合肥市位于南淝河中游。南淝河东支板桥河汇水面积177平方公里，中支四里河汇水面积185平方公里，西南南淝河正源汇水面积244平方公里。南淝河正源与中支四里河、东支板桥河分别在水西门外和东门外凤凰桥汇合，至施口注入巢湖，全长70公里。亳州路桥以西为上游，长38公里，河底宽10米；亳州路桥至屯溪路桥为中游，长5.5公里，河面宽60～111米，河底宽20～30米，河底高程5～7米，河岸两旁道路高程10～20米；屯溪路桥至施口为下游，长26.5公里，河底宽30～80米，可终年通航300吨以下轮船，是市区与巢湖相连的唯一水上通道。
南淝河、四里河、板桥河在市区上游，呈扇状分布，由于地面覆盖相同(丘陵岗地)，流域比降一致(约八百分之一)。上游水到市区仅40公里，每逢暴雨，汇水迅速，源头洪峰到达市区仅一天左右，水位涨幅3～5米。洪水来势猛，流量大，涨落快，且河道行洪易受巢湖、二十铺河顶托，给市区带来水患威胁。南淝河在合肥市段洪水安全水位为11.5米，河床安全汇洪量为400立方米／秒。
据史料记载：合肥地区自公元前122年至1984年，共发生水灾156次，其中大水灾62次。新中国建立后至1985年，合肥市受洪水袭击，成灾10次，其中大灾4次。
易遭受洪涝的地区多发生在水西门外、双岗街东北、明光路、裕溪路、三里街及二里河、省体育场一带，还有老城区东大街(今淮河路东段)、逍遥津及杏花村等地区。这些地方地势低洼，地面高程大多在12～14米之间。民国20年、1952年、1954年，合肥城东门外洪水位都在13.34～14.7米之间。历来老城区仅借助老城墙及东、西水关的简易插板闸抵御洪水侵袭。由于城外水位高于城内水位，而城内雨水又得不到及时排出，因之受到洪涝灾害的双重威胁。
新中国成立后建设部门结合城市基础设施、航道、水利建设，对市内几条河道多次进行清障清淤和疏浚。在市区上游兴建大型蓄洪工程，在市内沿河道及低洼地区建防洪堤、墙、闸、排涝泵站，初步建成蓄、排、拦防洪设施体系。至1985年，城市防洪能力已达20年一遇的标准。
蓄洪工程
1955年8月，省市确定在合肥市区上游南淝河正源兴建董铺蓄洪水库。1955年12月，中共安徽省委正式批准成立董铺水库工程筹备委员会。1956年9月28日董铺水库工程指挥部正式挂牌。同年11月董铺水库破土兴建，1958年12月竣工。
董铺水库位于合肥市区上游，距市区7公里。坝址建在南淝河正源两侧高岗之间，汇水面积207.5平方公里，占合肥市淮河路桥以上流域面积606平方公里的34.2％。水库设计按苏联国标二级水工建筑物百年一遇的质量标准。水库溢洪道被建在大坝以北900米处的天然凹口。其地面高程为32.6米。下为一凹冲，冲长4500米。溢洪道出口接南淝河正源老河道，按百年一遇不溢水的标准建成。建成时库容量达1.72亿立方米。
自1959年至1985年，董铺水库经历了续建、保坝、加高加固等工程，累计完成土方234.6万立方米，石方9.121万立方米，钢筋混凝土0.433万立方米。1985年库容量增加到2.42亿立方米，防洪效益占全市44.7％。
1958年，大房郢水库破土动工。坝址位于南淝河支流四里河上的大房郢附近，距合肥市区8公里。水库汇水面积179.25平方公里，占南淝河市区以上流域面积606平方公里的29.6％。设计水库建成后，汛后控制水位为28.8米，库容量为1.812亿立方米。工程开工后完成土方37万立方米，因遇三年自然灾害而停工。
60年代末至70年代初，市水利部门在城北15～20公里地带开挖从肥西县将军岭经千古庙、双墩至王岗的滁河于渠，沿着干渠兴建了泗水、梅冲、蔡塘、张桥、三十头、大官塘等6座中小型防洪、农田灌溉综合利用水利工程。1984年汛期，合肥地区降大暴雨，蔡塘、梅冲、张桥、大官塘、三十头等水库，计拦、蓄洪水4000万立方米，使合肥市受灾程度减轻。
防洪设施
1954年秋，建设部门结合东环城路建设，加高加固大窑湾桥北至淮河路桥路堤，使堤石最低高程超过夏季淮河路桥最高洪水位1.3米。1955年，合肥矿山机器厂为保护工厂不受洪水侵袭，沿河筑了一道防洪墙。1957年整修南淝河老河道东岸长1651.5米土堤，使其上游接南侧防洪墙，下游在铜陵路接郊区堤防。整修后该堤顶宽3米，高程13.5米，内外边坡比1∶1.5。1964年建设部门利用拓建板桥河出口段的工程余土，建板桥河下游东岸和南淝河东北岸的防洪土堤，使其上游接淮南铁路正线路堤，东岸跨明光路至炉桥，再沿新开的板桥河口东岸至双河村高岗地。该堤长1235米、宽5米，堤顶高程高于淮南铁路堤顶14米，内外边坡比1∶1.5。1980年7月，因洪水漫过此堤成灾，市防汛抗旱指挥部城市组立即组织动员全市军民抢修，将土堤从双河村高地延伸到淮河路桥东(总长2080米)。抢修后的土堤，堤顶宽5米，堤顶高程14.5米，内外边坡比1∶1.5。1983年5月，在板桥河东岸兴建浆砌混凝预制块防洪墙两段(长954.5米)；在张洼路至明光路桥南旁兴建防洪土堤一段(长225米)。1984年10月至次年7月，又在市区南淝河段及板桥河下游新建浆砌块石防洪墙4.4公里，使南淝河东岸上游自茅四拐到唐桥闸长7.66公里防洪堤墙因首尾贯通，而成为市东部抵御洪水侵袭的一道屏障。继1955年北门、东门2座防洪闸建成之后，1956～1983年先后在包河、池郢、双河村、矿机、唐桥、李圩、凤凰桥和张洼等地建了8座防洪闸，在屯溪路巫家湾、明光路防洪墙处建了6道插板式通道防洪闸。利用这些闸，可以防止洪水倒灌。
