一、处理工业污染
怀宁芝麻湖渔场所属三鸦寺湖，因受高河纸厂废水污染，失去养殖能力。1980年经地区环保站检测，水中氯化物含量达3636毫克／升、溶解氧1．053毫克／升、木质素400毫克／升、PH11．6，大大超过养殖水域水质标准。贵池秋浦河由于池州造纸厂、池州农药厂、池州烧碱厂、贵池农药厂有毒污水流入河内，水质恶化，鱼虾绝迹。1983年，经环保部门裁决，每年由污染单位向水产部门赔偿资源损失费千余元。
二、血防灭螺兼顾保护资源
区内滨江湖区为血吸虫流行区域。建国后，人民政府开展大规模灭螺工作，施用药物主要为氯酚钠。由于药物毒性大，且灭螺期和灭螺地点分别为鱼类产卵期和产卵场，对渔业生产危害较大。为此，地委血防领导小组与地区农林局于1977年联合发出通知，要求各地使用
五氯酚钠时应注意保护水产资源，严禁私藏药物，药量尽量减少，灭螺时尽可能避开鱼类产卵期和产卵场，确需用药时，应事先与水产部门联系。
三、珍稀动物保护区内江段是国家稀有水生动物白鳍豚的重要活动区域。1984年，全区连续发生4起捕杀白鳍豚事件。同年3月，安徽省发出立即制止捕杀白鳍豚的传真电报，省水产局亦发紧急通知，要求立即制止事态发展。有关部门对东至、宿松两县捕杀白鳍豚的犯罪分子绳之以法。1985年，建立了安庆地区保护白鳍豚工作委员会，以进一步做好白鳍豚保护工作。
1984年，省野生水禽资源考察组对升金湖进行考察，发现该湖有各种候鸟、留鸟共43种。1985年2月。华东地区联合保护鹤类及水禽协作组成立，研究制定了《华东地区鹤类及水禽联合保护条例》。同年，省批准在升金湖建立野生水禽资源保护区，范围包括升金湖全部水面和四周湖滩，并向陆地伸延一定地段，总面积50万亩，其中核心保护面积20万亩。