清至民国，本县无工商管理机构。工商户开、歇、转业向商会申报，开业者，按时交纳会费，定期参加同业议价，政府不予置问。
本县商会成立于光绪三十二年（1906），是徐州8县成立最早的商会。商会的职权比其它群众团体大得多，除会长外，还设有会计、文书、商警，商警配有武器，负责维护商店安全和秩序，并协同催交会费。除商会外，私营工商户还有同业公会、同乡会，如山西人来本县做生意的很多，县城设有山西会馆，厨师业、泥水业也组织自己的同业公会。民国7年（1918），成立管理工商业的附属权力机构——公断处，专门解决经济上的纠纷。萧县沦陷后，宣告解体。日伪统治时期，于民国29年成立商会，抗战胜利后，国民党政府于民国36年成立商会，但很少开展活动。
民国37年8月，解放区县民主政府设立工商税务局，负责税收、管理市场、办理工商企业的开业和停业登记。建国后，1950年设立工商科，之后，工商科撤销，在商业局内设商政股，业务延续。1976年设立工商行政管理局，为工商行政综合管理机构。