1990年合肥市防洪闸一览表

排涝泵站
合肥市地面高程起伏较大。老城区地面高程为22.3～12.9米，安庆路以北、淮河路东段、逍遥津、杏花村和省委对面一带地面高程为14.4～12.9米，东市区和东工业区地面高程为28.5～10.9米，明光路和三里街一带地面高程为13.36～11.4米。为使以上地区不受内涝灾害威胁，建设部门结合城市防洪堤、墙、闸的建设，于1964～1984年分别在上述地区建了一批排涝泵站。
1964～1967年，先后两期兴建杏花村排涝泵站；计装机共6台，总容量为4.2立方米／秒。1969～1984年，先后增建扩建逍遥津、矿机、双河城、唐桥、明光路、池郢及凤凰桥等7座简易应急排涝站；装机共25台，其中电动机15台，柴油机10台，总容量为9.58立方米／秒。
逍遥津泵站：负责排除长江路、省委办公楼至淮河路、逍遥津公园一片低洼地内涝。排水能力为4立方米／秒。
矿机泵站：负责排除史家河流域低洼地区内涝积水。排水能力为12立方米／秒。
双河村泵站：负责排除火车站、水泥厂、交通厅、明光路一带低洼地内涝积水。排水能力为6立方米／秒。
唐桥泵站：负责排除铜陵南路、合裕路、省建二公司一带防洪堤墙以内低洼地内涝积水。排水能力为15立方米／秒。
明光路泵站：负责排除张洼路以南、淮南铁路以西一片低洼内涝积水。排水能力为6立方米／秒。
池郢泵站：负责排除和平路、合裕路、塑料厂、公交公司及矿机厂宿舍一带低洼地区内涝。排水能力为6立方米／秒。
凤凰桥泵站：负责排除滁州路、蚂蚁塘、金大塘、煤建公司等单位低洼内涝。排水能力为2立方米／秒。
以上7座泵站全部采用国内较先进的机电设备。总排涝能力为51立方米／秒，若按降雨量1961毫米，河道两岸低洼地带积水3672万立方米计算，只需20小时便可排出。
1990年合肥市排涝泵站一览表

河道疏浚
为了提高市区南淝河、板桥河、史家河及二里河的行洪能力，改善南淝河水上运输通道，1953年12月安徽省交通厅决定对南淝河进行疏浚。建设部门先从南淝河大王庙、巫家湾段开始，对旧河道进行裁弯取直，将新开河道衔接至南淝河大王庙、巫家湾上下游旧河改向处。改造的河道全长852.6米，河底宽20米，两岸迎水坡比1∶2。1955年
又在南淝河大王庙旧河改向的老河道上，新建一道拦河截流土坝，控制市区南淝河汛期洪水不进巫家湾低洼地区。为了解决明光路、火车站一带低洼地区洪涝灾害，1958年，建设部门对市区板桥河下游出口段进行裁弯取直，将原板桥河下游出口自明光路排涝泵站改向东北，两次过明光路，绕双河村过胜利路、蚌埠路、官德桥至凤凰桥入南淝河。改线后的新板桥河出口段，自明光路排涝泵站衔接上游老河道，经道士岗东边出口，注入南淝河。改线后的新河道，长540米，宽8米，河底高程6～8米，河道两岸坡比1∶1.5。因板桥河百年一遇洪峰流量为426立方米／秒，而新开的板桥河上游老河道是复式河床，河槽过水断面不超过90平方米，最小过水断面只有30～40平方米；又因暴雨时，新板桥河出口段左岸双河村地面高程为14～16米，右岸道士岗地面高程为15～18米，而新河道的出口段又在地面高程14米以下，过水断面仅120平方米，故达不到汇洪要求。为了提高板桥河出口段的泄洪能力，1962～1963年建设部门对板桥河出口段进行拓建，拓建后的新河道底宽15米，河底高程未变，河道两岸边坡比1∶2，河道过水断面为203平方米。为提高南淝河汛期行洪能力，1981年市政府组织动员全市党政军民对南淝河、二里河、史家河部分河道进行清障清淤，累计清挖土石3.67万立方米，清除阻水障碍50多处，拆除阻水建筑物46处，将二里河底宽由1～4米拓宽成10米，将史家河底宽由1.5米拓宽成6米，清除了南淝河大窑湾桥至长江路桥段的阻水河滩，整治了3条河道两旁的土堤。1985年组织动员全市党政机关、驻肥部队、大专院校和企事业200多个单位30多万人次参加劳动，清挖土石方和淤泥15万立方米，清除阻水树木2000多棵，清运垃圾3000余立方米，将南淝河市区段河道底宽由20米拓宽到30米，将其进水断面由不足300平方米拓到500平方米，使河道的行洪能力较原来提高1.8倍。随之又将板桥河道(自明光路桥至道士岗南边出口)，底宽由10米拓到20米，将其过水断面由原来的65平方米拓到140平方米，使河道行洪能力提高2.15倍。