解放前，合肥县的科技事业几近空白。
解放后，在党和政府的领导下，合肥市的科教事业迅速发展。50年代末，随着安徽农学院、安徽大学、安徽医学院、合肥师范学院及11所中等专业学校的先后建立，自然科学、工程科学、农业科学、医学科学等门类迅速增多，学术水平很快提高；半导体、自动化等新兴技术开始兴起；各类科研机构相继建立，其中有首批建立起来的市属科研所8个，从业科技人员300多名。为了进一步促进科学技术事业的发展，党和政府分别于1958年和1959年在合肥历史上首次建立了安徽省科委和合肥市科委，从各方面加强科技管理工作，推动科学技术与工农业生产相结合。工业上成功地研制出高精度大型矿物分离机，及安徽省第一台轮式小型拖拉机，生产并出口Y型翻斗车。在发展传统农业技术的基础上，逐步实行科学种田和使用新式农机具，使农作物的品种增多，产量不断提高。医学实行中西医结合、基础医学研究与临床医学研究结合、传统医学与新兴医学结合的方针，不断开辟医学科学新领域，提高了医疗技术水平。
70年代初，中国科技大学迁建合肥，合肥通用机械研究所、合肥水泥研究院相继建立，省、市属科研机构发展到30多家。1978年，中国科学院合肥分院建立，成为中国科学院除北京、上海以外的又一个基地，尤其是超导托卡马克装置的建设和顺利运行，为在合肥建立科教城奠定了基础。80年代初，电子工业部第16所、38所、43所相继迁建合肥。1982年6月，国务院在合肥市总体规划的批复中明确指出“合肥是全国重要的科教基地”。1986年，合肥国家同步辐射实验室胜利竣工，更使合肥的科教基地建设初具规模。
为了把科技优势和经济建设结合起来，真正发挥科技第一生产力的作用，合肥市政府专门制定了12条措施，对从事科技开发的单位实行有偿合同制，促进科研单位、大专院校和企业实行多层次、多形式、多渠道的科技协作，并成立了科技经济协作办公室，专门为科技与经济联姻牵线搭桥。至1987年，全市紧密型半紧密型的科研生产联合体有36个。技术市场的开放，加速了科技成果商品化的步伐，与此同时，涌现了一大批科技咨询服务机构。随着技术市场的日趋活跃，民办科研异军突起，成为合肥科技事业发展的一支生力军。
科技的进步，新技术、新工艺、新产品、新材料的大批出现，大大提高了工业、交通、通讯、城建和国防建设的现代化水平；农业科研能力的提高、农业技术推广体系的形成，系统工程的应用，加快了农业现代化的速度；新医、新药、新的医疗技术设备，在防病治病，提高医疗技术水平，保障市民健康方面，发挥了积极的作用。1986年，国家同步辐射实验室二百兆电子伏特直线加速器的一次出束成功，标志着我国在同步辐射方面的研究已经达到世界先进水平。肥东县人民医院研制的AH1型肠减压器，在1988年第33届布鲁塞尔尤里卡世界发明博览会上获得银奖。合肥电机厂研制的QKSG1200千瓦高压潜水泵获国家科技成果奖。“黄牛面革草酶脱毛”等14项成果获全国科学大会奖或国家科技进步奖。荣获1989年度国家科技进步一等奖的异步电动机分层多目标优化设计软件，可覆盖80％的异步电机软件，设计速度比人工设计提高2～3万倍。合肥还有全国最大，全世界只有两台的直流脉冲机组。中国共产党十一届三中全会以来，合肥市获得市级以上奖励的科技成果共1824项，有98项科技成果获全国科学大会奖，202项成果获安徽省科学大会奖；257项成果获合肥科学大会奖。1978～1990年间，合肥市共获省级奖励科技成果622项，获部委级奖励科技成果214项，获市级奖励科技成果431项。
1990年，合肥市已拥有各级各类科研院所数百个，其中中央及部属12个，省属80个，市属23个，民办科研机构200多个；涌现出一大批厂办科研所和专业技术学会、协会、研究会。从事自然科学的人员有8.6万余人，其中具有中级以上职称的4万余人。37所高等院校(其中普通高校10所，成人高校25所，军事院校2所)的科技活动在合肥地区科技发展中占有相当重要的位置，高校雄厚的科技实力形成了合肥突出的科技优势。
40多年来，合肥市的科学技术事业，从无到有，从脆弱落后发展成初具规模的现代科学技术体系。不仅拥有一支攻坚能力较强的科技队伍，拥有一批实力较为雄厚的基础研究、应用研究、开发研究机构，而且还拥有一套科技学会、科学普及、科技情报、科学器材、计量测试和技术市场等管理服务系统。合肥市已被列为全国四大科教基地之一。