一、地表水
宿州市的地表水，主要来源于大气降水。建国后的30多年间，市辖区年平均降水量为904毫米，产水量为1.25亿立方米。但时空分布不均，年际变化大。年内6～8月降水量占全年降水量的50～60％左右。多年平均径流深265毫米，年径流量0.37亿立方米。年平均蒸发量1159.7毫米，蒸发损失量为567毫米，折合0.79亿立方米。现有河塘沟渠总面积约4500亩，总水量800～1000立方米。
天然状态下，地表水的化学成份稳定，P值在7.5～8.5之间，总硬度在8.5～12.5之间，均在正常范围内。但是，由于工农业生产的迅速发展，城市污染源大量增加，水质受到严重污染。据1985年对枯水期的新汴河（采样点七里井）、沱河（采样点东关闸）、运粮河（采样点橡胶厂）采样化验分析，其溶解氧每升分别为10.90毫克、10.60毫克、0毫克；化学耗氧量每升分别为4.94毫克、7.02毫克、592.47毫克；五日生化需氧量每升分别为1.80毫克、5.70毫克、303.12毫克；亚硝酸盐氮每升分别为0.012毫克、0.020毫克、0.015毫克；硝酸盐氮每升分别为3.14毫克、3.60毫克、1.44毫克；氨氮每升分别为0.03毫克、0.03毫克、4.17毫克……。新汴河和沱河河水水质尚可，符合国家三级水标准，运粮河水则污染严重。
二、地下水
市境内埋藏着较丰富的浅层地下水（埋深10米以下），静储量5600万立方米，调节储量2300万立方米。近年来，工农业生产年均用水量达1000万立方米。因此，在用水高峰期，尚显水源不足。浅层地下水主要靠降水入渗补给，一般每平方公里约14万立方米。地面下30厘米深处有2至6层粉细沙层，累计厚度为5～20米。地下水位1.5～2.5米。降水入渗率20～30％，地层给水度4～6％，年平均量每平方公里1.5～2立方米。其中降水入渗量占27，7％，河流入渗量占19.4％，灌溉回归入渗量占7.7％。开采状态下，旱年地下水位最大降低10米，或更深一些。地下水水质较好，完全符合国家规定的饮用水卫生标准（各项数据见《城市建设》章）。