区内常见鱼类病害约50余种，其防治措施因病而异。
肠炎病病鱼明显症状为肠道充血发炎，肛门外突红肿。青、草鱼最易得此病，死亡率高达90％。每年4～9月流行。采用生石灰清塘或用漂白粉泼洒，可预防和治疗此病。
烂鳃病病鱼症状为鳃丝腐烂，带有污泥。水温20℃以上开始流行，常和肠炎病并发。草、青、鳙、鲤等鱼都可发病。用生石灰清塘或用漂白粉、五倍子泼洒，可预防和治疗此病。
出血病病鱼症状为肌肉、口腔、鳍条基部充血，剥开皮肤可见红色肌肉。每年7～9月流行。草、青鱼易感染此病。目前除采用人工免疫疫苗注射预防外，尚无其它治疗方法。
水毒病患病主要原因是捕捞、搬运时操作不小心，擦落鳞片被毒菌侵入而引起的。病鱼症状为病变部位长白毛，水温18℃开始流行。用生石灰清塘，搬运时小心操作，可预防此病发生。
车轮虫病病鱼体内有车轮虫虫体。每年5～8月开始流行。用生石灰清塘，或用硫酸铜、硫酸亚铁合剂泼洒全池，或用苦楝树叶熬水喷洒，可预防此病。
锚头蚤病又称针虫病。病鱼体内有针状虫体，每年秋季流行。用生石灰清塘或用高锰酸钾溶液浸洗病鱼，或用敌百虫溶液喷洒，可预防、治疗此病。
大中华蚤病又称鳃蛆病。病鱼鳃部有虫体，形如蛆，危害草、青鱼。5～9月开始流行。用硫酸铜和硫酸亚铁合剂，或用敌百虫溶液泼洒全池，可治疗此病。