顺治年间，县设千总一员，率兵70名驻防，县内上窑、龙亢二镇，各分兵15名防守，隶属寿州镇（今寿县）管辖。
康熙五十六年（1717年），县大庙增设一汛，兵卒4名驻防。
嘉庆二十四年（1819年），县设千总一员，兵卒64名。上窑汛外委千总一员，守兵14名。龙亢汛守兵9名，大庙汛守兵6名，上洪汛守兵6名配哨船1艘，新城口汛守兵5名配哨船1艘。
光绪二十一年（1895年），设淮河长字水师后营管带1员（职掌全营）驻扎县东门外。新城口、洛河街、大关分别驻哨官1人，兵卒9人，炮船1只。
光绪二十三年（1897年），县城守营设千总1人，在龙亢、上窑二汛各设外委千总1名。
光绪三十三年（1907年）六月，长字水师后营改编为巡防队北路八营左翼第三营，派管带1员驻怀远，有兵卒301人。