一、常见疫病
1、传染病牛传染病中有炭疽病、口蹄疫、狂犬病等。1954年宿松城关、程集、汇口等地先后发现这些传染病，死亡耕牛28头，在桐城杨桥、望江、枞阳等地也有发生。1953年在东至县首次发现牛出败病，死亡耕牛32头，宿松县也因此病死亡耕牛125头。1954～1955年在区内又发生此病，死亡耕牛76头。70年代后，政府督促兽医和畜牧科技人员积极努力防治，牛出败的发病率才显著下降，但未能得到根除。1983年，宿松县有60头耕牛发生此病，死亡42头。1984年东至发现此病的耕牛有49头，死亡28头。
在区内流行的猪的传染病主要有猪瘟、猪丹毒、仔猪副伤寒、猪溶血链球菌病、猪肺疫、猪水泡病等。1982年4～11月，岳西流行猪瘟，死猪12000多头。1983年，宿松县也流行猪瘟。1978年4月，枞阳县陈瑶湖、汤沟一带猪溶血性链球菌病流行，发病生猪80000多头，死亡20000多头，当年贵池、桐城两县也有此病流行。1979年宿松、望江也流行此病。猪肺疫在70年代前，各县均有发生。1953年，东至县流行此病，死猪4200头。1962年，全区各县都流行此病。70年代后，此疫才得到控制。猪丹毒和猪水泡病虽在各县流行，但防疫措施得力，发病率正逐年下降。
2、寄生虫病区内危害最大的为血吸虫病和牛锥虫病。血吸虫病建国前已在区内流行。60年代末，随着血防工作的不断深入，此病已显著减少。80年代耕牛锥虫病传入区内，1981年枞阳县陈湖区、普济圩区耕牛发病率较高。1982年贵池、东至、桐城3县也发现此病，1983年流入怀宁、望江，1984年遍及全区。其它寄生虫病还有：猪蛔虫病、姜片吸虫病、结节虫病、食道线虫病、棘头虫病、鞭虫病、绦虫病、类圆线虫病、细颈囊尾蚴虫病等；牛同盘吸虫病、新蛔虫病、肝片吸虫病、前后盘吸虫病、钩虫病、能捻胃虫病、螨病等；兔和家禽的球虫病、体表寄生虫病等。
3、普通病畜禽普通病有牛胃驰缓、瘤胃鼓气、瓣胃阻塞、风湿性关节炎、急性眼结膜炎、胃肠炎、关节脱臼等。猪感冒、胃肠炎、呼吸炎病、难产赫尔尼压等。至于家禽的普通病，区内比较少见。
4、中毒性疾病畜禽中毒性疾病，常见的有耕牛有机磷中毒、有机氯中毒、山芋黑斑病中毒、氢氰酸中毒、霉稻草中毒；猪棉酚中毒、菜子饼（硫代葡萄粮苷）中毒、亚硝酸盐中毒及体表农药中毒等；家禽主要见于农药中毒。
二、防治措施
建国初，仅有少数中兽医以祖传的中草药和针灸为家禽治病。1951年安庆地区成立家畜防疫站。秋季，皖北行署农林处兽医防治队来区内开展家畜防疫注射，注射疫苗有牛炭疽、牛出败菌苗。1952年注射猪瘟、猪丹毒、猪肺疫疫苗。同年，安庆家畜防治站改为畜牧兽医所，并成立兽医协会，会员300余人，初步形成了家畜防治网络，取得一定成效。1956年，省血防队来枞阳县长风乡开展血防试点。1958年，地区畜牧兽医所组织技术人员在宿松华阳河农场开展血吸虫查治，以后又到各县展开。当时治疗血吸虫病患畜主要使用锑剂，1964年改用血防“846”片剂。1973年2月改用“敌白虫”，1977年使用“硝酸氰胺”，1982年起改用“吡醛酮”。这几种家畜血防措施，在区内均取得一定的成绩。1978年省畜牧兽医站授予安庆地区“送瘟神先进集体”称号。
党的十一届三中全会以后，畜牧兽医工作得到恢复和发展。全区现有技术干部276人，集体性质的兽医1877人，基层兽医站266个。地区还建立了兽医化验室1座，桐城、宿松两县建立了县办兽药厂，各县家畜检疫站也先后成立。1987年，全区共有兽医卫生检疫员556人，卫生监督员52人。另外，地区还兴建冷库1座，并配有疫苗专用冷藏车；有8县配有活动冷库，1／4的乡兽医站配有冰箱。