化大革命”初期，民兵组织遭受破坏。1971年，根据战备工作需要，组建了萧县民兵独立团。计有32个连、107个排、4594人，配发了武器。此后，又分别于1975年、1980年、1981年进行三次较大的整顿。1981年缩小了民兵组建范围，由过去16—45岁改为18—35岁。其中基干民兵为18—28岁。
调整后，普通民兵营625个，民兵排4871个。基干民兵营10个，基干民兵连78个，基干民兵排594个。民兵总数为108924人。1982年，又把民兵制度和预备役制度结合起来，全县一类预备役1284人，二类预备役3850人，以后，每年春都进行民兵整组，较好地做到了民兵工作“三落实”（政治、组织、军事）。1984年，民兵总人数97805人，基干民兵连25个，基干民兵17362人。