一、野生动物
哺乳类有黄鼬（黄鼠狼）、野兔、野猫、鼠、褐鼠、刺猬、蝙蝠等。
爬行类有守宫（壁虎）、蜥蜴、赤练蛇、蚯蚓、乌风蛇等。
鸟类有喜鹊、麻雀、杜鹃、啄木鸟、猫头鹰、乌鸦、鹌鹑、斑鸠、凫（野鸭）、百灵、苍鹰、黄鹂、画眉、白鹭、雉（野鸡）、雕、鹰、灰喜鹊、山雀、练八哥、麻鹌子、告田子、燕子、黑卷尾（刺马叉）、黄莺、布谷、翡翠、云雀、地牯牛、灰鹤、喳喳儿、青雀、灰鹭等。
鱼类有鲫鱼、鲂鱼、黑鱼、龟、黄鳡、泥鳅、黄鳝、白鳝、鲤鱼、草鯶、西边鱼、鳙鱼、鲇鱼、鳗鱼、鳊鱼、鳜鱼、赤眼鳟、角牙、黄鲭、银鱼、鲖鱼、鳖、窜鲦、长吻鱼（淮王鱼）、针鱼、青鱼（黑鲲）、油鲇条、红鲤鱼等。
甲壳类有青蟹、土蟹、大白虾、麦虾、草虾、蚌壳虫、枝角类（红虫、水蚤）和桡足类属小型甲壳动物、河蟹。
贝类三角帆蚌、褶纹冠蚌及圆背无齿蚌、背角无齿蚌、河蚬、螺丝、田螺、蚬子等。
虫类蜈蚣、蜻蜓、蝉、蝴蝶、马蜂、蜘蛛、蝎、螳螂、土蚕、土鳖、黄蜂、蚂蚁、蝗虫、豆虫、蝣子、蟋蟀、蝼蛄、天牛、荧虫、天蛾、金龟子、叩头虫、牛虻、蝇、蚊、臭虫、放屁虫、水蛭、蚜虫、瓢虫、大草岭、隐翅虫、步甲、蚰蜓、丽草蛉、蚜蝇、棉卷叶螟、小造桥虫、棉蛉虫、红蛉虫、稻苞虫、姬蜂、赤眼蜂、松毛虫赤眼蜂、胡蜂、东在小花春、棉叶跳蝉、蓟马、黑盲绿盲春、大眼蝉长春、窄姬春、纤腰巴食蚜蝇、短翘刺腿食蚜蝇、黑带食蚜蝇、食蚜斑腹蝇。
其他有青蛙、蟾蜍等。
二、野生植物
马齿苋、蒌蒌菜、豆本菜、面条菜、竹节草、独草、泽蒜、荠菜、狗尾巴菜、地衣、木蛾、野木耳、米儿蒿、扫帚苗、富苗、鸭头苗、莞苇、王子草、大曲草、猪芽草、涩拉秧、菜巴亭、粘菜巴亭、马泡、天蓬、天茄、蒲公英、野葡萄、野西瓜秧、老鸹眼、托盘果、浮萍、水花生、绞股蓝、鸡矢藤、牛舌草、大耳棵、野枸杞、水芹菜、水芥菜、地角皮、莠稗、茴草、水藻、野菊、瞿菜、虎耳草、绣球花、苜蓿草、草木樨、铁苋菜、醉血草、羊不奶草、菟丝子、狗狗秧、马鞭草、臭牡丹、益母草、苍耳子、黄花蒿、青蒿、鬼针草、苦叶菜、鸭跖草、紫萍、鹅不食草、萱草、茵陈蒿、盘龙草、猪秧秧、黄莲草、癞肚皮稞、野胡萝卜、丁香蓼、洋麻、锦葵、土黄芪、蜀葵花、紫果各青、掐不齐、野蔷薇、地锦花、辣蓼、茭白、野水菱、斑鸠柴、水葫芦、白茅草、枸杞、枳子树、小蓟、莴蒲、半夏、小茴香、泽漆、紫苏、蒺藜、薄荷、匾蓄、牵牛花、栝楼、车前、野芝麻、野燕麦、牛毛毡、野赤豆、曼陀罗、夏枯草、透骨草、伸筋草、天南星、败酱草、酢酱草、金不换、旋复花、野扁豆、丕不留行、野绿豆、瓦松、艾、蓖麻、野桑等等。
以上所记仅是野生动植物。人工饲养的动物和人工种植的植物，将在农业、林业、渔业、牧业等章记述。这里所记的野生动植物，也不是阜南县的全部。据1984年的普查，全县野生植物中的药材达598种，动物中有148种，有待开发利用（见医药章）。
三、矿物
阜南县沿淮河段有数百万立方米的石英砂，是现代建筑的主要原料之一。