民国三十五年（1946年），曾设县农业技术改良站，为时很短即撤。
建国后，科技工作经历了曲折的发展过程。1953年，县设农业技术推广站，1956年，农技推广站发展至5个。1961年，成立第一个农业科学技术研究所。1966年后，受“文化大革命”的干扰，科研机构及科技团体被撤销。1972年后始得恢复。1976年元月成立县农业机械研究所，1979年后，厂办科研得到发展，200人以上的工厂、企业相继建立科研所（室）；各公社也成立了科技小组及农科所。1981年10月，怀远县成立了全省第一家农村能源研究机构——怀远县能源研究所。至1985年，县级专业科研机构发展至4家，有专业学会15个，专业协会研究会3个；区、乡农技推广站81个，家畜改良站41个，取得科研成果126项，科技推广成果150项。
一、科研机构
农业科学技术研究所建于1961年，隶属县农业局，所址设荆山区瓦瓷岗，是我县第一个科研单位，现有职工48人，干部10人，其中科研人员7人；有科研基地185亩，水面20亩。进行良种引进、试验、示范和推广工作。初以研究粮食、油料作物为主，1979年转向黄、红麻等经济作物的引进、试验工作。1984年新增大白菜、番茄等蔬菜品种的试验。1963年，所科研人员撰写的《水稻栽培调查》获宿县地区科技论文三等奖；1964年研究的“山芋闷烟火炕育苗”技术，在地区范围内推广；1970年研究所派员到海南岛进行杂交高粱制种试验，获得亩产超百斤居全省第一的好成绩；1980年研究的“红麻短光照制种”技术获省科技成果三等奖；利用“土法”进行“小麦锈病的诱法鉴定”获得成功，撰写的论文发表在《安徽农业科学》杂志上。
农业机械研究所建于1975年，所址设老西门外山西路，隶属县农委，现有干部、职工11人。有C6136车床1台，B650牛头刨床1台，32K万能钻床1台。1975年进行农机具的配套试验；1976年试制扬场机获得成功；1979年与农机二厂合作研制LK—100A型22圆盘旋转开沟机获得成功，1980年通过省级鉴定。1983年研制成功加长旋耕机，提高了旋耕质量。
农村能源研究所建于1981年，初名“沼气研究所”，1985年改为现名。现有干部职工4人，负责研究开发农村能源综合利用的新途径，推广沼气池。1982年4月，研究成功混燃沼气发电，年底筹备研究纯燃沼气发电。1983年进行“太阳能热水器”、“太阳灶”的引进和推广。1984年进行“酒精糟液低温发酶制取沼气”的研究获得成功，获市科技奖；1985年5月，建成“纯燃沼气发电站”试车成功，获市科技奖。至1985年底，累计建沼气池4150个，改建“省柴灶”17万户，占总户数的91％。
石榴研究所建于1981年，有干部职工6人，其中工程师1人，农艺师1人，技术员1人。试验基地50亩，负责石榴名贵品种的提纯复壮，优良品种的繁育，病虫害的综合治理及丰产栽培技术的研究工作。
二、科学技术普及协会
1956年3月，怀远县科学技术普及协会成立，由17人组成委员会，协会配备专职干部3人，有会员251人。同时根据不同专业成立理、工、农、医、水利五个学组。1957年在农村中广泛发展会员，并建立科普组织，全县乡一级设科普委员会30个，农业社设科普工作组56个，发展会员1625人。1958年元月，召开第一次科协代表大会，选出县科协委员会，并在大队一级建立科普工作委员会432个，生产队建立科协工作组1039个，讲演站694个，发展会员22433人。1960年，县科协对下属会组进行组织整顿，成立了农机、建筑、理工、医、农、水利6个学会。1966年“文化大革命”时期机构撤销。1970年3月18月，县革委会设科技小组，配备3名干部负责科协工作。1978年8月18日撤销科技小组，恢复科协，与科委合署办工。1981年11月分署。至1985年共成立了医学、畜牧、农机、农学、林学、建筑、美术摄影、水利、外语、水产、财会、数理化、粮食、质量检测、企业管理、商学、化工等17个学会，有会员1004名。