民国年间桐城、宿松等县设立渔团局，以便征收渔税。建国后为恢复和发展渔业生产，1951年安庆专署建设科设水产专管干部1人，1953年专署农业局设水产专职干部4人。1956年水产归地委多种经济委员会副业办公室管理，1959年成立地委水产办公室，工作人员增至13人。
1961、1964年曾两次成立专署水产局，但都先后撤销，只在专署农业局内增设一个水产股。1965年3月归财口，改属生产科。1965年5月因产销分开，水产公司仍属财口，而生产则归地区农业局生产股。1969年农口各局合并成立地区农业站，水产列入多经组业务。1971年恢复地区农业局，局内设水产工作站。1978年10月，水产工作站与水产公司合并，成立地区水产局。1980年池州地区并入，水产局人员增至22人，局内设政秘、生产、渔政3科，下辖地区水产公司、泊湖与升金湖管理委员会。1984年增设地区水产技术推广试验中心站。自1978年后，除岳西、潜山在农业局内设水产站外，其余各县相继成立县水产局。