蚌埠防空机构始建于民国25年（1936年）10月。当时为防备日机空袭，分别成立省防空协会蚌埠支会和蚌埠防护团。防空协会蚌埠支会设宣传、设计、训练、总务4个科；防护团设总务、警备、警报、消防、工务、灯火管制、避难管制、交通管制、配给9个股和卫生组，下辖第一、二、三警区。每个警区下辖配给、工务、救护、避难管制、交通管制、灯火管制、警备、警报、防毒、消防等班。
太平洋战争爆发后，因蚌埠是伪省政府所在地，日伪军为防备盟军空袭，于民国33年4月在蚌组建省警防总团和市警防团，负责制定修改警报信号、强化灯火管制、圈划避难场所等。市警防团设宣传、消防、防毒、救护、灯火管制、交通管制、警备、警报、总务等8个班，成立国治街、中正街、中山街分团和水巡队。各分团下再设警报、警备、防火、救护4个班，并管理各自的警防段。民国34年抗战胜利后，国民党在蚌恢复防护团组织。
民国38年初蚌埠解放，2月，市成立防空委员会，负责指挥构筑防空阵地，布设警报音响装置。建国后1950年3月，在台湾国民党飞机轰炸蚌埠后，市成立防空治安委员会，负责加强防空治安管理。朝鲜停战后，局势缓和，市防空业务转由市公安局代管。1962年，在台湾的国民党势力企图窜犯大陆，形势紧张，市防空委员会重新组建。“文化大革命”开始后，市人防机构不能履行职能。1969年，苏联在中国珍宝岛制造事端，为防止敌人突然袭击，市采取条块结合、以块为主的形式，组成市、区、片和基层单位的四级人防领导小组。同年12月，市人防领导小组下设办公室。1982年，市人民防空领导小组改为委员会，仍下设办公室，分政秘、工程管理、指挥通信、财务物资等科，至1984年，增加设计室、通信站、工程处等。1985年，市人民防空委员会辖东、中、西区人防委员会。此期，蚌埠铁路分局亦设有战备办公室。