一、太平军
1854年(清咸丰四年)1月，太平天国护国侯、春官丞相胡以晃派兵驻守三河。次年10月，太平军将领蓝成春率部4000余人驻防三河，在河北岸筑大城一座，长约1里，宽约半里，环河建砖垒9座，凭河设险，屯积粮草军火，接济天京、庐州(合肥)。11月10日，庐州为清军所陷，太平军退守三河。1856年9月，三河陷落。次年2月，太平军复克三河，由将领吴定规率兵镇守。
二、清军
1856年(咸丰六年)9月，清将和春率部攻陷三河，派嵩瑞领兵驻守。稍后，改派参将图克坦布驻守，有兵勇1000余人。
1858年，太平军攻复庐州，署安徽巡抚、布政使李孟群军溃退至肥西官亭、长城(今长镇)一带驻扎。
三、民国军队
1931年(民国20年)4月，陆军第四十六师二七二团二营驻金桥，三营驻官亭。9月，第五十五师1个旅驻官亭。
1932年5月，陆军第三军由六安县苏家埠溃退到肥西南岗一带驻扎。
1938年4月，皖北人民抗日自卫军第二路军指挥部在下塘集成立，指挥官李武德，下辖7个支队，约1.2万人，其中一、二、三、七等4个支队分别驻守肥西防虎、官亭、南岗、高刘等乡镇。稍后，第二路军指挥部移驻高刘集。次年春解散。
1938年5月，陆军第一九九师驻四十铺、南岗，师长罗树甲。6月，第一三八师四一二旅驻聚星集，旅长龙炎武，四一四旅驻金桥，旅长郭少文。第一七二师五一六团驻高刘集。第五战区第八游击纵队驻长镇、高刘集，司令季光恩。第十三游击纵队驻杨小圩，司令黄司岳。安徽省保安第五团驻四十铺。此间，民国政府驻肥西部队逾3万人，以阻止日军由合肥向大别山进犯。
1947年12月，陆军第四十六师、安徽省保安司令部第一、二、六团进驻肥西，占领乡镇，控制交通要道，对革命游击队“清剿”、“扫荡”。
四、人民军队
1940年1月，新四军江北游击纵队二营驻肥西，镇压汉奸，开辟抗日游击区。同月，新四军江北游击纵队直属大队在烧脉岗成立，朱仰仙任大队长，下辖3个中队，近百名队员，长短枪70多支。3月底，二营及直属大队撤离肥西去舒城县。
1941年6月，新四军第六旅十八团四连驻肥西西北地区，开展抗日游击战。次年6月，以四连为基础，收编当地抗日游击队，成立淮西独立团。
1943年秋，新四军第七师独立连便衣队30多人驻二十埠老母猪地，组建抗日武装。次年1月撤离肥西。
1949年1月25日，人民解放军华东警备六团二营进驻三河。2月，人民解放军第三野战军先遣纵队某部驻三河。3月，陆续开赴长江以北一线待命。7至8月，人民解放军合肥城防司令部一营、巢湖军分区三营、皖北军区警备一旅二团进驻本县清剿武装股匪。同月，巢湖军分区基干团2个营、庐江县独立团及三河市大队各2个连、无为县大队1个连，组成剿匪指挥部，负责巢湖地区剿匪工作，指挥部设三河市。
1967年4月24日，人民解放军四一六部队进驻肥西“支左”。5月12日，肥西县军事管制委员会成立，孙伯英任军管会主任，人民解放军六四0八部队某部驻县，对肥西实行军事管制。次年8月10日，撤销县军事管制委员会，军管部队陆续撤离肥西。
1970年3月，人民解放军安徽省军区某部驻县，实行“三支”(支左、支工、支农)、“两军”(军管、军训)。1973年撤离肥西。