一、中医沿革
淮南中医学的发展受北“华佗”、南“新安”的影响，学术水平较高，名医辈出。如清末民初，高皇、龚集有段小楼、常九香、陈修亭3位名中医，以精堪的医术造福乡梓。
30年代，淮南常少九（妇科）、方静轩（内科）、郭舜钦（内、妇科）、焦良臣（儿科）、沈子卿（内、妇科）、苏五（外科）、樊伯芹（内、妇科）、魏冶溪（温病）、唐福舟（内科、温病）、王鸿彬（内、妇科）、倪平佛（内科）、陆超贤（内科）、卢静轩（针灸）、杨俊亭（妇科）、石莲开（内科、针灸）、耿志远（内、妇科）、金芸阶（内科）、谢子宣（针灸）、李雪逵（内科）、祝华宇（痔瘘科）等中医师影响较大，陈修亭、陆超贤、唐福舟、耿志远、李雪逵等人有著作流传于世，推动了淮南地区中医学术水平的提高。
1950年，淮南市成立了卫生工作者协会，协会组织中医中药人员学习业务、交流防病治病经验。1953年先后将民间个体中医、中药人员组织起来，陆续成立了集体所有制的联合诊所，承担起卫生宣传、医疗保健、防治疾病等工作。1955年组织医务人员学习中医政策，批判和扭转歧视中医的错误观点。同年，全市抽调部分个体开业中医人员到各级医院工作。陆超贤被安排在市卫生局，担任中医领导工作。
1956年，市、矿医院及各区医院也相继成立了中医科、针灸科。1959年成立了市中医门诊部，除了日常医疗任务外，还担负全市的中医温课和培养中医党员任务，全市有80名中医参加了温课学习。“文化大革命”期间，市中医门诊部被撤销，人员被下放，中医事业受到挫折。1985年市中医院开诊，有病床100张。是年，全市有中医师201人，其中主任、副主任中医师2人，主治中医师9人；中药师22人，中医士137人，中药剂士88人，其它中医24人，中药剂员101人，总计573人。1986年5月，筹建市痔瘘专科医院，是华东地区唯一一家痔瘘专科医院。
50年代开展西医学习中医工作。70年代曾举办过3期学习班，共计135人参加学习。80年代，全市中医药人员继承和发扬祖国医学，活跃学术气氛，开展学术交流，整理了名老中医医案，参加了多种形式的学习班和学术会议，素质普遍得到提高。
二、中医著作
建国后，著名老中医打破保守观念，纷纷公开家珍，著书立说。1962年著名老中医陆超贤写成《医学三字经白话解》，1982年又写成《用药撮要》一书由卫生局编印。1963年，由市科协、市卫生局联合编印了《陈修亭医案》。1973年市科协、市卫生局编印了《淮南中草药剂改科研展览会汇编》。1974年，市卫生局编印了郭金品整理的《淮南中草药名录》。1979年，谢三矿诊所老中医耿志远的医案著作《耿志远医案》，由市科协、市卫生局编印出版。1987年，老中医唐福舟的医话、医案、医论等综合性医学著作《唐福舟医验荟粹》一书，由安徽科技出版社出版，全国发行。同时，广大中青年中医师认真学习前辈先贤经验，并有所创新，先后在全国各级杂志上发表论文数百篇。
三、中西医结合
1955年开始，市、矿医院组织部分西医学习中医著作和临床经验。1971年，市卫生局举办了第一期中医学习班，学期6个月，一批西医离职学习。1972年，又举办第二期为期6个月的中医学习班。1978年，市卫生局又在新庄孜矿医院举办第三期中医学习班，时间为9个月。三期学习班共有学员135人，其中内、妇、儿、外等科主任、主治医师，高年资医师占绝大多数，起点较高、成绩较大。此外市一院等较大的综合性医院也自办了短期中医学习班。
中西医结合治疗疾病取得显著疗效。1958年，首先在外科开展了针灸治疗肠梗阻、阑尾炎，中药治疗胆道蛔虫症，柳枝接骨术，并获得成功。运用麝香玉真散灸烤疗法治疗破伤风，病死率由原来的60％以上，下降到20％以下。1971年，市第一期中医班学员采用针拨白内障，以百部止咳糖浆治疗老年慢性支气管炎，用宫外孕1、2号治疗宫外孕，大黄、地榆粉治疗烫烧伤，以及中西医结合治疗痔瘘等，都取得了显著效果。市第一期西医学习中医学习班结业时，全体师生合作编写了《中医学基础》一书，得到省内外医学界的一致好评。1978年多家医院开展了针刺麻醉，头电针治疗脑血栓。1981年第一矿工医院谢光箕参与研究的“十四经络感传线路研究”，获卫生部乙级科技成果荣誉证书，1983年在意大利天然医学会议上获金牌。市中医院妇科开展的中西结合治疗不孕症的研究取得了进展，矿职防院开展了中药防治尘肺并发症的研究。与此同时，中医药人员自觉地学习西医知识以充实自己，并运用于临床。在中医辨证之时，常参考西医的病名以辨病，施以中药多取得意想不到的效果，50年代，李雪逵以“丑牛散”治愈肠梗阻；唐福舟以活血化瘀法治愈宫外孕；耿志远以大半夏汤治疗食管癌；倪平佛自创银翘白虎汤治疗热症等等。1985年成立了市中西医结合研究会，使全市中西医结合研究更为普遍。